More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3506 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  100 
 
 		 274 aa  552  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  91.54 
 
 		 274 aa  507  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  29.93 
 
 		 267 aa  142  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  37.77 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  36.65 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  36.96 
 
 		 258 aa  135  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 287 aa  125  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2305  transcriptional regulator, MerR family  32.59 
 
 		 268 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.643594 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  33.94 
 
 		 286 aa  122  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 270 aa  122  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20290  predicted transcriptional regulator  31.88 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0400625  normal  0.347976 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  31.7 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  27.68 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  29.6 
 
 		 274 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  31.29 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  26.47 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  27.31 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1424  MerR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  25.45 
 
 		 273 aa  105  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 270 aa  105  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  31.93 
 
 		 286 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  26.18 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 269 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 269 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  29.63 
 
 		 276 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 269 aa  102  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 270 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 269 aa  102  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  26.67 
 
 		 269 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  29.2 
 
 		 264 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  27.82 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  30.15 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 		 281 aa  99.4  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  31.79 
 
 		 269 aa  98.6  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  27.74 
 
 		 273 aa  97.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 287 aa  96.7  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  25.45 
 
 		 269 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 276 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  25.36 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 276 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1629  transcriptional regulator, MerR family  30.6 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal  0.393491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4623  transcriptional regulator, MerR family  32.01 
 
 		 297 aa  93.2  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 290 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 276 aa  92  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  28.47 
 
 		 275 aa  92  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  24.82 
 
 		 276 aa  92  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  28.62 
 
 		 272 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  30.58 
 
 		 276 aa  90.1  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 265 aa  89.4  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  24.11 
 
 		 276 aa  89  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 276 aa  88.6  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 289 aa  88.6  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1231  transcription activator effector binding  40.18 
 
 		 155 aa  89  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0816033 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  25 
 
 		 276 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  29.01 
 
 		 293 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  25.09 
 
 		 280 aa  87.8  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 272 aa  87  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  28.78 
 
 		 270 aa  86.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  26.76 
 
 		 271 aa  85.5  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1364  hypothetical protein  31.58 
 
 		 152 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.33275  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2109  transcription activator, effector binding  32.09 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.309412  normal  0.0724645 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1754  transcriptional regulator, MerR family  25.19 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.99712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  24.15 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2402  transcriptional regulator, MerR family  29.97 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290341  hitchhiker  0.00583984 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  29.24 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0479  MerR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8866  putative transcriptional regulator, MerR family  30.49 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249264  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1974  transcriptional regulator, MerR family  31.9 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000269645  unclonable  0.0000000367636 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1206  transcription activator, effector binding  36.84 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0888  transcriptional regulator, MerR family  33.93 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00108118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22770  predicted transcriptional regulator  55.56 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  27.06 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  39.32 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0345  transcription activator effector binding  28.77 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0318  transcription activator effector binding  28.28 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  38.61 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1410  MerR family transcriptional regulator  21.58 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  27.78 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2311  putative transcriptional regulator, MerR family  41.51 
 
 		 399 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0593  transcription activator, effector binding  28.17 
 
 		 153 aa  67  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  43.93 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3263  transcription activator effector binding  28.75 
 
 		 151 aa  65.1  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  27.46 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4131  transcriptional activator ligand binding domain protein  30.77 
 
 		 154 aa  65.1  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>