More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3936 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 238 aa  480  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  95.8 
 
 		 238 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  75.76 
 
 		 236 aa  378  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  76.52 
 
 		 235 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  74.15 
 
 		 236 aa  372  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  72.84 
 
 		 235 aa  361  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6639  50S ribosomal protein L1  77.54 
 
 		 238 aa  361  7.0000000000000005e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4523  ribosomal protein L1  76.96 
 
 		 239 aa  358  4e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  71.62 
 
 		 238 aa  356  1.9999999999999998e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0743  ribosomal protein L1  75.74 
 
 		 237 aa  350  1e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0952  50S ribosomal protein L1  74.14 
 
 		 235 aa  348  5e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0924  50S ribosomal protein L1  74.14 
 
 		 235 aa  348  5e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0941  50S ribosomal protein L1  74.14 
 
 		 235 aa  348  5e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  72.1 
 
 		 236 aa  346  2e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  68.94 
 
 		 238 aa  345  4e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03650  50S ribosomal protein L1  74.78 
 
 		 239 aa  344  8e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10654  50S ribosomal protein L1  74.12 
 
 		 235 aa  341  5.999999999999999e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0559095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1015  ribosomal protein L1  75.32 
 
 		 237 aa  340  1e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6060  50S ribosomal protein L1  72.77 
 
 		 237 aa  340  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0677  50S ribosomal protein L1  70.13 
 
 		 238 aa  337  9e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5115  50S ribosomal protein L1  73.73 
 
 		 239 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1113  ribosomal protein L1  74.55 
 
 		 238 aa  337  9.999999999999999e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  69.87 
 
 		 238 aa  336  9.999999999999999e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  67.1 
 
 		 259 aa  337  9.999999999999999e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  68.3 
 
 		 225 aa  335  5e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0539  50S ribosomal protein L1  71 
 
 		 237 aa  335  5e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.653827  normal  0.0435444 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  64.68 
 
 		 239 aa  334  5.999999999999999e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0613  ribosomal protein L1  69.79 
 
 		 238 aa  334  7.999999999999999e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0570  50S ribosomal protein L1  69.49 
 
 		 259 aa  333  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  67.53 
 
 		 237 aa  332  4e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1070  50S ribosomal protein L1  70.56 
 
 		 237 aa  329  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0296  50S ribosomal protein L1P  69.7 
 
 		 239 aa  328  5.0000000000000004e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2705  50S ribosomal protein L1  69.83 
 
 		 235 aa  322  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0280715 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2993  50S ribosomal protein L1  69.4 
 
 		 235 aa  320  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560135  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  65.79 
 
 		 230 aa  318  7e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21010  LSU ribosomal protein L1P  65.18 
 
 		 230 aa  306  1.0000000000000001e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.343147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  60.94 
 
 		 235 aa  303  1.0000000000000001e-81  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  60.26 
 
 		 241 aa  298  7e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209  ribosomal protein L1  63.68 
 
 		 231 aa  297  8e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136712 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17280  50S ribosomal protein L1  70.81 
 
 		 235 aa  295  3e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  62.05 
 
 		 231 aa  295  3e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  56.89 
 
 		 235 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  63.39 
 
 		 232 aa  278  4e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  61.43 
 
 		 229 aa  278  4e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  58.3 
 
 		 233 aa  275  5e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  58.82 
 
 		 233 aa  274  9e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  56.64 
 
 		 230 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  56.84 
 
 		 237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  57.85 
 
 		 231 aa  273  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  56 
 
 		 231 aa  272  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  60.35 
 
 		 233 aa  271  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  55.8 
 
 		 230 aa  271  8.000000000000001e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  56.82 
 
 		 230 aa  269  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  56.82 
 
 		 230 aa  269  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  54.35 
 
 		 242 aa  268  7e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09650  LSU ribosomal protein L1P  55.36 
 
 		 238 aa  267  1e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.284817  hitchhiker  0.000232644 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  57.6 
 
 		 230 aa  267  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  54.39 
 
 		 233 aa  267  1e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  58.59 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08710  LSU ribosomal protein L1P  59.03 
 
 		 236 aa  265  4e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.190625  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  56.71 
 
 		 235 aa  265  5e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  54.78 
 
 		 234 aa  265  5.999999999999999e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1105  ribosomal protein L1  55.36 
 
 		 236 aa  262  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0193805  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1519  50S ribosomal protein L1  61.33 
 
 		 229 aa  262  3e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00056705  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1344  50S ribosomal protein L1  58.52 
 
 		 231 aa  262  3e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0377064  normal  0.0460128 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2128  ribosomal protein L1  56.41 
 
 		 237 aa  261  4.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  normal  0.786973 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  57.85 
 
 		 230 aa  261  6e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  57.85 
 
 		 230 aa  261  8e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  51.34 
 
 		 235 aa  261  8e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  54.82 
 
 		 230 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  57.53 
 
 		 229 aa  260  1e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  58.82 
 
 		 232 aa  260  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  54.11 
 
 		 233 aa  260  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  57.52 
 
 		 231 aa  259  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  53.22 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  55.8 
 
 		 233 aa  258  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  54.82 
 
 		 229 aa  258  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  56.11 
 
 		 234 aa  258  6e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  55.7 
 
 		 229 aa  258  8e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  56.95 
 
 		 230 aa  257  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  56.95 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  56.95 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  56.95 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  56.95 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  53.95 
 
 		 242 aa  256  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  56.95 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  56.95 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  56.95 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0564  50S ribosomal protein L1  55.86 
 
 		 232 aa  256  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  56.82 
 
 		 232 aa  256  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  56 
 
 		 232 aa  256  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  54.95 
 
 		 226 aa  256  3e-67  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  56.19 
 
 		 230 aa  256  3e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1797  50S ribosomal protein L1  60 
 
 		 229 aa  256  3e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00156418  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 		 232 aa  255  4e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  56.89 
 
 		 229 aa  255  5e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  55.8 
 
 		 232 aa  255  5e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  57.33 
 
 		 230 aa  254  8e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0193  50S ribosomal protein L1  58.45 
 
 		 229 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000225522  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  54.79 
 
 		 229 aa  253  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>