68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3843 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3843  hypothetical protein  100 
 
 		 428 aa  827    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4233  hypothetical protein  84.88 
 
 		 411 aa  513  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  50.37 
 
 		 388 aa  330  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  53.02 
 
 		 403 aa  309  6.999999999999999e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  49.23 
 
 		 428 aa  302  9e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  47.95 
 
 		 423 aa  300  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  47.99 
 
 		 396 aa  297  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  47.74 
 
 		 400 aa  297  3e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  46.8 
 
 		 407 aa  293  4e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  44.98 
 
 		 418 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  48.67 
 
 		 388 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  42.96 
 
 		 422 aa  273  4.0000000000000004e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  52.19 
 
 		 415 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  45.23 
 
 		 400 aa  270  5e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  43.07 
 
 		 411 aa  265  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000882332 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  41.77 
 
 		 412 aa  265  1e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  43.04 
 
 		 438 aa  261  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  41.71 
 
 		 414 aa  256  6e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  44.39 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  40.69 
 
 		 392 aa  251  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  36.76 
 
 		 385 aa  207  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16610  hypothetical protein  40.84 
 
 		 443 aa  202  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0802  hypothetical protein  38.79 
 
 		 477 aa  194  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5789  hypothetical protein  37.62 
 
 		 487 aa  182  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712723  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07540  hypothetical protein  37.19 
 
 		 474 aa  165  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.559975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3087  hypothetical protein  38.46 
 
 		 416 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000449393  hitchhiker  0.0000364534 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  37.41 
 
 		 382 aa  160  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  33.24 
 
 		 407 aa  156  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  37.14 
 
 		 412 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  37.14 
 
 		 412 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  36.57 
 
 		 399 aa  154  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  34.22 
 
 		 399 aa  153  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  37.13 
 
 		 369 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  35.77 
 
 		 383 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  35.05 
 
 		 372 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2091  hypothetical protein  33 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  33.88 
 
 		 358 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  29.22 
 
 		 420 aa  116  6e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  29.05 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  30.1 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  29.72 
 
 		 419 aa  106  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  26.52 
 
 		 399 aa  96.7  8e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  25.45 
 
 		 385 aa  93.6  6e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  27.7 
 
 		 401 aa  92.4  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2446  methyltransferase  27.43 
 
 		 357 aa  91.7  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.949706  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  27.97 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  26.04 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  26.65 
 
 		 394 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3389  hypothetical protein  22.87 
 
 		 399 aa  53.9  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0324  SAM-dependent methyltransferase  24.12 
 
 		 431 aa  53.9  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2419  hypothetical protein  30.89 
 
 		 212 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2298  hypothetical protein  30.89 
 
 		 212 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1340  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.07 
 
 		 465 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.308627 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01660  conserved hypothetical protein  30.28 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.722392  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3456  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.96 
 
 		 449 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0006  methyltransferase small  39.77 
 
 		 209 aa  45.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.51 
 
 		 463 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0371274  normal  0.891306 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1176  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.51 
 
 		 463 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0393959  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.88 
 
 		 449 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0268238  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3050  methyltransferase type 12  32.12 
 
 		 224 aa  43.9  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  33.04 
 
 		 457 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0349  ribosomal L11 methyltransferase  38.57 
 
 		 336 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.500973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4195  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.78 
 
 		 297 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0028  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  36.56 
 
 		 434 aa  43.5  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  27.73 
 
 		 459 aa  43.5  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3377  methyltransferase small  41.67 
 
 		 245 aa  43.1  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.6 
 
 		 312 aa  43.1  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3004  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  40.74 
 
 		 441 aa  43.1  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>