More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3481 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3481  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
104 aa  206  8e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0592403  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3860  50S ribosomal protein L21  98.08 
 
 
104 aa  203  6e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  hitchhiker  0.00226444 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  79.61 
 
 
103 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  75 
 
 
104 aa  154  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1187  ribosomal protein L21  73.27 
 
 
103 aa  154  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2059  ribosomal protein L21  72.73 
 
 
103 aa  149  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2635  50S ribosomal protein L21  70.71 
 
 
107 aa  141  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.159083  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12469  50S ribosomal protein L21  71 
 
 
104 aa  141  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.999566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5260  50S ribosomal protein L21  66.35 
 
 
105 aa  140  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3555  50S ribosomal protein L21  70.71 
 
 
103 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786701  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3550  50S ribosomal protein L21  70.71 
 
 
103 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3623  50S ribosomal protein L21  70.71 
 
 
103 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3946  50S ribosomal protein L21  70.71 
 
 
107 aa  139  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664531  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1473  ribosomal protein L21  68 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.447954  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1220  50S ribosomal protein L21  65.38 
 
 
105 aa  139  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1588  ribosomal protein L21  66.02 
 
 
103 aa  137  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00538788  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12500  LSU ribosomal protein L21P  68 
 
 
104 aa  134  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2260  ribosomal protein L21  61 
 
 
102 aa  122  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2460  50S ribosomal protein L21  57.69 
 
 
104 aa  121  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2145  50S ribosomal protein L21  59 
 
 
102 aa  120  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.69528e-18 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1547  ribosomal protein L21  55.77 
 
 
104 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00649345  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11540  LSU ribosomal protein L21P  54.9 
 
 
102 aa  117  6e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.536091  normal  0.231527 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3451  50S ribosomal protein L21  59.41 
 
 
102 aa  116  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147626  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2391  50S ribosomal protein L21  57 
 
 
102 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0526513  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7272  50S ribosomal protein L21  56.73 
 
 
110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0756  50S ribosomal protein L21P  57.69 
 
 
136 aa  114  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.984095  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2283  ribosomal protein L21  65 
 
 
106 aa  114  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293262  hitchhiker  0.000417137 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18270  LSU ribosomal protein L21P  54.46 
 
 
102 aa  114  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755051  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1622  ribosomal protein L21  58.42 
 
 
101 aa  113  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.823278  normal  0.700415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7271  50S ribosomal protein L21P  57.43 
 
 
100 aa  113  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11400  LSU ribosomal protein L21P  62 
 
 
106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103652  hitchhiker  0.00107397 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3380  ribosomal protein L21  50.98 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1652  ribosomal protein L21  61 
 
 
102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324409 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2664  ribosomal protein L21  56 
 
 
114 aa  106  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2182  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 
103 aa  105  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  50 
 
 
116 aa  105  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3457  ribosomal protein L21  55 
 
 
103 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543673  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
104 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1616  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 
102 aa  101  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000151262  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10110  LSU ribosomal protein L21P  48.51 
 
 
101 aa  100  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.56595  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  48.04 
 
 
102 aa  96.3  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 
104 aa  95.5  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  47.52 
 
 
102 aa  95.1  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  45.63 
 
 
103 aa  94  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2216  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
99 aa  94  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.824746  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 
104 aa  93.6  9e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  44.55 
 
 
105 aa  92.8  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  92  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
102 aa  92.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 
102 aa  91.3  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 
102 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  89  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  45.1 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  89  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  43.69 
 
 
104 aa  89  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2576  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 
103 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  47.57 
 
 
114 aa  88.2  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  47.06 
 
 
104 aa  87.8  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  47.52 
 
 
103 aa  87.8  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  46.08 
 
 
103 aa  87.8  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  47.62 
 
 
115 aa  87.4  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  87.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 
104 aa  87.4  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  87.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  87.4  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  46.67 
 
 
115 aa  87  7e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3622  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 
103 aa  86.7  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000442245  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2704  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  87  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000637379  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
102 aa  85.9  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
101 aa  85.5  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  39.81 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000125607  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  39.81 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  44.12 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3738  50S ribosomal protein L21  37.86 
 
 
103 aa  84.7  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000915025  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  43.4 
 
 
104 aa  85.5  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>