More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3473 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3473  iojap-like protein  100 
 
 
132 aa  261  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3853  iojap-like protein  97.67 
 
 
133 aa  228  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.782657  hitchhiker  0.00260799 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1555  iojap-like protein  67.8 
 
 
139 aa  161  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116764  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2170  Iojap-related protein  72.03 
 
 
134 aa  158  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186283  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1821  iojap-like protein  62.79 
 
 
127 aa  157  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.383706  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3359  iojap-like protein  65.52 
 
 
132 aa  154  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.573704  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3449  iojap-like protein  71.68 
 
 
138 aa  153  9e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.467632  normal  0.645308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3534  iojap-like protein  59.23 
 
 
133 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3529  Iojap-related protein  61.54 
 
 
122 aa  150  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3602  iojap-like protein  61.54 
 
 
122 aa  150  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158813  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2250  iojap-like protein  58.47 
 
 
130 aa  146  8e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5246  iojap-like protein  69.17 
 
 
144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.378223  normal  0.556736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7257  iojap-like protein  65.83 
 
 
173 aa  145  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2452  iojap-like protein  65.25 
 
 
134 aa  142  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.344945  normal  0.138235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7260  hypothetical protein  66.67 
 
 
135 aa  140  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00000500377  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3193  iojap-like protein  61.02 
 
 
120 aa  140  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1198  iojap-like protein  63.56 
 
 
148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1509  iojap-like protein  62.2 
 
 
137 aa  137  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0462296  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5475  iojap-like protein  63.92 
 
 
141 aa  137  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219146  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2383  iojap-like protein  61.02 
 
 
133 aa  135  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00906189  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2137  iojap-like protein  61.9 
 
 
129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000149501 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2274  iojap-like protein  62.07 
 
 
127 aa  133  8e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000201224  hitchhiker  0.000438261 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2807  iojap-like protein  59.48 
 
 
135 aa  131  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.649209  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2654  iojap-like protein  61.54 
 
 
120 aa  131  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12550  iojap-related protein  67.39 
 
 
135 aa  131  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.679587  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18190  iojap-related protein  56.35 
 
 
125 aa  131  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.131232  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12448  hypothetical protein  56.15 
 
 
126 aa  130  6e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.873041 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0764  iojap-like protein  64.41 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.589269  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1607  iojap-like protein  69.17 
 
 
191 aa  128  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186987  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3925  iojap-like protein  62.77 
 
 
121 aa  128  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436955  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1641  iojap-like protein  54.31 
 
 
141 aa  126  8.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660201 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1233  Iojap-related protein  70 
 
 
196 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11480  iojap-related protein  61.21 
 
 
148 aa  124  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  hitchhiker  0.00298358 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11590  iojap-related protein  58.62 
 
 
151 aa  123  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.633601 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10180  iojap-related protein  60.34 
 
 
141 aa  121  4e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.168082  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1637  iojap-like protein  58.7 
 
 
138 aa  113  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.418914 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0719  hypothetical protein  51.26 
 
 
137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00101649  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2006  iojap-like protein  44.35 
 
 
142 aa  97.8  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0014366  hitchhiker  0.0000000000365534 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1012  iojap-like protein  51.14 
 
 
140 aa  95.1  3e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1866  iojap-like protein  43.97 
 
 
118 aa  94.4  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000042805  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0192  iojap-like protein  45.28 
 
 
118 aa  93.2  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000139024  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3118  iojap-like protein  45.28 
 
 
144 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1253  iojap-like protein  43.88 
 
 
110 aa  91.3  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00407148  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3002  iojap-like protein  45.28 
 
 
144 aa  90.1  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13060  iojap-related protein  44.68 
 
 
128 aa  89  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.691164  normal  0.0908003 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  41.96 
 
 
118 aa  87.4  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000207265  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0735  Iojap-related protein  36.8 
 
 
152 aa  86.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130458  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0213  Iojap-related protein  42.06 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2544  iojap-like protein  39.29 
 
 
120 aa  85.5  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00643892  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2013  iojap-like protein  39.66 
 
 
117 aa  84.3  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1783  iojap-like protein  38.02 
 
 
144 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0372  iojap-like protein  37.04 
 
 
114 aa  83.6  9e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000445596  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3002  iojap-like protein  38.02 
 
 
131 aa  82.8  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2577  Iojap-related protein  37.17 
 
 
119 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.5603199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0226  iojap-like protein  41 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0686  iojap-like protein  39.81 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000289548  normal  0.0203597 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0237  iojap-like protein  41 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0393  iojap-like protein  36.11 
 
 
114 aa  81.6  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00274134  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1601  iojap-related protein  38.74 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000667428  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1923  iojap-like protein  40.2 
 
 
116 aa  80.9  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000477061  unclonable  0.00000000896903 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0124  iojap-like protein  39.67 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000225979  hitchhiker  0.00822144 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2110  iojap-like protein  40.21 
 
 
117 aa  80.5  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_335  hypothetical protein  35.19 
 
 
116 aa  80.5  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000506445  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0228  iojap-like protein  37.39 
 
 
191 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.689651  normal  0.307872 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1159  iojap-related protein  35.78 
 
 
117 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0164  Iojap-related protein  42.42 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3776  iojap-like protein  36.36 
 
 
128 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  37.61 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3860  iojap-like protein  36.36 
 
 
128 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13821  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  35.83 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.116188 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  33.96 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0031  iojap-like protein  34.55 
 
 
124 aa  79  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.983708  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4972  hypothetical protein  38.18 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05158  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0022  Iojap-related protein  36.84 
 
 
163 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  33.9 
 
 
124 aa  78.2  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3201  Iojap-related protein  38.74 
 
 
131 aa  77.4  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.12867e-19  unclonable  7.41028e-24 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5041  iojap-like protein  31.78 
 
 
127 aa  77.4  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0087  Iojap-related protein  40 
 
 
129 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755827  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4639  iojap-like protein  33.63 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.188421  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0233  hypothetical protein  36.21 
 
 
122 aa  77.4  0.00000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4329  iojap-like protein  37.14 
 
 
112 aa  77  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.9777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  34.82 
 
 
116 aa  77  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1366  iojap-like protein  44.79 
 
 
114 aa  77  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0097  Iojap-related protein  37.38 
 
 
131 aa  76.6  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0187008  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2674  iojap-like protein  39.62 
 
 
124 aa  76.6  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0269937  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  36.36 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  37.84 
 
 
118 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  37.84 
 
 
118 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0136  iojap-like protein  40.78 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.872852  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13380  iojap-like protein  38.71 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.129259  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0789  Iojap-related protein  41.07 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283554  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  36.97 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000489424  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1753  iojap-like protein  38.46 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1581  hypothetical protein  37.96 
 
 
117 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000588564  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  36.45 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  36.45 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2515  iojap-like protein  31.9 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  36.45 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  35.51 
 
 
117 aa  74.7  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1684  hypothetical protein  33.94 
 
 
117 aa  74.3  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0432873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>