169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4207 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4207  BioY protein  100 
 
 		 195 aa  358  2e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  81.87 
 
 		 203 aa  251  6e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  58.24 
 
 		 191 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  57.23 
 
 		 200 aa  167  9e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  57.06 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2330  BioY protein  53.67 
 
 		 196 aa  153  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  52.07 
 
 		 197 aa  148  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  55 
 
 		 189 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  47.16 
 
 		 197 aa  134  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  49.42 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21370  hypothetical protein  48.52 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283174  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  45.76 
 
 		 197 aa  124  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  51.43 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2356  BioY protein  52.53 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  43.86 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  44.05 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0901  BioY protein  47.83 
 
 		 208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0144  BioY protein  42.86 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  43.71 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  41.33 
 
 		 184 aa  102  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  43.23 
 
 		 205 aa  101  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3745  BioY protein  32.62 
 
 		 190 aa  96.3  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421582  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  40 
 
 		 195 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  41.29 
 
 		 206 aa  95.5  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  41.24 
 
 		 205 aa  88.2  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  40.91 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2445  BioY protein  43.02 
 
 		 198 aa  87  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000283482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  39.43 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000844147  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  42.93 
 
 		 187 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  38.56 
 
 		 178 aa  85.1  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0995  BioY protein  38.86 
 
 		 215 aa  84.7  8e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3444  BioY protein  38.46 
 
 		 181 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  33.33 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  37.27 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  36.76 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  35.21 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  42.86 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  36.87 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  36.41 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  33.33 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  39.17 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  40.88 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1184  BioY family protein  38.86 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000330178  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  33.69 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0776  BioY protein  36.57 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.656127  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  35.29 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  36.05 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0506  BioY family protein  34.59 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.529292  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01740  hypothetical protein  46.72 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.770223 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  36.91 
 
 		 169 aa  70.5  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0509  BioY family protein  34.59 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  36.91 
 
 		 169 aa  70.5  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  31.08 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  39.74 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0693  BioY protein  33.52 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  35.2 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  32.17 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  40 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  31.82 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  35.64 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  37.27 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  31.87 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  32.32 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  31.13 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  34.44 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  36.17 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  30.46 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  40.76 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.583343 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2947  BioY protein  36.42 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  33.94 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  37.18 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  33.33 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2086  BioY protein  42.25 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00325943  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  32.88 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  41.89 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  37.99 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  29.24 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1924  BioY family protein  38.1 
 
 		 145 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  38.85 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  34.23 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  30.77 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  33.95 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  39.87 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  32.22 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  36.63 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  35.29 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  34.9 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1496  hypothetical protein  30.52 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.41192 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  32.52 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  37.04 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  31.36 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  34.44 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0638  BioY family protein  30.19 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.532905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  34.01 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  42.98 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  34.85 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000014315  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  36.29 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  33.78 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  34.01 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  34.51 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>