102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3509 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3509  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 116 aa  231  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3885  ArsR family transcriptional regulator  89.66 
 
 		 116 aa  209  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11439  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1887  ArsR family transcriptional regulator  57.43 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3194  transcriptional regulator, ArsR family  57.29 
 
 		 115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.847871  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1455  transcriptional regulator, ArsR family  57.3 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9201  ArsR family transcriptional regulator  53.64 
 
 		 109 aa  107  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.437211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1954  transcriptional regulator, ArsR family  50.93 
 
 		 108 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0543134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8713  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0202623  normal  0.015145 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0641  hypothetical protein  49.15 
 
 		 72 aa  68.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1488  regulatory protein ArsR  36.73 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.486972  normal  0.347049 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3558  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.406985 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1101  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00196595  hitchhiker  0.000145009 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1986  transcriptional regulator, TrmB  34.15 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  37.93 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0836  regulatory protein, ArsR  31.18 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0433  regulatory protein, ArsR  35.8 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 101 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1561  regulatory protein ArsR  32.98 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.442352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3867  regulatory protein ArsR  41.43 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248206  normal  0.706318 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  32.32 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0888  regulatory protein ArsR  29.41 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.844031  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0909  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 228 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000018626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1330  regulatory protein, ArsR  35.62 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  42.25 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  31.31 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2632  ArsR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 169 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2718  regulatory protein, ArsR  34.34 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1222  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 300 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  30.3 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  45.61 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  36.07 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4551  regulatory protein ArsR  34.02 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  27.78 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2592  regulatory protein ArsR  38.96 
 
 		 123 aa  43.5  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.108396 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  42.35 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1374  transcriptional regulator, MarR family  38.36 
 
 		 218 aa  43.9  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.650648  normal  0.319866 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 192 aa  42.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2441  transcriptional regulator, ArsR family  34.25 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.372418  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1634  transcriptional regulator, ArsR family  40.3 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1776  transcriptional regulator, ArsR family  34.25 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372525 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  46.55 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  46.67 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  32.08 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3531  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 339 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  27.55 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2666  FHA domain-containing protein  27.72 
 
 		 263 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 125 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 317 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1723  transcriptional regulator  30.86 
 
 		 95 aa  42  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000132397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  34.85 
 
 		 92 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3245  transcriptional regulator, ArsR family  36.76 
 
 		 208 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  30.3 
 
 		 119 aa  42  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  31.58 
 
 		 106 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 114 aa  41.2  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  35.29 
 
 		 699 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2973  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 		 207 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226444  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  40.62 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0045  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  31.25 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  30.77 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  35 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  29.87 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  30.26 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3317  transcriptional regulator, TrmB  36.62 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  33.71 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2309  regulatory protein ArsR  33.8 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  36.25 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  30.26 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  32.53 
 
 		 104 aa  40.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  31.87 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  35.38 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  33.8 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 115 aa  40  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16640  hypothetical protein  34.55 
 
 		 266 aa  40.4  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.836167 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>