More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3607 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 300 aa  584  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  93.4 
 
 		 300 aa  474  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  55.18 
 
 		 299 aa  279  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  56.02 
 
 		 299 aa  278  6e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  52.6 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  49.51 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6079  thioredoxin domain protein  51.69 
 
 		 326 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  52.19 
 
 		 321 aa  227  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1954  Thioredoxin domain protein  47.71 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1333  Thioredoxin domain protein  45.68 
 
 		 311 aa  215  7e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0921  thioredoxin domain-containing protein  46.03 
 
 		 301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.460441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  47.57 
 
 		 337 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  49.43 
 
 		 329 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  51.02 
 
 		 331 aa  206  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1704  thioredoxin domain protein  39.81 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1092  Thioredoxin domain protein  45.05 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.509026  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2342  thioredoxin domain-containing protein  40.66 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299917  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  38.81 
 
 		 293 aa  172  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  39.16 
 
 		 293 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3862  thioredoxin domain-containing protein  41.56 
 
 		 299 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3848  thioredoxin domain-containing protein  41.56 
 
 		 299 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3936  thioredoxin domain-containing protein  41.56 
 
 		 299 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11356  thioredoxin  38.98 
 
 		 304 aa  169  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4303  thioredoxin domain-containing protein  38.36 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408854  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2594  thioredoxin domain-containing protein  38.17 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.238157  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1730  putative thioredoxin domain-containing protein  41.07 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  39.78 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0364  putative thioredoxin  40.77 
 
 		 320 aa  156  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1282  Thioredoxin domain  45.79 
 
 		 319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00790933  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  33.45 
 
 		 324 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  33.1 
 
 		 324 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2327  thioredoxin domain protein  37.55 
 
 		 334 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128937 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1268  Thioredoxin domain protein  41.26 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  35.29 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  35.27 
 
 		 306 aa  146  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1804  thioredoxin domain-containing protein  38.61 
 
 		 314 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2422  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.23 
 
 		 319 aa  145  9e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  32.87 
 
 		 334 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  32.35 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  37.72 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3098  thioredoxin  43.68 
 
 		 333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032408  hitchhiker  0.0000022841 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  35.15 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  36.62 
 
 		 285 aa  136  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  34.53 
 
 		 281 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  32.76 
 
 		 302 aa  135  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  34.64 
 
 		 281 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  36.2 
 
 		 280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  32.89 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10300  thioredoxin domain-containing protein  36.34 
 
 		 313 aa  132  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  33.66 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  35.23 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  32.41 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  32.69 
 
 		 310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  32.86 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  34.4 
 
 		 282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  31.94 
 
 		 317 aa  129  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  34.59 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  34.83 
 
 		 326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  33.9 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  33.33 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  41.62 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  31.06 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  34.39 
 
 		 280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  33.68 
 
 		 304 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  35.66 
 
 		 282 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  35.71 
 
 		 235 aa  125  6e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  35.66 
 
 		 282 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2392  putative thioredoxin  38.22 
 
 		 309 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  30.22 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  47.76 
 
 		 918 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  31.83 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  33.1 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  33.1 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  33.56 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  32.76 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  33.1 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  43.79 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  43.03 
 
 		 277 aa  123  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09500  thioredoxin domain-containing protein  33.04 
 
 		 346 aa  123  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.460116  normal  0.88242 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  32.77 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  47.76 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  33.45 
 
 		 282 aa  123  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  47.76 
 
 		 282 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  47.76 
 
 		 282 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  31.49 
 
 		 329 aa  122  7e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  34.75 
 
 		 282 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  44.9 
 
 		 282 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  30.82 
 
 		 305 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  31.01 
 
 		 310 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  32.64 
 
 		 304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0979  thioredoxin domain-containing protein  29.48 
 
 		 263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.248497  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  32.64 
 
 		 304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  32.38 
 
 		 282 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  32.2 
 
 		 306 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 286 aa  119  7.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  53.47 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  33.8 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  31.31 
 
 		 338 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  30.07 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  32.62 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>