More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4111 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  100 
 
 
239 aa  468  1e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  92.05 
 
 
239 aa  436  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  53.16 
 
 
505 aa  234  8e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  51.46 
 
 
241 aa  228  9e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  53.16 
 
 
472 aa  226  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  50.84 
 
 
478 aa  221  6e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  50.84 
 
 
482 aa  221  7e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  50 
 
 
241 aa  219  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  53.16 
 
 
477 aa  216  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  49.58 
 
 
540 aa  212  3e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  53.54 
 
 
517 aa  209  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  53.1 
 
 
491 aa  208  6e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308307  hitchhiker  0.00998453 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0019  protein serine/threonine phosphatases  53.1 
 
 
491 aa  208  6e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.678049  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0019  protein phosphatase 2C domain-containing protein  53.1 
 
 
491 aa  208  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.888724 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0808  protein phosphatase 2C domain-containing protein  53.1 
 
 
516 aa  206  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  53.54 
 
 
514 aa  206  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  47.68 
 
 
463 aa  205  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  48.74 
 
 
441 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  49.56 
 
 
478 aa  203  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  49.58 
 
 
426 aa  202  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  46.44 
 
 
466 aa  200  1e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  50.42 
 
 
469 aa  198  6e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  48.15 
 
 
449 aa  197  1e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  49.56 
 
 
395 aa  197  1e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  47.52 
 
 
500 aa  197  2e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  50 
 
 
479 aa  195  4e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4426  protein serine/threonine phosphatase  49.34 
 
 
364 aa  194  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0345572  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  48.74 
 
 
421 aa  193  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  50.43 
 
 
467 aa  192  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0025  protein serine/threonine phosphatase  47.79 
 
 
474 aa  191  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0922005  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  48.33 
 
 
519 aa  191  6e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  45.19 
 
 
463 aa  188  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  48.29 
 
 
425 aa  186  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  46.84 
 
 
247 aa  186  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  46.64 
 
 
474 aa  185  6e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  45.8 
 
 
265 aa  181  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  49.56 
 
 
452 aa  180  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  47.01 
 
 
462 aa  179  3e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  44.73 
 
 
507 aa  179  3e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  48.94 
 
 
404 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  41.15 
 
 
554 aa  175  6e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0022  protein serine/threonine phosphatase  46.78 
 
 
511 aa  172  3e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  41.56 
 
 
564 aa  172  4e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1591  Phosphoprotein phosphatase  46.61 
 
 
253 aa  172  4e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  41.53 
 
 
567 aa  172  6e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  44.08 
 
 
255 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  41.95 
 
 
558 aa  169  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  43.16 
 
 
394 aa  168  8e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  42.13 
 
 
237 aa  162  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.32 
 
 
438 aa  162  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  42.02 
 
 
571 aa  161  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  43.17 
 
 
519 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  38.78 
 
 
252 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1155  protein serine/threonine phosphatase  47.37 
 
 
267 aa  155  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  35.66 
 
 
250 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4818  protein serine/threonine phosphatase  41.91 
 
 
259 aa  152  3e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  38.63 
 
 
238 aa  152  3e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6203  protein serine/threonine phosphatase  44.3 
 
 
239 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00400248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0035  protein serine/threonine phosphatase  48.52 
 
 
687 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  41.15 
 
 
236 aa  149  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  35.25 
 
 
250 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  35.25 
 
 
250 aa  149  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  35.25 
 
 
250 aa  148  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3911  protein phosphatase 2C, family protein  34.84 
 
 
250 aa  148  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00759047  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3905  protein phosphatase 2C, family protein  34.84 
 
 
250 aa  148  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  44.12 
 
 
369 aa  147  1e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0068  serine/threonine specific protein phosphatase (putative)  42.37 
 
 
269 aa  147  2e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3604  protein phosphatase 2C  34.84 
 
 
250 aa  146  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3622  protein phosphatase 2C  34.84 
 
 
250 aa  146  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4001  protein phosphatase 2C, family protein  34.84 
 
 
250 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3877  protein phosphatase 2C, family protein  34.84 
 
 
250 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.65196e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3714  protein phosphatase 2C, family protein  34.84 
 
 
250 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.89 
 
 
238 aa  145  4e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  41.35 
 
 
261 aa  145  7e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  39.04 
 
 
236 aa  144  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4678  protein serine/threonine phosphatases  38.71 
 
 
261 aa  143  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  41.67 
 
 
416 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.57 
 
 
271 aa  143  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  39.51 
 
 
258 aa  142  4e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  32.64 
 
 
245 aa  142  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  1.79403e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  39.57 
 
 
239 aa  142  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3360  protein phosphatase 2C-like  38.74 
 
 
274 aa  142  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  42.74 
 
 
256 aa  141  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  35.39 
 
 
249 aa  141  1e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1278  protein phosphatase 2C-like protein  35.39 
 
 
247 aa  138  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1303  protein phosphatase 2C-like protein  35.39 
 
 
247 aa  138  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.244984  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3389  protein serine/threonine phosphatase  39.15 
 
 
271 aa  138  8e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.830216  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2458  protein phosphatase 2C domain-containing protein  43.72 
 
 
258 aa  138  8e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.44 
 
 
247 aa  138  8e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  39.44 
 
 
276 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  43.04 
 
 
256 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  33.89 
 
 
236 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  36.64 
 
 
241 aa  136  3e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  43.81 
 
 
239 aa  135  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  38.43 
 
 
597 aa  136  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  36.24 
 
 
236 aa  135  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  43.97 
 
 
422 aa  135  5e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.75 
 
 
280 aa  135  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.82 
 
 
261 aa  135  6e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  32.38 
 
 
241 aa  135  6e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>