More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4179 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2941  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
287 aa  587  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00010535  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4140  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
287 aa  587  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.728837  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4179  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
287 aa  587  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3262  transposase IS4 family protein  66.55 
 
 
279 aa  381  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2795  transposase IS4 family protein  66.55 
 
 
284 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319972  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4363  transposase IS4 family protein  69.14 
 
 
283 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2808  transposase IS4 family protein  66.55 
 
 
284 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1109  transposase, IS4  54.32 
 
 
278 aa  296  3e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138434  normal  0.273152 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2037  transposase, IS4  54.32 
 
 
278 aa  296  3e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362395  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2540  transposase, IS4  54.32 
 
 
278 aa  296  3e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2707  transposase, IS4  54.32 
 
 
278 aa  296  3e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4006  transposase, IS4  54.32 
 
 
278 aa  296  3e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0457  insertion element transposase  64.41 
 
 
222 aa  293  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2080  transposase, IS4  53.96 
 
 
278 aa  293  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.382451  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3998  transposase, IS4  54.47 
 
 
237 aa  257  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3385  transposase, IS4  46.13 
 
 
308 aa  219  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.300712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7421  transposase IS4 family protein  45.72 
 
 
275 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.720449 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2123  transposase IS4 family protein  40.15 
 
 
295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1197  transposase IS4 family protein  40.15 
 
 
295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2979  transposase IS4 family protein  40.15 
 
 
295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3116  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 
274 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1950  transposase, IS4 family protein  48.76 
 
 
206 aa  192  6e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  41.06 
 
 
274 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  41.22 
 
 
278 aa  186  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  41.22 
 
 
278 aa  186  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  41.22 
 
 
278 aa  186  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  41.22 
 
 
278 aa  186  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  41.22 
 
 
278 aa  186  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  41.22 
 
 
278 aa  186  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  41.22 
 
 
278 aa  186  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  41.22 
 
 
278 aa  186  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  41.22 
 
 
278 aa  186  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  41.22 
 
 
278 aa  186  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  41.22 
 
 
278 aa  186  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  41.22 
 
 
278 aa  186  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  40.68 
 
 
274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3221  transposase  41.06 
 
 
280 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000851994 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  40.68 
 
 
274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  40.68 
 
 
274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0935  transposase IS5 family protein  39.85 
 
 
274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799188  normal  0.508265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2695  transposase IS5 family protein  39.85 
 
 
274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2728  transposase IS5 family protein  39.85 
 
 
274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264364  normal  0.61764 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2712  transposase IS5 family protein  39.85 
 
 
274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678901  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1755  transposase IS5 family protein  39.85 
 
 
274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0831197  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1749  transposase IS5 family protein  39.85 
 
 
274 aa  183  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126196  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1302  ISRSO1-transposase protein  40.68 
 
 
274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1332  ISRSO1-transposase protein  40.68 
 
 
274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1783  transposase IS5 family protein  39.46 
 
 
274 aa  183  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1766  transposase IS5 family protein  39.46 
 
 
274 aa  183  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0743046  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0151  transposase, IS4  44.53 
 
 
250 aa  182  7e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  39.46 
 
 
265 aa  182  7e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1794  transposase IS5 family protein  39.46 
 
 
274 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0951166  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6779  transposase IS4 family protein  39.58 
 
 
280 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2136  transposase IS4 family protein  38.35 
 
 
266 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.378741  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2053  transposase IS4 family protein  38.35 
 
 
266 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00218403  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4896  transposase IS4 family protein  38.35 
 
 
266 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3199  transposase  39.92 
 
 
274 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2925  transposase IS4 family protein  38.35 
 
 
266 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2394  transposase IS4 family protein  38.35 
 
 
266 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0935306  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1068  transposase IS4 family protein  38.35 
 
 
266 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000319943  unclonable  0.000000000131837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1893  transposase IS4 family protein  38.35 
 
 
266 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5371  transposase IS4 family protein  38.35 
 
 
266 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.167479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0605  transposase IS4 family protein  38.35 
 
 
266 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0413  transposase IS4 family protein  38.35 
 
 
266 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5116  transposase IS4 family protein  38.35 
 
 
266 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1324  transposase IS4 family protein  38.35 
 
 
266 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.751999  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0011  transposase IS4 family protein  38.35 
 
 
266 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.685381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3910  transposase IS4 family protein  38.35 
 
 
266 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  40.22 
 
 
278 aa  176  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0055  transposase IS4 family protein  40 
 
 
270 aa  176  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3790  transposase IS4 family protein  40 
 
 
270 aa  176  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2998  transposase, IS4  38.19 
 
 
265 aa  176  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4898  IS4 family transposase  42.5 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0763576  normal  0.401338 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4900  IS4 family transposase  42.5 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413324  normal  0.183223 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5050  IS4 family transposase  42.5 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954495  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2168  IS4 family transposase  42.5 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171514  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2410  IS4 family transposase  42.5 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2649  IS4 family transposase  42.5 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4415  IS4 family transposase  42.5 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22437  normal  0.800845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4454  IS4 family transposase  42.5 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943978  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7602  transposase IS4 family protein  38.78 
 
 
270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0954844  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  38.64 
 
 
270 aa  172  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  38.35 
 
 
274 aa  172  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1387  transposase IS5 family protein  39.92 
 
 
276 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3075  transposase, IS4  38.31 
 
 
270 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1074  transposase IS4 family protein  39.76 
 
 
275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3483  transposase, IS4 family protein  37.5 
 
 
275 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.274203  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3140  transposase, IS4 family protein  37.26 
 
 
268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3208  transposase, IS4 family protein  35.88 
 
 
268 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2925  transposase IS4 family protein  36.9 
 
 
269 aa  163  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1298  transposase IS4 family protein  39.02 
 
 
269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2961  transposase IS4 family protein  45.13 
 
 
250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4899  IS4 family transposase  38.17 
 
 
273 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.305485 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4990  IS4 family transposase  38.17 
 
 
273 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0893  transposase  36.3 
 
 
294 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.500999  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2723  transposase  36.06 
 
 
278 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2939  transposase, IS4 family protein  37.25 
 
 
270 aa  159  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.393582  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3263  transposase, IS4 family protein  37.25 
 
 
270 aa  159  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3765  transposase, IS4 family protein  37.25 
 
 
270 aa  159  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4617  transposase, IS4 family protein  37.25 
 
 
270 aa  159  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>