More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3908 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 180 aa  358  3e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  96.67 
 
 		 180 aa  348  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  72.63 
 
 		 179 aa  273  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0946  50S ribosomal protein L6  75.56 
 
 		 180 aa  272  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.183711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  72.07 
 
 		 179 aa  268  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  72.63 
 
 		 179 aa  267  7e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  72.78 
 
 		 180 aa  266  8.999999999999999e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  72.63 
 
 		 179 aa  266  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  73.18 
 
 		 179 aa  264  4e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  71.67 
 
 		 180 aa  263  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  73.18 
 
 		 178 aa  262  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  72.07 
 
 		 179 aa  262  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  71.51 
 
 		 179 aa  262  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  70.39 
 
 		 179 aa  259  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  70.95 
 
 		 179 aa  255  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  68.72 
 
 		 178 aa  253  7e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  69.83 
 
 		 179 aa  253  7e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  70.39 
 
 		 178 aa  253  8e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  69.27 
 
 		 178 aa  251  6e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  68.72 
 
 		 178 aa  249  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  63.69 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  66.48 
 
 		 179 aa  248  4e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  63.13 
 
 		 179 aa  246  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  64.25 
 
 		 179 aa  245  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  67.6 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23650  LSU ribosomal protein L6P  67.78 
 
 		 180 aa  244  6e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.291924  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  69.44 
 
 		 179 aa  243  8e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  63.13 
 
 		 178 aa  243  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  67.04 
 
 		 178 aa  243  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  66.48 
 
 		 178 aa  240  6e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  63.69 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  63.69 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  63.69 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  66.48 
 
 		 177 aa  236  2e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  63.69 
 
 		 178 aa  235  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  60.23 
 
 		 177 aa  214  7e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4306  ribosomal protein L6  58.6 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  60.89 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  58.33 
 
 		 181 aa  203  9e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  59.09 
 
 		 177 aa  202  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 178 aa  202  3e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  58.33 
 
 		 179 aa  201  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 178 aa  199  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 178 aa  199  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  56.74 
 
 		 177 aa  200  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  54.19 
 
 		 180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  57.46 
 
 		 181 aa  198  3e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  53.89 
 
 		 179 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  55.91 
 
 		 187 aa  198  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0413  ribosomal protein L6  58.89 
 
 		 179 aa  198  3.9999999999999996e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 178 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  56.11 
 
 		 179 aa  195  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  53.59 
 
 		 180 aa  194  8.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  55.91 
 
 		 187 aa  194  8.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  55.56 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  58.01 
 
 		 179 aa  192  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  53.33 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  54.44 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  53.63 
 
 		 178 aa  191  6e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19891  50S ribosomal protein L6  55 
 
 		 179 aa  190  8e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 178 aa  190  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1115  50S ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 179 aa  190  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0730  ribosomal protein L6  56.47 
 
 		 184 aa  189  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  56.67 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  54.44 
 
 		 182 aa  189  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  51.4 
 
 		 178 aa  187  5e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2242  50S ribosomal protein L6  53.33 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343464  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  51.12 
 
 		 177 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  54.84 
 
 		 187 aa  186  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  51.67 
 
 		 179 aa  185  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 180 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  51.11 
 
 		 179 aa  184  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  51.11 
 
 		 179 aa  184  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 177 aa  184  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 177 aa  184  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  53.11 
 
 		 177 aa  184  6e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17261  50S ribosomal protein L6  53.33 
 
 		 179 aa  184  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  55.56 
 
 		 182 aa  184  8e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  54.55 
 
 		 177 aa  184  9e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2218  50S ribosomal protein L6  53.33 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.545954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  51.45 
 
 		 182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1306  50S ribosomal protein L6  50.52 
 
 		 191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  53.33 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  53.85 
 
 		 184 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  50.58 
 
 		 182 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1181  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238097  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  52.91 
 
 		 183 aa  181  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  52.78 
 
 		 179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  52.78 
 
 		 179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2998  50S ribosomal protein L6P  53.59 
 
 		 179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220968  normal  0.0212963 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 178 aa  181  5.0000000000000004e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0862  50S ribosomal protein L6P  52.27 
 
 		 177 aa  181  7e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0120235  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  52.78 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  51.14 
 
 		 177 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl138  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 180 aa  179  2e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 178 aa  179  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1971  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000104023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>