78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3729 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0941  hypothetical protein  43.13 
 
 		 1001 aa  716    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13213  hypothetical protein  42.13 
 
 		 992 aa  644    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1193  protein of unknown function UPF0182  41.29 
 
 		 1019 aa  650    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111199  normal  0.0369409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3729  hypothetical protein  100 
 
 		 994 aa  2017    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4654  hypothetical protein  41.42 
 
 		 1004 aa  685    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0945  hypothetical protein  44.54 
 
 		 1035 aa  715    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203937  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1469  hypothetical protein  41.89 
 
 		 1001 aa  676    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2952  hypothetical protein  43.63 
 
 		 972 aa  743    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0447926  normal  0.518899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1814  hypothetical protein  41.83 
 
 		 1002 aa  674    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.693843  normal  0.0180395 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1433  hypothetical protein  41.69 
 
 		 1003 aa  674    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1530  hypothetical protein  42.32 
 
 		 1004 aa  659    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4110  hypothetical protein  92.88 
 
 		 993 aa  1840    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4377  hypothetical protein  43.88 
 
 		 992 aa  815    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2471  protein of unknown function UPF0182  40.42 
 
 		 985 aa  690    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000003677 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2749  hypothetical protein  41.27 
 
 		 1006 aa  681    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.179531  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14990  hypothetical protein  39.68 
 
 		 1047 aa  636    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.589114  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07660  hypothetical protein  42.86 
 
 		 988 aa  712    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.580652  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0725  protein of unknown function UPF0182  39.38 
 
 		 1018 aa  657    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1415  hypothetical protein  41.69 
 
 		 1003 aa  674    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1599  protein of unknown function UPF0182  44.65 
 
 		 982 aa  687    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.217724  normal  0.364231 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3781  hypothetical protein  44.96 
 
 		 1018 aa  716    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.568022  normal  0.0630741 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3487  protein of unknown function UPF0182  40.64 
 
 		 994 aa  654    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.879068  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3730  protein of unknown function UPF0182  45.07 
 
 		 968 aa  736    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.155339  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3795  protein of unknown function UPF0182  42.08 
 
 		 1007 aa  672    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.214749  normal  0.0401617 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27470  hypothetical protein  41.09 
 
 		 1012 aa  675    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8343  hypothetical protein  44.1 
 
 		 983 aa  773    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.715387 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0541  hypothetical protein  40.33 
 
 		 1018 aa  704    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4222  protein of unknown function UPF0182  48.89 
 
 		 985 aa  836    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19060  hypothetical protein  40.13 
 
 		 1045 aa  629  1e-179  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.569882  normal  0.89532 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0793  protein of unknown function UPF0182  38.93 
 
 		 1007 aa  623  1e-177  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2461  protein of unknown function UPF0182  42.01 
 
 		 1000 aa  615  9.999999999999999e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.947136  hitchhiker  0.00000899121 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19540  hypothetical protein  37.15 
 
 		 1029 aa  611  1e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.139911  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2885  protein of unknown function UPF0182  42.16 
 
 		 980 aa  610  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00214299 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7927  protein of unknown function UPF0182  39.89 
 
 		 962 aa  575  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3037  protein of unknown function UPF0182  37.45 
 
 		 985 aa  550  1e-155  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0653  hypothetical protein  35.25 
 
 		 1016 aa  543  1e-153  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.523938 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0780  Na+-driven multidrug efflux pump  34.01 
 
 		 1079 aa  528  1e-148  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2146  protein of unknown function UPF0182  31.89 
 
 		 912 aa  496  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00758786 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10710  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  31 
 
 		 917 aa  489  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4385  hypothetical protein  31.1 
 
 		 919 aa  484  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.182735 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1797  hypothetical protein  31.96 
 
 		 932 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1161  hypothetical protein  32.2 
 
 		 914 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.100714  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1871  protein of unknown function UPF0182  31.46 
 
 		 949 aa  457  1e-127  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.204028  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1139  hypothetical protein  33.12 
 
 		 909 aa  453  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.827602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10064  transmembrane protein  42.07 
 
 		 672 aa  446  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.849211 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3465  protein of unknown function UPF0182  32.89 
 
 		 896 aa  445  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2333  hypothetical protein  32.29 
 
 		 894 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.280552  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1115  hypothetical protein  33.47 
 
 		 930 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0902  hypothetical protein  30.7 
 
 		 892 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2777  protein of unknown function UPF0182  32.11 
 
 		 960 aa  425  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.740282  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2689  hypothetical protein  30.84 
 
 		 890 aa  423  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.958793  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3567  hypothetical protein  30.56 
 
 		 900 aa  419  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00412787  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2279  protein of unknown function UPF0182  31.39 
 
 		 896 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000442741 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0814  protein of unknown function UPF0182  30.4 
 
 		 891 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.297672  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1951  hypothetical protein  32.56 
 
 		 988 aa  404  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1303  hypothetical protein  31.34 
 
 		 899 aa  387  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.939701  normal  0.0211961 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0011  hypothetical protein  27.54 
 
 		 918 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0938  hypothetical protein  31.08 
 
 		 1019 aa  382  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0011  hypothetical protein  27.45 
 
 		 918 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3693  hypothetical protein  31.61 
 
 		 996 aa  378  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0698  protein of unknown function UPF0182  28.44 
 
 		 945 aa  373  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00837363  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4155  hypothetical protein  31.31 
 
 		 1004 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4195  hypothetical protein  31 
 
 		 1004 aa  370  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0961  hypothetical protein  28.45 
 
 		 872 aa  366  1e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0949388  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2722  hypothetical protein  30.51 
 
 		 991 aa  358  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177747  hitchhiker  0.000114433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5177  hypothetical protein  28.59 
 
 		 1009 aa  351  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197253 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0908  protein of unknown function UPF0182  27.57 
 
 		 945 aa  350  7e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.747504  hitchhiker  0.000109139 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1700  protein of unknown function UPF0182  31.94 
 
 		 893 aa  350  1e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0693  protein of unknown function UPF0182  27.93 
 
 		 909 aa  344  4e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2137  hypothetical protein  30.51 
 
 		 874 aa  337  7e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0489156 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1783  hypothetical protein  29.68 
 
 		 955 aa  331  5.0000000000000004e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.890136  normal  0.25047 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2716  hypothetical protein  30.51 
 
 		 992 aa  324  5e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.107653  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14611  hypothetical protein  31.53 
 
 		 950 aa  322  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.62237 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0967  protein of unknown function UPF0182  29.56 
 
 		 959 aa  310  5.9999999999999995e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000819285  normal  0.392007 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1151  hypothetical protein  29.35 
 
 		 932 aa  295  3e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1323  hypothetical protein  31.49 
 
 		 914 aa  280  1e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.707425  normal  0.117445 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10063  transmembrane protein  40.26 
 
 		 346 aa  177  8e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.477127  normal  0.782331 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0067  hypothetical protein  24.37 
 
 		 953 aa  70.1  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>