More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3960 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3960  regulatory protein GntR, HTH  100 
 
 		 75 aa  153  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4344  GntR family transcriptional regulator  75 
 
 		 75 aa  110  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0366486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3953  regulatory protein GntR, HTH  70.67 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  45.71 
 
 		 242 aa  64.3  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0259  regulatory protein GntR, HTH  49.28 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0311021 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3158  regulatory protein GntR, HTH  45.07 
 
 		 310 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.325932  normal  0.0629267 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  40.91 
 
 		 229 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0086  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 492 aa  56.6  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0482  GntR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3400  transcriptional regulator  38.24 
 
 		 442 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  39.39 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4331  regulatory protein GntR, HTH  40.85 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.157834  normal  0.0446909 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  37.14 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1108  transcriptional regulator, GntR family  49.12 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4773  regulatory protein GntR HTH  40.85 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0230746  decreased coverage  0.0000199602 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1606  histidine utilization repressor  37.31 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.971553  normal  0.693248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5605  transcriptional regulator, GntR family  40.91 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  43.08 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4422  GntR domain-containing protein  37.14 
 
 		 234 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5379  GntR domain-containing protein  38.71 
 
 		 234 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.791423  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  40.62 
 
 		 254 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  40.62 
 
 		 254 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1433  GntR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 470 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139667  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6454  transcriptional regulator  43.08 
 
 		 470 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6395  GntR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 470 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1308  GntR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 240 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0828  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 488 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.055566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8668  putative transcriptional regulator, GntR family  41.27 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0154  putative transcriptional regulator, GntR family  38.57 
 
 		 245 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 234 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1537  putative GntR domain protein  34.85 
 
 		 239 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1335  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 459 aa  53.5  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  40.32 
 
 		 239 aa  53.9  0.0000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2943  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 246 aa  53.5  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5449  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 247 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 237 aa  52.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1890  transcriptional regulator  42.19 
 
 		 488 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0046  transcriptional regulator, GntR family  38.57 
 
 		 244 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1641  GntR-like  34.33 
 
 		 256 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0724  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 244 aa  53.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1435  transcriptional regulator  36.23 
 
 		 244 aa  52.8  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.851115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2597  GntR domain-containing protein  37.66 
 
 		 230 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130942 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  40.91 
 
 		 243 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1012  regulatory protein GntR, HTH  39.29 
 
 		 342 aa  52  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  39.34 
 
 		 254 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  37.5 
 
 		 268 aa  51.6  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3723  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 520 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.577094  normal  0.097742 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3981  GntR domain-containing protein  40.32 
 
 		 233 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2596  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.11 
 
 		 464 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15050  regulatory protein GntR HTH  35.38 
 
 		 368 aa  51.6  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.34825  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  43.28 
 
 		 242 aa  52  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3389  GntR domain protein  38.24 
 
 		 230 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422325  hitchhiker  0.000247854 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3213  GntR-like  34.78 
 
 		 234 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2320  regulatory protein GntR HTH  36.11 
 
 		 464 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303874  normal  0.360666 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5154  GntR domain-containing protein  34.78 
 
 		 234 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4783  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  38.36 
 
 		 243 aa  51.6  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133972  normal  0.113518 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 		 242 aa  51.6  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  38.1 
 
 		 241 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 233 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0567  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 234 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.837361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5072  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 234 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 255 aa  51.6  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5125  GntR domain-containing protein  34.78 
 
 		 234 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2647  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  38.57 
 
 		 242 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1294  histidine utilization repressor  43.08 
 
 		 244 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2010  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  54.17 
 
 		 483 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 254 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2408  histidine utilization repressor  35.29 
 
 		 266 aa  51.2  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.067403  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4549  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 234 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  38.46 
 
 		 232 aa  51.2  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  35.82 
 
 		 233 aa  51.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0087  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 525 aa  50.8  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2547  transcriptional regulator, GntR family  37.14 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.136131  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 252 aa  50.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1469  GntR domain protein  40.32 
 
 		 250 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0853  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 282 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.122159  hitchhiker  0.00270002 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 259 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 473 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  46.3 
 
 		 255 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 255 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6080  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 238 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4179  regulatory protein GntR HTH  38.81 
 
 		 243 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  43.06 
 
 		 238 aa  50.8  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0081  GntR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 533 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0322745  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  46.3 
 
 		 255 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 475 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  46.3 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 237 aa  50.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3408  GntR domain protein  34.29 
 
 		 253 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1090  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 443 aa  50.8  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3731  GntR domain protein  34.29 
 
 		 238 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 248 aa  50.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1334  transcriptional regulator, GntR family  41.94 
 
 		 239 aa  50.4  0.000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  decreased coverage  0.000248139 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  36.67 
 
 		 233 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>