More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3636 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3636  ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 		 259 aa  513  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4018  ATP synthase F0, A subunit  59.77 
 
 		 265 aa  297  9e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457408  decreased coverage  0.0000501156 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1310  ATP synthase F0 subunit A  53.03 
 
 		 265 aa  271  5.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29610  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  47.13 
 
 		 272 aa  217  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4142  ATP synthase F0, A subunit  46.83 
 
 		 275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2119  ATP synthase F0, A subunit  39.33 
 
 		 270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00507952  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09970  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  45.02 
 
 		 294 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18260  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  41.2 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.469356  normal  0.320479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  42 
 
 		 283 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1757  ATP synthase F0, A subunit  40.54 
 
 		 276 aa  171  7.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.731668  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3922  ATP synthase F0, A subunit  41.81 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2454  ATP synthase F0, A subunit  39.68 
 
 		 272 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2344  F0F1 ATP synthase subunit A  40.32 
 
 		 266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801138 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  39.84 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1665  F0F1 ATP synthase subunit A  38.78 
 
 		 263 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1129  F0F1 ATP synthase subunit A  38.25 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1066  ATP synthase F0, A subunit  39.85 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  36.9 
 
 		 295 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1301  ATP synthase F0, A subunit  36.65 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2413  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  37.5 
 
 		 285 aa  158  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  40.25 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6142  ATP synthase F0, A subunit  36.25 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1264  ATP synthase F0, A subunit  37.1 
 
 		 262 aa  156  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0894  ATP synthase F0 subunit A  36.9 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2611  F0F1 ATP synthase subunit A  37.55 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.183518  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  37.79 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08120  F0F1 ATP synthase subunit A  34.77 
 
 		 266 aa  149  6e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.823185  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0330  ATP synthase F0, A subunit  40.09 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0142  ATP synthase F0, A subunit  36.64 
 
 		 284 aa  138  7.999999999999999e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1801  ATP synthase F0, A subunit  37.55 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4624  ATP synthase F0, A subunit  34.52 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  32.55 
 
 		 263 aa  111  9e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  36.55 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  37.28 
 
 		 260 aa  109  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  34.73 
 
 		 251 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  33.77 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  33.77 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  34.35 
 
 		 251 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  36 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  33.77 
 
 		 251 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  36.89 
 
 		 261 aa  105  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  33.77 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4377  F0F1 ATP synthase subunit A  34.6 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  36.44 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2098  F0F1 ATP synthase subunit A  30.34 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  33.19 
 
 		 241 aa  99  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  36.19 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  34.35 
 
 		 248 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  32.61 
 
 		 250 aa  95.9  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  34.08 
 
 		 247 aa  95.9  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1515  ATP synthase F0, A subunit  30.47 
 
 		 248 aa  95.5  7e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000105454 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  29.6 
 
 		 303 aa  95.5  7e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4483  F0F1 ATP synthase subunit A  34.02 
 
 		 261 aa  95.5  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  34.45 
 
 		 248 aa  95.1  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  33.48 
 
 		 364 aa  95.5  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  30.47 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  30.47 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  30.25 
 
 		 373 aa  94.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  31.65 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  30.04 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  34.63 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  33.33 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  34.68 
 
 		 247 aa  93.2  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  33.02 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0064  F0F1 ATP synthase subunit A  30.13 
 
 		 345 aa  92.8  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  36.97 
 
 		 249 aa  92.4  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  30.38 
 
 		 268 aa  92  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  35.61 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  35.05 
 
 		 373 aa  90.9  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  27.8 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  29.54 
 
 		 342 aa  90.9  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  34.12 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  34.12 
 
 		 249 aa  90.5  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  34.82 
 
 		 250 aa  90.1  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  34.12 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  33.66 
 
 		 250 aa  88.6  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  33.49 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  31.86 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  33.48 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  32.57 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4487  F0F1 ATP synthase subunit A  32.46 
 
 		 406 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.553444  normal  0.0963007 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0554  F0F1 ATP synthase subunit A  34.29 
 
 		 250 aa  86.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03040  putative ATP synthase A chain  31.09 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0512  F0F1 ATP synthase subunit A  35.24 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0179  ATP synthase, subunit A (H(+)-transporting two-sector ATPase)  33.33 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.412196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  30.87 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  31.39 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  28.93 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2594  F0F1 ATP synthase subunit A  31.44 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546841 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0311  ATP synthase F0, A subunit  34.69 
 
 		 400 aa  82  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00150281  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  29.79 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  30.74 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2879  F0F1 ATP synthase subunit A  31.88 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.775771  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1718  ATP synthase F0, A subunit  33.81 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0314608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2885  F0F1 ATP synthase subunit A  27.87 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677372  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0516  F0F1 ATP synthase subunit A  29.22 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000641483  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  26.96 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  29.73 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  29.28 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  31.1 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>