More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3853 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3853  peptidase M22, glycoprotease  100 
 
 
225 aa  422  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4243  peptidase M22 glycoprotease  88.89 
 
 
225 aa  345  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0145677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0562  peptidase M22 glycoprotease  55.87 
 
 
218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.849533  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6548  peptidase M22 glycoprotease  49.34 
 
 
232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1000  peptidase M22 glycoprotease  48.21 
 
 
218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2604  hypothetical protein  47.91 
 
 
231 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6007  peptidase M22 glycoprotease  46.12 
 
 
287 aa  160  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.463097  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04630  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  44.5 
 
 
207 aa  160  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47382  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4931  peptidase M22, glycoprotease  49.3 
 
 
210 aa  153  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1487  peptidase M22, glycoprotease  48.84 
 
 
210 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1176  peptidase M22, glycoprotease  46.95 
 
 
211 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0451061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1149  peptidase M22, glycoprotease  46.48 
 
 
211 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.745666  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1166  peptidase M22, glycoprotease  46.48 
 
 
211 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.533647 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4263  peptidase M22 glycoprotease  48.47 
 
 
230 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0358  peptidase M22, glycoprotease  45.22 
 
 
216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0837171 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0627  peptidase M22, glycoprotease  43.53 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1146  peptidase M22 glycoprotease  44.96 
 
 
227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1714  peptidase M22 glycoprotease  45.79 
 
 
243 aa  143  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4457  peptidase M22 glycoprotease  44.89 
 
 
212 aa  142  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07480  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  46.32 
 
 
225 aa  137  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.308206  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4043  peptidase M22 glycoprotease  43.11 
 
 
225 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0629  peptidase M22 glycoprotease  43.1 
 
 
229 aa  134  9e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147334  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0614  peptidase M22 glycoprotease  43.51 
 
 
240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725915  normal  0.446641 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3663  peptidase M22, glycoprotease  44.25 
 
 
212 aa  132  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13455  hypothetical protein  49.06 
 
 
215 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00396413  hitchhiker  0.000602893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0883  peptidase M22 glycoprotease  42.08 
 
 
191 aa  129  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0111529  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2894  peptidase M22, glycoprotease  43.24 
 
 
223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29230  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  45.85 
 
 
224 aa  126  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2598  peptidase M22 glycoprotease  45.89 
 
 
229 aa  124  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0896201  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2604  peptidase M22 glycoprotease  40.54 
 
 
223 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000523525 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1202  peptidase M22 glycoprotease  38.89 
 
 
248 aa  118  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0675  peptidase M22 glycoprotease  43.1 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.892215  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0731  peptidase M22 glycoprotease  39.83 
 
 
225 aa  96.3  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0874562  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3071  peptidase M22 glycoprotease  42.13 
 
 
222 aa  95.1  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.255887  normal  0.552992 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  29.87 
 
 
236 aa  92  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16700  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  39.64 
 
 
223 aa  91.3  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.568455  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3092  peptidase M22, glycoprotease  37.5 
 
 
215 aa  89.4  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  30.04 
 
 
238 aa  87  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  33.18 
 
 
233 aa  85.5  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  34.39 
 
 
231 aa  85.1  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2015  peptidase M22, glycoprotease  31.65 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.186434  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3738  peptidase M22 glycoprotease  30.17 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23140  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  37.5 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1786  peptidase M22, glycoprotease  32.91 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0677325  normal  0.407437 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  31.53 
 
 
234 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0148  peptidase M22 glycoprotease  31.44 
 
 
228 aa  81.6  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1859  peptidase M22 glycoprotease  34.82 
 
 
237 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2516  hypothetical protein  37.93 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2433  peptidase M22 glycoprotease  34.82 
 
 
237 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1886  peptidase M22 glycoprotease  34.82 
 
 
237 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2146  peptidase M22 glycoprotease  37.93 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.472287  hitchhiker  0.00199457 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1893  peptidase M22 glycoprotease  34.82 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2105  peptidase M22 glycoprotease  30.22 
 
 
239 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279787  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0183  peptidase M22 glycoprotease  25.12 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.128229  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0018  peptidase M22, glycoprotease  34.23 
 
 
232 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0268782  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0464  peptidase M22, glycoprotease  32.48 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.819984  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0011  peptidase M22, glycoprotease  33.93 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0037  peptidase M22 glycoprotease  34.51 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000150711 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2159  peptidase M22, glycoprotease  31.25 
 
 
228 aa  76.3  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287799 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2887  peptidase M22, glycoprotease  30.3 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  32.74 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1939  hypothetical protein  35.22 
 
 
236 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.287611  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0800  peptidase M22 glycoprotease  27.73 
 
 
236 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188587  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02240  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.64 
 
 
781 aa  74.3  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2899  peptidase M22 glycoprotease  31.9 
 
 
234 aa  74.7  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328536 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1747  glycoprotein endopeptidase  30.56 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.3762  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0939  hypothetical protein  27.47 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0042  putative glycoprotease family protein  34.48 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5048  normal  0.440262 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2528  hypothetical protein  29.78 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.721153  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  34.38 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0917  peptidase M22, glycoprotease  33.33 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0734  glycoprotease family protein  28.69 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  31.08 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1725  glycoprotease  42.95 
 
 
229 aa  72.8  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1391  peptidase M22 glycoprotease  26.81 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000832703  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  33.93 
 
 
236 aa  72  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  30.67 
 
 
231 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  31.39 
 
 
233 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1185  putative glycoprotease family protein  28.63 
 
 
239 aa  71.2  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  30.67 
 
 
231 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0586  peptidase M22, glycoprotease  33.33 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  30.67 
 
 
231 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2182  peptidase M22, glycoprotease  34.38 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  31.19 
 
 
456 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1822  peptidase M22 glycoprotease  33.33 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309714  normal  0.168766 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1885  hypothetical protein  31.85 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  32.37 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  29.33 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01960  O-sialoglycoprotein endopeptidase  28.28 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.717624  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  32.89 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  33.04 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  30.22 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  30.22 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1294  peptidase M22 glycoprotease  33.62 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450316  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0015  peptidase M22 glycoprotease  32.73 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00456768  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0347  peptidase M22 glycoprotease  33.59 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  31.39 
 
 
233 aa  68.9  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2854  metalloendopeptidase, glycoprotease family  41.07 
 
 
891 aa  69.3  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.594224  normal  0.241498 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0237  peptidase M22 glycoprotease  31.91 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000016093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>