More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3919 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4311  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
93 aa  190  7e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3919  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
93 aa  190  7e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4503  ribosomal protein S19  90.22 
 
 
93 aa  174  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0310  30S ribosomal protein S19  84.78 
 
 
93 aa  169  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187056 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1034  30S ribosomal protein S19  87.1 
 
 
93 aa  168  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702423  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1044  30S ribosomal protein S19  87.1 
 
 
93 aa  168  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1017  30S ribosomal protein S19  87.1 
 
 
93 aa  168  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6610  ribosomal protein S19  88.17 
 
 
93 aa  167  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1127  ribosomal protein S19  86.96 
 
 
93 aa  167  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.831563  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5128  ribosomal protein S19  83.7 
 
 
92 aa  167  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1309  30S ribosomal protein S19  86.02 
 
 
93 aa  166  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415086  normal  0.102263 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04020  SSU ribosomal protein S19P  86.02 
 
 
93 aa  166  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.904114 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5045  30S ribosomal protein S19  84.95 
 
 
93 aa  166  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0166823  normal  0.166411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6045  30S ribosomal protein S19  83.7 
 
 
93 aa  165  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.852276  normal  0.340402 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0586  30S ribosomal protein S19  84.78 
 
 
93 aa  165  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0566  30S ribosomal protein S19  82.61 
 
 
92 aa  165  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4317  ribosomal protein S19  82.61 
 
 
93 aa  164  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10719  30S ribosomal protein S19  83.87 
 
 
93 aa  164  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.560637  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1090  30S ribosomal protein S19  82.61 
 
 
92 aa  163  7e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0844216 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3431  ribosomal protein S19  83.87 
 
 
93 aa  163  7e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20830  30S ribosomal protein S19  82.61 
 
 
92 aa  162  2e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3139  ribosomal protein S19  82.8 
 
 
93 aa  161  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3754  ribosomal protein S19  80.65 
 
 
93 aa  161  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396407  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2642  SSU ribosomal protein S19P  80.43 
 
 
92 aa  161  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.570508  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2971  30S ribosomal protein S19  81.72 
 
 
93 aa  160  4e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.241839  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0935  ribosomal protein S19  82.61 
 
 
93 aa  160  4e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177983  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0692  30S ribosomal protein S19  80.65 
 
 
93 aa  160  5e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.40634 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2683  30S ribosomal protein S19  81.72 
 
 
93 aa  160  5e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23770  SSU ribosomal protein S19P  81.72 
 
 
93 aa  160  5e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.384617  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2655  ribosomal protein S19  81.72 
 
 
93 aa  160  6e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1189  30S ribosomal protein S19  80.65 
 
 
93 aa  159  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0653663 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17120  30S ribosomal protein S19  80.65 
 
 
93 aa  158  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0814884  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3901  SSU ribosomal protein S19P  78.49 
 
 
93 aa  158  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29700  SSU ribosomal protein S19P  80.65 
 
 
93 aa  157  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0631  ribosomal protein S19  80.65 
 
 
93 aa  157  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0591  30S ribosomal protein S19  80.65 
 
 
93 aa  157  6e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.187847  normal  0.796631 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1711  30S ribosomal protein S19  79.35 
 
 
92 aa  154  5e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.374721  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0258a  30S ribosomal protein S19  79.35 
 
 
92 aa  153  8e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3707  30S ribosomal protein S19  71.74 
 
 
92 aa  147  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3663  30S ribosomal protein S19  75 
 
 
92 aa  146  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.30775e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1827  30S ribosomal protein S19  73.91 
 
 
92 aa  145  2e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  71.74 
 
 
92 aa  144  4e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  7.09655e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0145  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 
92 aa  144  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  2.9175e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0126  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 
92 aa  144  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.97601e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0114  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 
92 aa  144  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  7.93752e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  71.74 
 
 
92 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0114  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 
92 aa  144  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.18397e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0114  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 
92 aa  144  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  3.83993e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0110  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 
92 aa  144  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.16547e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0108  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 
92 aa  144  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  5.59577e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  71.74 
 
 
92 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0402  ribosomal protein S19  72.04 
 
 
93 aa  143  7e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  73.26 
 
 
95 aa  143  7e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 
91 aa  143  7e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0108  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 
92 aa  143  8e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.57453e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1296  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 
92 aa  143  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00413729  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2273  30S ribosomal protein S19  72.83 
 
 
92 aa  142  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  6.81992e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  71.74 
 
 
92 aa  143  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2314  30S ribosomal protein S19  72.83 
 
 
92 aa  142  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  2.75126e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0198  SSU ribosomal protein S19P  79.52 
 
 
94 aa  142  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0174859  normal  0.0509464 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0219  ribosomal protein S19  72.22 
 
 
94 aa  141  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075195  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0062  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 
92 aa  141  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.235454  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  72.04 
 
 
93 aa  140  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2903  ribosomal protein S19  67.78 
 
 
94 aa  140  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0695  30S ribosomal protein S19  71.74 
 
 
92 aa  140  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208226  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2710  30S ribosomal protein S19  69.89 
 
 
93 aa  140  7e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2395  30S ribosomal protein S19  69.89 
 
 
93 aa  140  7e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1903  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 
92 aa  140  8e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2174  ribosomal protein S19  72.53 
 
 
91 aa  140  9e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2615  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 
92 aa  140  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00302204  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2563  30S ribosomal protein S19  72.83 
 
 
92 aa  139  1e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.61073  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2398  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 
92 aa  139  2e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0423225  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0109  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 
92 aa  139  2e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.85939e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  71.74 
 
 
91 aa  138  2e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0135  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 
92 aa  139  2e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  7.77644e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2329  ribosomal protein S19  69.57 
 
 
94 aa  137  4e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  2.39943e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0372  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 
91 aa  137  4e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.252396  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09960  SSU ribosomal protein S19P  71.76 
 
 
86 aa  136  8e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.328032  hitchhiker  1.40006e-06 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1959  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 
91 aa  136  1e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0200  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 
92 aa  135  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.130861  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  69.57 
 
 
92 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0871  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 
93 aa  135  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  2.15821e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16741  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 
91 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2253  SSU ribosomal protein S19P  67.74 
 
 
93 aa  134  3e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  1.03026e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23061  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 
91 aa  135  3e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1570  ribosomal protein S19  71.76 
 
 
95 aa  134  4e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000162931  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17361  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
91 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001738  SSU ribosomal protein S19p (S15e)  69.57 
 
 
92 aa  134  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  3.20584e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2151  SSU ribosomal protein S19P  64.52 
 
 
93 aa  134  6e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152821  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0162  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  133  6e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  7.28304e-05  decreased coverage  4.75067e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0188  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  133  6e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  8.19027e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  134  6e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  1.02796e-06  unclonable  7.23515e-06 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 
91 aa  133  8e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  7.24937e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4052  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  133  9e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  5.00624e-06  unclonable  5.33461e-12 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0152  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  133  9e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  1.2398e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  133  9e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.56834e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0204  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  133  9e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.47318e-05  unclonable  8.36266e-06 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0235  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  133  9e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4313  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  133  9e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.52177e-06  unclonable  4.39739e-11 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3755  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  133  9e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.85402e-08  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>