More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3997 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
338 aa  692    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  87.35 
 
 
340 aa  580  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  60.39 
 
 
317 aa  405  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5030  Alpha/beta hydrolase fold  69.37 
 
 
274 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  67.52 
 
 
277 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  67.9 
 
 
334 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  63.74 
 
 
274 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  63.37 
 
 
274 aa  381  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6690  alpha/beta hydrolase fold  55.18 
 
 
328 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  61.17 
 
 
273 aa  359  5e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  61.54 
 
 
273 aa  358  9e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  60.66 
 
 
273 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  62.13 
 
 
290 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  60.15 
 
 
274 aa  354  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  59.71 
 
 
273 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  54.46 
 
 
322 aa  351  8.999999999999999e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  60.52 
 
 
274 aa  350  2e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  58.76 
 
 
273 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  52.12 
 
 
330 aa  345  5e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  58.97 
 
 
273 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  56.99 
 
 
280 aa  342  4e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  57.88 
 
 
273 aa  342  7e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  58.46 
 
 
273 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  55.47 
 
 
273 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  53.72 
 
 
322 aa  337  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2363  alpha/beta hydrolase fold  56.41 
 
 
328 aa  336  2.9999999999999997e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.329927 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  56.04 
 
 
273 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5112  non-heme haloperoxidase  48.14 
 
 
395 aa  335  7.999999999999999e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  58.15 
 
 
273 aa  332  4e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  54.9 
 
 
324 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1113  Chloride peroxidase  50 
 
 
324 aa  332  6e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1992  non-heme chloroperoxidase  60.44 
 
 
273 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2461  Alpha/beta hydrolase fold  55.51 
 
 
272 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0603  non-heme chloroperoxidase  60.44 
 
 
273 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4742  alpha/beta hydrolase fold  57.25 
 
 
278 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0694  non-heme chloroperoxidase  60.44 
 
 
273 aa  332  8e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4894  alpha/beta hydrolase fold  56.16 
 
 
278 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  56.78 
 
 
273 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2990  alpha/beta hydrolase fold  56.16 
 
 
278 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5376  alpha/beta hydrolase fold  56.16 
 
 
278 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  58.03 
 
 
277 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  56.41 
 
 
324 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  58.03 
 
 
277 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  58.03 
 
 
277 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0299  alpha/beta hydrolase fold  47.02 
 
 
343 aa  328  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  56.09 
 
 
273 aa  326  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1149  alpha/beta hydrolase fold  55.68 
 
 
276 aa  327  3e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  54.51 
 
 
276 aa  325  5e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  55.72 
 
 
273 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2396  alpha/beta hydrolase fold  54.84 
 
 
338 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1087  alpha/beta hydrolase fold  55.07 
 
 
342 aa  324  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0532953  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5825  alpha/beta hydrolase fold  54.61 
 
 
276 aa  323  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0224159  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  53.85 
 
 
277 aa  323  3e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4668  non-heme chloroperoxidase  55.23 
 
 
276 aa  321  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2040  alpha/beta hydrolase fold protein  58.39 
 
 
274 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3320  alpha/beta hydrolase fold protein  58.24 
 
 
273 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2506  alpha/beta hydrolase fold protein  54.38 
 
 
278 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.505331  normal  0.76574 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  55.43 
 
 
275 aa  320  3e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2211  alpha/beta hydrolase fold  53.65 
 
 
278 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  55.8 
 
 
275 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1276  alpha/beta hydrolase fold  53.26 
 
 
330 aa  317  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0194  Alpha/beta hydrolase  53.21 
 
 
280 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7042  alpha/beta hydrolase fold  53.28 
 
 
278 aa  316  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.167796  normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3995  chloroperoxidase precursor  51.65 
 
 
276 aa  316  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  51.82 
 
 
276 aa  315  5e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29020  chloroperoxidase precursor  51.28 
 
 
276 aa  315  6e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.995557  hitchhiker  0.000198264 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1450  alpha/beta hydrolase fold  53.28 
 
 
278 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6378  alpha/beta hydrolase fold  53.28 
 
 
278 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3626  alpha/beta hydrolase fold  51.46 
 
 
276 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0185  Alpha/beta hydrolase  53.05 
 
 
280 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  52.19 
 
 
276 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  51.65 
 
 
276 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3584  alpha/beta hydrolase fold protein  53.09 
 
 
274 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7030  alpha/beta hydrolase fold  55.31 
 
 
326 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429028  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5684  alpha/beta hydrolase fold  52.73 
 
 
276 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6048  alpha/beta hydrolase fold  52.73 
 
 
276 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.850826 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1660  alpha/beta hydrolase fold  52.9 
 
 
278 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3920  alpha/beta hydrolase fold protein  53.11 
 
 
278 aa  310  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1465  chloride peroxidase  54.95 
 
 
326 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6363  chloride peroxidase  54.95 
 
 
326 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.669549  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4021  alpha/beta hydrolase fold  51.46 
 
 
276 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6920  Alpha/beta hydrolase  52.36 
 
 
278 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1889  non-heme chloroperoxidase  54.21 
 
 
274 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108181  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  49.15 
 
 
322 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4420  alpha/beta hydrolase fold  52.03 
 
 
274 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  52.75 
 
 
274 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1700  alpha/beta hydrolase fold  52.01 
 
 
276 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148356  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  52.75 
 
 
274 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  50.55 
 
 
276 aa  305  9.000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7479  Alpha/beta hydrolase  51.64 
 
 
276 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6475  alpha/beta hydrolase fold  53.26 
 
 
278 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483706  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5723  alpha/beta hydrolase fold  53.26 
 
 
278 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3914  alpha/beta hydrolase fold protein  53.11 
 
 
273 aa  303  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.732284  normal  0.454673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3628  alpha/beta hydrolase fold  53.48 
 
 
278 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3102  Alpha/beta hydrolase  50.18 
 
 
276 aa  302  4.0000000000000003e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1315  alpha/beta hydrolase fold  52.01 
 
 
274 aa  299  4e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991982  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1567  chloride peroxidase  52.4 
 
 
274 aa  298  7e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  53.68 
 
 
272 aa  298  8e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  50.92 
 
 
273 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3146  alpha/beta hydrolase fold  51.28 
 
 
274 aa  298  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351869  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>