105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4115 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4115  methyltransferase type 12  100 
 
 		 237 aa  480  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4536  methyltransferase type 12  91.98 
 
 		 237 aa  449  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0533  type 12 methyltransferase  37.67 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324241  decreased coverage  0.00341349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1057  putative pristinamycin I synthase 3  37.05 
 
 		 243 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377731 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0847  Methyltransferase type 11  36.94 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.988937  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08180  methyltransferase family protein  34.93 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0388  Methyltransferase type 12  27.76 
 
 		 259 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0397  Methyltransferase type 12  27.76 
 
 		 259 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1427  methyltransferase type 12  30.1 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 		 531 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  27.9 
 
 		 527 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 		 519 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  27.9 
 
 		 527 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0944  methyltransferase type 12  31.94 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5899  Methyltransferase type 11  27.04 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.331708  normal  0.516672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  26.92 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  45 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  30.6 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  29.19 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  29.65 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  26.99 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1380  hypothetical protein  35.29 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  38.1 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  25.33 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  26.22 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  28.67 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  30.14 
 
 		 248 aa  62  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  26.11 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  27.23 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  30.14 
 
 		 248 aa  62  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  32.61 
 
 		 242 aa  62  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  28.77 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2382  generic methyltransferase  27.61 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5629  Methyltransferase type 12  30.07 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  27.36 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  26.51 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  27.54 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  28.48 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  25.29 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  26.49 
 
 		 261 aa  55.1  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  28.86 
 
 		 292 aa  54.7  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  26.11 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  25.66 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  27.08 
 
 		 288 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  29.53 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4625  hypothetical protein  32 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394037  normal  0.982559 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1757  methylase  27.14 
 
 		 240 aa  53.1  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1003  hypothetical protein  35.14 
 
 		 237 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1368  hypothetical protein  40.91 
 
 		 237 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1485  hypothetical protein  35.14 
 
 		 237 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38639  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1461  hypothetical protein  35.14 
 
 		 237 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  21.78 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1408  hypothetical protein  40.91 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2661  hypothetical protein  32 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.588792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 711 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5370  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 288 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.328033 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 		 710 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0448  methyltransferase type 12  30.61 
 
 		 307 aa  49.3  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00834451  normal  0.0296348 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7221  putative 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.52 
 
 		 241 aa  48.9  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1390  SAM-binding motif-containing protein  36.99 
 
 		 252 aa  48.5  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.671564 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1376  Methyltransferase type 11  28.92 
 
 		 274 aa  48.5  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.331989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  22.43 
 
 		 289 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  30.33 
 
 		 287 aa  47.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2234  Methyltransferase type 11  26.79 
 
 		 255 aa  47  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  hitchhiker  0.000669188 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  30.82 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0280  hypothetical protein  24.18 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.13  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  26.52 
 
 		 289 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3306  Methyltransferase type 11  26 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  26.41 
 
 		 318 aa  46.2  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  25.89 
 
 		 239 aa  45.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  24.76 
 
 		 318 aa  45.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2551  Methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 248 aa  45.4  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  32.17 
 
 		 225 aa  45.4  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  24.4 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3318  methyltransferase type 12  23.78 
 
 		 383 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434757 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0834  Methyltransferase type 12  25.85 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1484  glycosyl transferase WecB/TagA/CpsF  27.92 
 
 		 574 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000853936  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3855  Methyltransferase type 12  31.03 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5473  Methyltransferase type 12  38.57 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  30.25 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5925  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.36 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  27.44 
 
 		 239 aa  42.7  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  24.4 
 
 		 204 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 293 aa  42.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0942  Methyltransferase type 11  25.49 
 
 		 249 aa  42.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000927283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6255  methyltransferase domain-containing protein  27.97 
 
 		 257 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  24.4 
 
 		 204 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2563  Methyltransferase type 12  26.8 
 
 		 246 aa  42.7  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 215 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5678  hypothetical protein  28.17 
 
 		 294 aa  42.4  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.622302  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  25.86 
 
 		 310 aa  42.4  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0388  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 226 aa  42.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  24.48 
 
 		 308 aa  42.4  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>