More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3750 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3750  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  354  2.9999999999999997e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226065  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4132  hypothetical protein  90.61 
 
 		 181 aa  298  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3024  hypothetical protein  50.86 
 
 		 191 aa  197  7e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.695841 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3840  hypothetical protein  50.29 
 
 		 201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.054425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1174  hypothetical protein  54.24 
 
 		 197 aa  182  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0253429  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0775  hypothetical protein  52 
 
 		 180 aa  181  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4238  hypothetical protein  50 
 
 		 188 aa  175  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0727087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4008  hypothetical protein  50 
 
 		 188 aa  175  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4082  hypothetical protein  50 
 
 		 188 aa  175  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0271621  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1162  hypothetical protein  51.72 
 
 		 182 aa  174  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3313  hypothetical protein  55.11 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8427  hypothetical protein  55.43 
 
 		 195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0876  hypothetical protein  51.15 
 
 		 198 aa  170  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4873  hypothetical protein  44.83 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3285  hypothetical protein  45.71 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11229  hypothetical protein  50 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4511  hypothetical protein  48.54 
 
 		 185 aa  158  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.261893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3118  hypothetical protein  52.11 
 
 		 207 aa  152  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0494504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1841  hypothetical protein  48.88 
 
 		 198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.086843  normal  0.221662 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1763  hypothetical protein  51.39 
 
 		 197 aa  151  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1959  hypothetical protein  51.39 
 
 		 197 aa  151  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2184  hypothetical protein  50.29 
 
 		 187 aa  151  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000227609  normal  0.582537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4168  hypothetical protein  44.75 
 
 		 195 aa  151  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0881208  normal  0.0325962 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  47.88 
 
 		 193 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  47.4 
 
 		 193 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  47.4 
 
 		 193 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  46.82 
 
 		 193 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  48.39 
 
 		 195 aa  147  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  48.39 
 
 		 195 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2389  hypothetical protein  43.98 
 
 		 193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.259885  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0098  hypothetical protein  46.5 
 
 		 193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  48.39 
 
 		 195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4700  hypothetical protein  41.14 
 
 		 204 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2312  hypothetical protein  44.63 
 
 		 194 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  46.41 
 
 		 190 aa  145  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1149  hypothetical protein  42.7 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2190  hypothetical protein  45.66 
 
 		 194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  45.4 
 
 		 195 aa  144  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  45.4 
 
 		 195 aa  144  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2215  hypothetical protein  46.5 
 
 		 211 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.548761  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2252  hypothetical protein  42.37 
 
 		 201 aa  142  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1815  hypothetical protein  43.65 
 
 		 193 aa  141  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  43.03 
 
 		 194 aa  141  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1392  hypothetical protein  40.35 
 
 		 177 aa  141  5e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.11461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0660  hypothetical protein  42.61 
 
 		 195 aa  141  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669622  hitchhiker  0.000933875 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  43.35 
 
 		 194 aa  141  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2311  hypothetical protein  43.1 
 
 		 200 aa  140  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  48.08 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01195  hypothetical protein  45.86 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2031  hypothetical protein  43.35 
 
 		 194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136898  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0545  hypothetical protein  41.01 
 
 		 195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635717  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  43.18 
 
 		 194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3199  hypothetical protein  50.29 
 
 		 196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3142  hypothetical protein  41.01 
 
 		 193 aa  138  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.585189  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  43.18 
 
 		 194 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1004  hypothetical protein  41.81 
 
 		 193 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1319  hypothetical protein  42.2 
 
 		 194 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233666  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  43.5 
 
 		 194 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1086  hypothetical protein  42.51 
 
 		 178 aa  138  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1264  decarboxylase family protein  41.48 
 
 		 195 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506923  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1271  decarboxylase family protein  42.05 
 
 		 195 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1858  decarboxylase family protein  41.48 
 
 		 195 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1409  hypothetical protein  41.48 
 
 		 195 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0306959  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1104  decarboxylase family protein  41.48 
 
 		 195 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0387  decarboxylase family protein  41.48 
 
 		 195 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0762  decarboxylase family protein  41.48 
 
 		 195 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1153  hypothetical protein  40.78 
 
 		 184 aa  137  7e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1036  hypothetical protein  40.91 
 
 		 195 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553663  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1767  putative lysine carboxylase  42.69 
 
 		 179 aa  136  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  45.1 
 
 		 192 aa  136  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3769  hypothetical protein  45.4 
 
 		 440 aa  136  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.96163  normal  0.0729973 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2362  hypothetical protein  41.52 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2645  hypothetical protein  39.66 
 
 		 191 aa  136  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0937  hypothetical protein  41.07 
 
 		 194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  41.04 
 
 		 193 aa  135  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1711  hypothetical protein  42.53 
 
 		 203 aa  134  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  45.86 
 
 		 193 aa  134  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.507928 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1143  hypothetical protein  39.11 
 
 		 181 aa  133  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2080  hypothetical protein  43.35 
 
 		 193 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.723086  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0689  hypothetical protein  41.57 
 
 		 204 aa  133  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1612  hypothetical protein  43.31 
 
 		 197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103508 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4702  hypothetical protein  40 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3041  hypothetical protein  50.72 
 
 		 180 aa  132  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.489889  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  37.06 
 
 		 186 aa  132  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1177  hypothetical protein  39.66 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2694  hypothetical protein  43.59 
 
 		 184 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1351  hypothetical protein  43.04 
 
 		 184 aa  131  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  0.0642943 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0357  hypothetical protein  43.75 
 
 		 198 aa  131  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0971  hypothetical protein  42.14 
 
 		 199 aa  131  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0184456  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1232  hypothetical protein  43.51 
 
 		 201 aa  131  6e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119538  lysine decarboxylase-related protein  42.58 
 
 		 194 aa  131  6e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0148223  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1491  hypothetical protein  43.51 
 
 		 200 aa  130  6.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1475  hypothetical protein  39.34 
 
 		 206 aa  130  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.814615  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  42.68 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1920  hypothetical protein  39.33 
 
 		 225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341643 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2975  hypothetical protein  41.88 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000170346  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1025  hypothetical protein  40.88 
 
 		 207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3133  hypothetical protein  41.38 
 
 		 193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2404  hypothetical protein  39.77 
 
 		 200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000021397  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1896  hypothetical protein  38.76 
 
 		 230 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.508634  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>