More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4189 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4189  chloride peroxidase  100 
 
 
257 aa  524  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.766696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0621  alpha/beta hydrolase fold  89.14 
 
 
277 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3996  alpha/beta hydrolase fold  89.59 
 
 
277 aa  403  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4821  alpha/beta hydrolase fold  91 
 
 
277 aa  393  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3804  alpha/beta hydrolase fold  72.17 
 
 
294 aa  305  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3228  alpha/beta hydrolase fold protein  74.18 
 
 
278 aa  301  6.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1384  alpha/beta hydrolase fold protein  61.88 
 
 
280 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.291568  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34740  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  65.26 
 
 
280 aa  263  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0253397  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  56.89 
 
 
277 aa  263  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  56.05 
 
 
286 aa  259  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0128  Chloride peroxidase  59.62 
 
 
275 aa  254  7e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00372982  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2691  alpha/beta hydrolase fold protein  59.52 
 
 
276 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78539  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  51.87 
 
 
290 aa  231  9e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  51.66 
 
 
279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  47 
 
 
281 aa  218  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  50.71 
 
 
279 aa  217  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0261  alpha/beta hydrolase fold protein  52.56 
 
 
281 aa  199  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.812291  normal  0.698005 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  48.13 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  41.35 
 
 
276 aa  191  7e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  48.31 
 
 
272 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0256  alpha/beta hydrolase fold protein  45.33 
 
 
292 aa  190  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022774  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  46.86 
 
 
272 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  45.28 
 
 
272 aa  185  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  43.06 
 
 
278 aa  184  9e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  45.09 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  43.93 
 
 
273 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  43.89 
 
 
273 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3028  alpha/beta hydrolase fold protein  43.64 
 
 
278 aa  180  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.821303 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  41.1 
 
 
269 aa  177  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  45.02 
 
 
272 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  43.6 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  43.72 
 
 
273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  44.08 
 
 
272 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2090  bromoperoxidase  43.36 
 
 
278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  43.48 
 
 
272 aa  172  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3158  bromoperoxidase  43.3 
 
 
278 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00429075  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  43.6 
 
 
272 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  39.37 
 
 
278 aa  171  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2941  bromoperoxidase  42.41 
 
 
278 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2915  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  42.41 
 
 
278 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  41.53 
 
 
273 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3084  alpha/beta hydrolase fold  42.73 
 
 
235 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3165  bromoperoxidase  42.41 
 
 
278 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0230592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3173  bromoperoxidase  42.41 
 
 
278 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  44.65 
 
 
273 aa  169  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  41.53 
 
 
273 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  41.53 
 
 
273 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  43.78 
 
 
317 aa  168  9e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  40.55 
 
 
278 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3150  bromoperoxidase  41.96 
 
 
278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.908823  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  40.76 
 
 
297 aa  166  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  40.1 
 
 
275 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  39.44 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  41.71 
 
 
273 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  40.65 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  39.81 
 
 
330 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  42.99 
 
 
273 aa  159  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  40.85 
 
 
273 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  43.32 
 
 
273 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  42.92 
 
 
273 aa  159  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  44.22 
 
 
274 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  39.11 
 
 
273 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5814  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 
273 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.086599  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  42.49 
 
 
273 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  43.01 
 
 
273 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  39.39 
 
 
275 aa  156  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  40.76 
 
 
273 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  40.37 
 
 
334 aa  155  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  39.52 
 
 
324 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  39.6 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06620  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  40.79 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.270497  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  38.57 
 
 
273 aa  152  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  44.1 
 
 
273 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4668  non-heme chloroperoxidase  43.01 
 
 
276 aa  152  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  39.72 
 
 
274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  37.91 
 
 
322 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
338 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3914  alpha/beta hydrolase fold protein  37.85 
 
 
273 aa  149  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.732284  normal  0.454673 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  41.27 
 
 
277 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  41.27 
 
 
277 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  41.27 
 
 
277 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2461  Alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 
272 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 
324 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5030  Alpha/beta hydrolase fold  38.6 
 
 
274 aa  148  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  40.1 
 
 
274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  38.39 
 
 
290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  36.24 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  37.44 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  37.05 
 
 
281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.139447 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  40.1 
 
 
277 aa  145  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  39 
 
 
322 aa  145  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  38.25 
 
 
277 aa  145  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2084  alpha/beta hydrolase fold protein  39.13 
 
 
275 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446473  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3320  alpha/beta hydrolase fold protein  39.07 
 
 
273 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6690  alpha/beta hydrolase fold  38.14 
 
 
328 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  38.86 
 
 
276 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4742  alpha/beta hydrolase fold  39.8 
 
 
278 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0194  Alpha/beta hydrolase  37.96 
 
 
280 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5825  alpha/beta hydrolase fold  36.71 
 
 
276 aa  142  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0224159  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2363  alpha/beta hydrolase fold  36.95 
 
 
328 aa  142  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.329927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>