97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3952 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  365  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  27.27 
 
 		 213 aa  67.8  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  26.47 
 
 		 149 aa  67  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  30.99 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0712  hypothetical protein  30.22 
 
 		 186 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  31.69 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1611  hypothetical protein  28.33 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145659 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.65 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4385  hypothetical protein  26.04 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7432  hypothetical protein  25.9 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  31.03 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  22.75 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  22.16 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  27.84 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  27.84 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  27.84 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  28.38 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  27.08 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0928  carboxymuconolactone decarboxylase  28.45 
 
 		 859 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  28.29 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  25.83 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4676  carboxymuconolactone decarboxylase  24.26 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  25.77 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0886  hypothetical protein  27.68 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  26.29 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  26.44 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5286  Carboxymuconolactone decarboxylase  24.85 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0750237  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  25.85 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3981  hypothetical protein  24.22 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354663  decreased coverage  0.000440982 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  27.27 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0701  hypothetical protein  23.08 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  24.16 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  24.16 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.16 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  30.77 
 
 		 174 aa  52  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  22.29 
 
 		 204 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  29.14 
 
 		 184 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  29.14 
 
 		 184 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  27.08 
 
 		 190 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  27.08 
 
 		 190 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  25.58 
 
 		 173 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  27.08 
 
 		 190 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  26.85 
 
 		 179 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0798  carboxymuconolactone decarboxylase  25.81 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.833566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  24.03 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3408  response regulator  29.41 
 
 		 160 aa  50.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.594008  normal  0.220961 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  21.77 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  29.14 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0805  carboxymuconolactone decarboxylase  29.65 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  24.29 
 
 		 176 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3214  carboxymuconolactone decarboxylase  26.35 
 
 		 193 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.2 
 
 		 178 aa  48.5  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  22.16 
 
 		 236 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  26.44 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.61 
 
 		 186 aa  47.8  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  27.54 
 
 		 187 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  27.54 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  27.54 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  27.54 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2050  hypothetical protein  26.36 
 
 		 216 aa  47  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.562513  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.54 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1625  hypothetical protein  24.09 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  27.54 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  22.78 
 
 		 229 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  27.81 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  28.19 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  26.15 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  28.38 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  26.09 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  26.39 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.85 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0484  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  24.34 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  29.06 
 
 		 187 aa  45.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1257  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.1 
 
 		 160 aa  45.4  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  28.83 
 
 		 184 aa  45.1  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2352  hypothetical protein  25.15 
 
 		 187 aa  45.1  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1143  hypothetical protein  23.13 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  27.93 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  26.95 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  25.69 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0015  carboxymuconolactone decarboxylase  19.09 
 
 		 173 aa  42.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130633  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10471  hypothetical protein  30.97 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  25.43 
 
 		 200 aa  42.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  25.87 
 
 		 185 aa  42.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3670  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.03 
 
 		 172 aa  42.4  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0646  carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 		 178 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1176  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.87 
 
 		 180 aa  42  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0633  carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 		 178 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0626  carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 		 178 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459666  normal  0.287262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7488  carboxymuconolactone decarboxylase  29.08 
 
 		 186 aa  41.2  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3497  carboxymuconolactone decarboxylase  26.85 
 
 		 184 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  27.27 
 
 		 143 aa  40.8  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.49 
 
 		 180 aa  40.8  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.79 
 
 		 178 aa  40.8  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>