More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4131 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  100 
 
 		 401 aa  783    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  53.25 
 
 		 462 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  46.98 
 
 		 407 aa  196  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  38.39 
 
 		 399 aa  190  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 		 403 aa  176  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  37.39 
 
 		 392 aa  172  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  37.46 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 		 394 aa  166  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  45.22 
 
 		 367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.02 
 
 		 382 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 441 aa  158  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  42.72 
 
 		 392 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  41.59 
 
 		 430 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  41.26 
 
 		 442 aa  149  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  40.55 
 
 		 388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  39.36 
 
 		 400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  39.66 
 
 		 381 aa  146  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  41.15 
 
 		 423 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  42.98 
 
 		 372 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 		 420 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  41.07 
 
 		 408 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  38 
 
 		 380 aa  143  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  38.46 
 
 		 405 aa  143  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  34.45 
 
 		 399 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.12 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.69 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207944  normal  0.109837 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 405 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.75 
 
 		 370 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.45 
 
 		 378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  38.98 
 
 		 430 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  40 
 
 		 478 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  36.45 
 
 		 395 aa  139  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  35.58 
 
 		 380 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  45.81 
 
 		 357 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0309  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  39.74 
 
 		 414 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5264  histidine kinase  40.93 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  33.05 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  39.92 
 
 		 383 aa  137  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  38.1 
 
 		 422 aa  137  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 		 439 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2086  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.96 
 
 		 389 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  34.15 
 
 		 433 aa  136  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  38.11 
 
 		 393 aa  136  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  39.66 
 
 		 408 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  34.73 
 
 		 384 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  36.87 
 
 		 428 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39190  signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 601 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.240452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  35.95 
 
 		 442 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  37.25 
 
 		 399 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  38.43 
 
 		 380 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1653  histidine kinase  40.79 
 
 		 470 aa  133  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.81 
 
 		 500 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 441 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.58 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.33 
 
 		 407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 421 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  39.9 
 
 		 402 aa  130  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 		 406 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4118  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  35.25 
 
 		 376 aa  129  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 441 aa  129  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4945  histidine kinase  35.55 
 
 		 351 aa  129  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 		 612 aa  130  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0607  histidine kinase  35.77 
 
 		 434 aa  129  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  39.57 
 
 		 443 aa  129  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.29 
 
 		 379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2709  histidine kinase  39.2 
 
 		 397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607523  normal  0.683898 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  37.08 
 
 		 402 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  36.4 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8801  putative two-component system sensor kinase  34.84 
 
 		 359 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  32.22 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 398 aa  126  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 		 398 aa  126  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.12 
 
 		 392 aa  126  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2680  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.61 
 
 		 271 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.913052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 		 496 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.92 
 
 		 430 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3027  histidine kinase  38.03 
 
 		 449 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.256047  decreased coverage  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  37.65 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  37.11 
 
 		 380 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  35.02 
 
 		 438 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  39.09 
 
 		 443 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 444 aa  123  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0550  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 382 aa  122  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  35 
 
 		 357 aa  122  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  33.73 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  32.26 
 
 		 410 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1884  histidine kinase  36.51 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0784201 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2014  histidine kinase  37.91 
 
 		 387 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  35.05 
 
 		 408 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0608  histidine kinase  40.8 
 
 		 351 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  37.44 
 
 		 375 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  35.41 
 
 		 393 aa  120  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  38.3 
 
 		 372 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 394 aa  119  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 424 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0277  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>