More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4138 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4138  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  100 
 
 		 511 aa  1025    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.609635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4192  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  78.79 
 
 		 297 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4212  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  70.56 
 
 		 284 aa  278  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6737  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.7 
 
 		 509 aa  277  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0291676  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0088  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.02 
 
 		 546 aa  236  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0719331 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0035  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.02 
 
 		 546 aa  236  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6189  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.53 
 
 		 562 aa  230  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.984628  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8617  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34 
 
 		 545 aa  224  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7841  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34 
 
 		 545 aa  224  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8278  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34 
 
 		 545 aa  224  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3281  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.53 
 
 		 518 aa  213  5.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0194889 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3262  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.53 
 
 		 518 aa  212  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00994132 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6768  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.56 
 
 		 501 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.403374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3814  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.41 
 
 		 549 aa  204  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4953  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.55 
 
 		 518 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3101  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.94 
 
 		 487 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2991  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.94 
 
 		 487 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4601  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.94 
 
 		 487 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3974  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.76 
 
 		 520 aa  196  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4643  hypothetical protein  56.61 
 
 		 280 aa  186  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3040  insertion element is466s transposase  59.65 
 
 		 192 aa  184  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3412  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.24 
 
 		 353 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.406116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0632  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.93 
 
 		 378 aa  176  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5451  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.52 
 
 		 536 aa  176  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.268297 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2272  ISL3 family transposase  28.15 
 
 		 539 aa  167  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00373654  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5033  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.15 
 
 		 570 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.681228  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3934  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  32.88 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4809  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.65 
 
 		 361 aa  161  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6734  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  41.25 
 
 		 344 aa  156  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4223  insertion element IS466S transposase  75.49 
 
 		 103 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3056  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  27.37 
 
 		 476 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.905986  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4090  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  22.97 
 
 		 441 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4191  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  38.74 
 
 		 229 aa  110  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1079  ISL3 family transposase  30.68 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.464356 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4193  transposase  46.83 
 
 		 122 aa  97.4  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1438  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.78 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1035  hypothetical protein  29.39 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2037  hypothetical protein  29.39 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2311  hypothetical protein  29.39 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2402  hypothetical protein  29.39 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3980  putative transposase  55.95 
 
 		 83 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3856  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.78 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0918  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.78 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2875  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.94 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1566  hypothetical protein  26.32 
 
 		 382 aa  82.8  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4192  IS6 family transposase  32.61 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1852  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.86 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.516656  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2328  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  22.92 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3433  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  22.92 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2410  hypothetical protein  30.6 
 
 		 326 aa  79.7  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0649  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  22.92 
 
 		 391 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0565  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  22.92 
 
 		 391 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1314  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  22.92 
 
 		 391 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2445  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  22.92 
 
 		 391 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.08593  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0608  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  22.92 
 
 		 391 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3286  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  22.92 
 
 		 391 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2902  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2818  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859057  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0382  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3670  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0767  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2011  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0133  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2639  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1123  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2072  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2202  isrso15-transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3299  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0302  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0363  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.459994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2608  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.904926  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3044  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932011  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2265  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1283  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.166127  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2341  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0136009  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2187  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3446  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2365  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1019  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1380  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0846  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.392375  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1226  transposase,/IS1001/IS1096/IS1165  29.5 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576272  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2619  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0604405  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0991  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0180  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.017513  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0456  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321597  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1099  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0470  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1863  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1934  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390683  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2090  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1213  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1101  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0496  transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1783  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2342  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3784  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.109765  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0156  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1119  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0731166  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1958  ISBma1, transposase  29.5 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>