More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4026 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  89.22 
 
 		 437 aa  767    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  100 
 
 		 437 aa  876    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  47.2 
 
 		 434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  53.12 
 
 		 452 aa  404  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  51.88 
 
 		 435 aa  403  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  50.23 
 
 		 441 aa  391  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  49.65 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  49.88 
 
 		 425 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  49.07 
 
 		 438 aa  387  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  46.48 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  49.41 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  48.71 
 
 		 437 aa  368  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  46.06 
 
 		 427 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  48.49 
 
 		 447 aa  355  7.999999999999999e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  45.24 
 
 		 439 aa  355  1e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  45.43 
 
 		 473 aa  350  2e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  44.82 
 
 		 486 aa  343  2e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  38.53 
 
 		 437 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  38.3 
 
 		 437 aa  330  4e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  38.53 
 
 		 437 aa  330  4e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  44.75 
 
 		 438 aa  329  7e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  38.3 
 
 		 437 aa  328  9e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  38.3 
 
 		 437 aa  328  9e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  38.76 
 
 		 437 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  38.53 
 
 		 437 aa  326  5e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  38.97 
 
 		 434 aa  325  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  38.53 
 
 		 437 aa  323  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  38.3 
 
 		 438 aa  323  3e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  43.58 
 
 		 445 aa  323  3e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  42.76 
 
 		 470 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  38.98 
 
 		 437 aa  317  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  43.79 
 
 		 475 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  42.19 
 
 		 436 aa  298  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  38.83 
 
 		 440 aa  263  6e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  36.77 
 
 		 417 aa  253  5.000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  36.89 
 
 		 424 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  38.02 
 
 		 460 aa  250  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  35.57 
 
 		 469 aa  241  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  35.13 
 
 		 464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  32.63 
 
 		 423 aa  234  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  32.79 
 
 		 429 aa  233  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  33.1 
 
 		 412 aa  230  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.42 
 
 		 445 aa  227  3e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  35.21 
 
 		 464 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  35.73 
 
 		 442 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  34.12 
 
 		 439 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  32.71 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.55 
 
 		 409 aa  200  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  29.71 
 
 		 478 aa  199  7e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  31.38 
 
 		 415 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  30.91 
 
 		 415 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  30.91 
 
 		 415 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  34.65 
 
 		 466 aa  175  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.86 
 
 		 449 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.03 
 
 		 417 aa  167  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  34.43 
 
 		 418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.87 
 
 		 429 aa  151  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  32.3 
 
 		 421 aa  149  9e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  28.67 
 
 		 437 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.91 
 
 		 462 aa  139  7e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  29.05 
 
 		 574 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  31.76 
 
 		 427 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  29.89 
 
 		 430 aa  129  9.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  31.07 
 
 		 424 aa  126  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  31.02 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  28.62 
 
 		 556 aa  125  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  31.25 
 
 		 421 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14850  D-arabinono-1,4-lactone oxidase  34.98 
 
 		 246 aa  123  8e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156556  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  30.43 
 
 		 446 aa  120  6e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  32.59 
 
 		 572 aa  118  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  26.15 
 
 		 448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  31.47 
 
 		 483 aa  114  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.16 
 
 		 504 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  41.01 
 
 		 418 aa  111  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  29.84 
 
 		 413 aa  109  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  27.49 
 
 		 366 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1781  FAD/FMN-containing dehydrogenase  22.99 
 
 		 642 aa  82.8  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.926813  normal  0.0106686 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4288  hypothetical protein  55.07 
 
 		 69 aa  82.4  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0353708 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  21.75 
 
 		 478 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  21.51 
 
 		 478 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  21.59 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  21.59 
 
 		 478 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.52 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  22 
 
 		 478 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  21.14 
 
 		 478 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.14 
 
 		 462 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  21.59 
 
 		 478 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  24.74 
 
 		 468 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  21.59 
 
 		 471 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  31.28 
 
 		 452 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  20.63 
 
 		 490 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0619  cholesterol oxidase  26.23 
 
 		 645 aa  67  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4086  FAD linked oxidase domain protein  25.82 
 
 		 539 aa  66.6  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503677  normal  0.115549 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02192  conserved hypothetical protein  27.46 
 
 		 376 aa  66.2  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0118307  normal  0.261701 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  24.14 
 
 		 475 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  29.45 
 
 		 425 aa  66.2  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  33.53 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  33.89 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0949  hypothetical protein  25.64 
 
 		 595 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0672841  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0751  FAD binding domain-containing protein  30.59 
 
 		 586 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>