More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3455 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3835  chaperone protein DnaJ  92.93 
 
 
382 aa  656    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.504584  hitchhiker  0.000855612 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3455  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
381 aa  765    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5455  chaperone protein DnaJ  70.76 
 
 
389 aa  476  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2110  chaperone protein DnaJ  67.69 
 
 
380 aa  438  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1265  chaperone DnaJ  66.02 
 
 
379 aa  437  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0905779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0784  chaperone protein DnaJ  60.21 
 
 
377 aa  426  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0590762 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3252  chaperone protein DnaJ  61.36 
 
 
376 aa  425  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.199351  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13550  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  60.68 
 
 
385 aa  421  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.685498 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1644  chaperone protein DnaJ  64.9 
 
 
374 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0839  heat shock protein DnaJ  57.37 
 
 
379 aa  412  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0215483  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3836  chaperone protein DnaJ  56.56 
 
 
383 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.575279  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12398  chaperone protein DnaJ  57.03 
 
 
382 aa  410  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000162557  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1242  chaperone DnaJ domain protein  63.97 
 
 
384 aa  411  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0347494  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3459  chaperone protein DnaJ  57.22 
 
 
384 aa  408  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1151  chaperone protein DnaJ  59.42 
 
 
376 aa  410  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3522  chaperone protein DnaJ  57.22 
 
 
384 aa  408  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.495865  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2702  chaperone protein DnaJ  57.11 
 
 
381 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3470  chaperone protein DnaJ  57.22 
 
 
384 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7057  chaperone protein DnaJ  58.14 
 
 
378 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409815  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2191  chaperone DnaJ domain protein  55.94 
 
 
374 aa  397  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2290  chaperone DnaJ  60.05 
 
 
380 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13440  chaperone protein DnaJ  54.33 
 
 
372 aa  393  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2209  chaperone DnaJ domain protein  53.42 
 
 
374 aa  390  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.990749  hitchhiker  0.0052734 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0702  chaperone protein DnaJ  55.53 
 
 
379 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1972  chaperone protein DnaJ  51.74 
 
 
375 aa  386  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000781589 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2235  chaperone protein DnaJ  52.8 
 
 
375 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0177525  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1572  chaperone DnaJ domain protein  60.73 
 
 
386 aa  381  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.123159  normal  0.0160005 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1549  chaperone DnaJ domain protein  56.96 
 
 
372 aa  377  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1749  chaperone DnaJ domain protein  56.05 
 
 
375 aa  365  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.378559  normal  0.79074 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3405  chaperone protein DnaJ  54.59 
 
 
375 aa  357  1.9999999999999998e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252508  normal  0.0948111 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11700  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  54.45 
 
 
376 aa  353  2e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.482497  normal  0.776802 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2765  chaperone protein DnaJ  58.25 
 
 
389 aa  350  2e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137899  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3162  chaperone DnaJ domain protein  53.87 
 
 
387 aa  341  2e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.354519  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1904  chaperone protein DnaJ  55.53 
 
 
391 aa  326  5e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466735  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0900  putative chaperone protein DnaJ  43.9 
 
 
383 aa  323  3e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  46.07 
 
 
386 aa  319  5e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12360  chaperone protein DnaJ  51.73 
 
 
377 aa  313  3.9999999999999997e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0467451  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17290  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  48.68 
 
 
375 aa  310  2e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  44.15 
 
 
379 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0444  DnaJ-class molecular chaperone  45.45 
 
 
381 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.771058  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  45.5 
 
 
375 aa  302  6.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  46.67 
 
 
382 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  42.71 
 
 
375 aa  300  3e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  48.96 
 
 
382 aa  298  8e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  45.08 
 
 
388 aa  297  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  44.04 
 
 
380 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  42.97 
 
 
384 aa  294  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  46.23 
 
 
376 aa  293  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  45.38 
 
 
374 aa  292  6e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  44.7 
 
 
374 aa  291  1e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  43.24 
 
 
376 aa  291  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  44.33 
 
 
373 aa  289  6e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  45.22 
 
 
378 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  44.96 
 
 
378 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  44.82 
 
 
378 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  45.45 
 
 
376 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  44.96 
 
 
378 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  45.22 
 
 
378 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  44.96 
 
 
378 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  45.45 
 
 
376 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  45.45 
 
 
376 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  45.45 
 
 
376 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0441  chaperone protein DnaJ  43.24 
 
 
378 aa  286  4e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000821274  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  45.19 
 
 
376 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  45.19 
 
 
376 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  45.19 
 
 
376 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  45.19 
 
 
376 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  44.76 
 
 
373 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1327  chaperone protein DnaJ  42.11 
 
 
381 aa  285  5.999999999999999e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.869234  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  42.58 
 
 
356 aa  286  5.999999999999999e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  41.32 
 
 
370 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  43.18 
 
 
381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3220  chaperone protein DnaJ  45.41 
 
 
374 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000114884  hitchhiker  0.0000204508 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  41.71 
 
 
359 aa  281  2e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1184  chaperone protein DnaJ  44.01 
 
 
380 aa  280  4e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0143708 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3554  chaperone protein DnaJ  42.44 
 
 
388 aa  279  5e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.562407  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  40.79 
 
 
370 aa  279  5e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  41.8 
 
 
366 aa  278  8e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1088  chaperone protein DnaJ  40.76 
 
 
394 aa  278  1e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.038983  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  44.73 
 
 
380 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  41.8 
 
 
377 aa  277  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  44.82 
 
 
377 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  44.33 
 
 
379 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4095  chaperone protein DnaJ  44.33 
 
 
376 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  41.74 
 
 
356 aa  275  8e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1147  chaperone protein DnaJ  41.36 
 
 
373 aa  275  8e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2126  chaperone protein DnaJ  44.88 
 
 
377 aa  275  8e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.549127  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4415  chaperone protein DnaJ  44.33 
 
 
375 aa  275  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340124  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0750  chaperone protein DnaJ  43.57 
 
 
373 aa  275  8e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3187  chaperone protein DnaJ  42.82 
 
 
385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.117357 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  43.24 
 
 
377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0789  chaperone protein DnaJ  44.09 
 
 
377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  42.18 
 
 
376 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0129  chaperone protein DnaJ  42.82 
 
 
372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  45.74 
 
 
384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1671  chaperone protein DnaJ  41.71 
 
 
379 aa  273  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0979  hypothetical protein  39.21 
 
 
379 aa  273  3e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.127432 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3242  chaperone DnaJ  43.65 
 
 
378 aa  273  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1637  chaperone protein DnaJ  41.71 
 
 
379 aa  273  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.203531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>