More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4033 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0493  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.47 
 
 
815 aa  863    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0625  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.86 
 
 
803 aa  717    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26090  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  51.73 
 
 
833 aa  747    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00586248  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4033  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
802 aa  1589    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338213  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0123  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  57.58 
 
 
761 aa  786    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0336832  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33220  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  50.64 
 
 
891 aa  753    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442514  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0313  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.35 
 
 
815 aa  880    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25230  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  53.78 
 
 
780 aa  722    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1391  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.93 
 
 
781 aa  770    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036578  normal  0.532638 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4301  DEAD/DEAH box helicase-like  61.95 
 
 
804 aa  862    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18140  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  54.64 
 
 
865 aa  763    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2218  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.23 
 
 
861 aa  726    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.344745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0518  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.65 
 
 
763 aa  924    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3881  Protein of unknown function DUF1998  57.73 
 
 
795 aa  820    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.911773  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0572  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.8 
 
 
775 aa  807    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4799  DEAD/DEAH box helicase-like protein  54.55 
 
 
775 aa  733    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8451  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.96 
 
 
806 aa  815    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113754 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3367  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.21 
 
 
804 aa  830    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3155  Helicase superfamily 1 and 2 ATP-binding  55.6 
 
 
795 aa  828    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.36643 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0283  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.73 
 
 
807 aa  857    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.926162  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4829  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.7 
 
 
807 aa  868    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4414  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  92.81 
 
 
824 aa  1407    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0164123 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35840  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  61.56 
 
 
798 aa  862    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0109244  normal  0.0530492 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0330  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.4 
 
 
868 aa  716    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.61 
 
 
778 aa  863    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0213184  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13678  helicase  53.78 
 
 
771 aa  733    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00132558  normal  0.157688 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0735  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.6 
 
 
790 aa  771    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.773858  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5321  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.15 
 
 
764 aa  807    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0653251  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4885  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.55 
 
 
775 aa  733    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60576  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5399  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.31 
 
 
782 aa  716    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265021  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0482  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.78 
 
 
812 aa  771    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.016003  hitchhiker  0.00542226 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0601  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.1 
 
 
848 aa  884    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.502776  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.55 
 
 
775 aa  734    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159348 
 
 
-
 
NC_002936  DET0967  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.37 
 
 
764 aa  615  1e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.131419  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0858  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.67 
 
 
764 aa  617  1e-175  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00289553  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_840  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  41.57 
 
 
764 aa  597  1e-169  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2984  helicase superfamily protein  45.99 
 
 
862 aa  595  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000404432  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.13 
 
 
868 aa  574  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000944502  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5571  Protein of unknown function DUF1998  45.25 
 
 
761 aa  571  1e-161  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2771  Protein of unknown function DUF1998  61.6 
 
 
866 aa  561  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00683804  hitchhiker  0.000025981 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0220  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  63.51 
 
 
902 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0012  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.63 
 
 
762 aa  531  1e-149  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0793231  hitchhiker  0.00171802 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0278  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.09 
 
 
773 aa  523  1e-147  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.235091  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1162  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.43 
 
 
764 aa  524  1e-147  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2843  ATP-dependant helicase  37.92 
 
 
912 aa  520  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00245951  normal  0.0337718 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2730  DEAD/DEAH box helicase-like  39.63 
 
 
751 aa  521  1e-146  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0511  DEAD/DEAH box helicase-like protein  46.04 
 
 
739 aa  513  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.814841  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.18 
 
 
1053 aa  514  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215301  normal  0.377392 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3603  DEAD/DEAH box helicase-like  41.37 
 
 
986 aa  501  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0836836  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1953  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.49 
 
 
959 aa  498  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212606  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.14 
 
 
962 aa  485  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2253  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.11 
 
 
753 aa  482  1e-134  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2983  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.38 
 
 
972 aa  480  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2198  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.13 
 
 
1198 aa  474  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1910  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.22 
 
 
752 aa  475  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2251  Protein of unknown function DUF1998  41.32 
 
 
797 aa  466  9.999999999999999e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1438  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.56 
 
 
807 aa  464  1e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0673  NADPH-dependent FMN reductase  39.15 
 
 
738 aa  465  1e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.17 
 
 
1086 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.97 
 
 
973 aa  457  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.273362 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2375  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.07 
 
 
758 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.92 
 
 
768 aa  452  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.199645  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.88 
 
 
790 aa  449  1.0000000000000001e-124  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14630  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.81 
 
 
751 aa  442  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000706515  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0484  DEAD/DEAH box helicase-like protein  35.19 
 
 
941 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0368983  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2271  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.43 
 
 
789 aa  442  9.999999999999999e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0432  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.42 
 
 
759 aa  432  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40984  predicted protein  35.95 
 
 
815 aa  427  1e-118  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.954801  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0080  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.44 
 
 
829 aa  419  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.412671 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3559  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.29 
 
 
896 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.450676  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03333  ATP-dependent RNA helicase  35.54 
 
 
831 aa  412  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0733  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.46 
 
 
805 aa  402  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1976  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.22 
 
 
838 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1707  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.79 
 
 
808 aa  402  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0661739  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0816  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.64 
 
 
685 aa  399  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.710147  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.16 
 
 
855 aa  358  1.9999999999999998e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10757  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10820)  31.82 
 
 
1210 aa  344  2.9999999999999997e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0139643  normal  0.823621 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.53 
 
 
803 aa  334  4e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111055  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38435  predicted protein  33.02 
 
 
758 aa  332  2e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62134  predicted protein  29.25 
 
 
1178 aa  304  4.0000000000000003e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1460  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.57 
 
 
766 aa  302  2e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.801207  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1303  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.09 
 
 
756 aa  297  5e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000031195  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.19 
 
 
744 aa  287  5e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2258  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.46 
 
 
897 aa  285  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22294  normal  0.971461 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2983  Protein of unknown function DUF1998  33.33 
 
 
948 aa  282  2e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1686  Protein of unknown function DUF1998  31.73 
 
 
931 aa  280  6e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1457  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.16 
 
 
744 aa  272  2e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.507421  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1523  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.04 
 
 
744 aa  271  4e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.750209  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.06 
 
 
751 aa  266  8.999999999999999e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0861  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.23 
 
 
744 aa  262  1e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0546  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.62 
 
 
740 aa  250  6e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48177  predicted protein  28.46 
 
 
1321 aa  249  1e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.99 
 
 
739 aa  245  3e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3683  DEAD/DEAH box helicase-like  23.68 
 
 
905 aa  244  5e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1320  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.49 
 
 
815 aa  217  5.9999999999999996e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000720865 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0390  DEAD/DEAH box helicase-like protein  28.52 
 
 
876 aa  192  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5502  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29 
 
 
914 aa  183  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.33 
 
 
911 aa  181  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0060  DEAD/DEAH box helicase-like  25.31 
 
 
906 aa  176  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0763729  normal  0.477512 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0312  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.83 
 
 
879 aa  154  8e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>