More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3752 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4134  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  91.04 
 
 		 357 aa  665    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3752  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 		 357 aa  728    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0165343  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5500  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  61.82 
 
 		 358 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1200  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  63.11 
 
 		 354 aa  433  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4301  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.48 
 
 		 367 aa  421  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal  0.667956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1172  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.69 
 
 		 353 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0773  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.7 
 
 		 359 aa  408  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7949  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.54 
 
 		 371 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.26 
 
 		 354 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3899  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.7 
 
 		 354 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0558004  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1160  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.18 
 
 		 369 aa  392  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3022  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.81 
 
 		 351 aa  392  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0998  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.95 
 
 		 371 aa  393  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.25 
 
 		 371 aa  390  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.390833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8429  dipeptidase  58.5 
 
 		 353 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2180  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.48 
 
 		 354 aa  381  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136819  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06290  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.66 
 
 		 358 aa  382  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3855  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.95 
 
 		 359 aa  384  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.43 
 
 		 374 aa  382  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.11 
 
 		 366 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75558  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.02 
 
 		 375 aa  375  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11226  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.29 
 
 		 354 aa  376  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4086  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.11 
 
 		 366 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.875683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4515  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.78 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113007  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4242  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.11 
 
 		 366 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0874  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.83 
 
 		 376 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254055  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3315  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.99 
 
 		 364 aa  363  2e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.621792  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.2 
 
 		 378 aa  361  1e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25960  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.44 
 
 		 359 aa  355  5e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129356  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11210  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.93 
 
 		 370 aa  355  5.999999999999999e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1093  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.88 
 
 		 356 aa  352  4e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1255  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1143  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.57 
 
 		 378 aa  351  1e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.575079  decreased coverage  0.00167008 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.06 
 
 		 397 aa  339  5e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2929  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.86 
 
 		 394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000511731 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15460  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  52.86 
 
 		 378 aa  319  5e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.01 
 
 		 401 aa  302  7.000000000000001e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0594  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.15 
 
 		 356 aa  240  4e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0661  peptidase M20  40.28 
 
 		 344 aa  206  4e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3969  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.28 
 
 		 368 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3891  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.28 
 
 		 368 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3942  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.83 
 
 		 361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0243581 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3828  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.76 
 
 		 368 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5271  peptidase M20  38.97 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0072  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.16 
 
 		 354 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.27 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.07 
 
 		 400 aa  106  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  29.58 
 
 		 378 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  27.83 
 
 		 412 aa  96.3  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0420  putative acetylornithine deacetylase  25.39 
 
 		 382 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.69 
 
 		 388 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  28.84 
 
 		 385 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0171  peptidase M20  26.06 
 
 		 341 aa  90.1  5e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  25.42 
 
 		 379 aa  89.7  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  25.13 
 
 		 403 aa  89  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  26.06 
 
 		 416 aa  89  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0287  peptidase M20  28.49 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  29.08 
 
 		 368 aa  88.6  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  27.4 
 
 		 380 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  26.3 
 
 		 382 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  28.3 
 
 		 428 aa  87.4  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  30.38 
 
 		 399 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.8 
 
 		 387 aa  86.7  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0331  acetylornithine deacetylase (ArgE)  24.94 
 
 		 388 aa  87  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.66 
 
 		 402 aa  86.7  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  29.87 
 
 		 387 aa  86.3  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  29.1 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  26.87 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  28.15 
 
 		 398 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  27.53 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4203  peptidase M20  26.77 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0267175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  29.02 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  30.07 
 
 		 364 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  26.56 
 
 		 446 aa  84.7  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0769  acetylornithine deacetylase  26.01 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  29.83 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  30 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  25.63 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  28.72 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  26.96 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  25.73 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3515  peptidase M20  29.38 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1291  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.39 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  24.87 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  25 
 
 		 383 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  25.66 
 
 		 383 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  25.66 
 
 		 383 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  25.66 
 
 		 383 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  25.66 
 
 		 383 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  25.46 
 
 		 383 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  25.66 
 
 		 383 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  25.66 
 
 		 383 aa  81.6  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.23 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  28.07 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  26.98 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3920  acetylornithine deacetylase  27.45 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  25.21 
 
 		 383 aa  80.5  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3087  acetylornithine deacetylase  24.65 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  26.49 
 
 		 383 aa  80.5  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.65 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.97 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>