139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4025 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4025  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 197 aa  394  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  96.45 
 
 		 223 aa  383  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  61.11 
 
 		 215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  55.93 
 
 		 210 aa  215  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0566  transcriptional regulator, TetR family  58.01 
 
 		 193 aa  214  8e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4772  transcriptional regulator, TetR family  55.49 
 
 		 184 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  56.83 
 
 		 229 aa  205  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  55.26 
 
 		 196 aa  201  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  53.93 
 
 		 212 aa  193  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  54.24 
 
 		 264 aa  187  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  48.13 
 
 		 223 aa  149  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  45.99 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  42.78 
 
 		 195 aa  127  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  30.11 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  32.34 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0857  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.999415 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0829  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0481  transcriptional regulator, TetR family  34.26 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.510186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 214 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1272  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  29.03 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  46 
 
 		 222 aa  48.1  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 214 aa  48.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 242 aa  48.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1770  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 218 aa  48.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 214 aa  48.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  28.39 
 
 		 278 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0960  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2179  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.277045 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03840  transcriptional regulator AguR  29.12 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0437  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 237 aa  45.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2249  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 214 aa  45.1  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.672555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2679  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 233 aa  45.1  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0385  transcriptional regulator AguR  28.57 
 
 		 211 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  45.45 
 
 		 210 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 202 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 210 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 206 aa  44.7  0.0009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5311  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4869  regulatory protein, TetR  35.62 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3700  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>