More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3423 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  100 
 
 		 310 aa  619  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  94.19 
 
 		 310 aa  585  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  76.45 
 
 		 311 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  69.01 
 
 		 312 aa  434  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  70.65 
 
 		 306 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  70.82 
 
 		 332 aa  432  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  63.4 
 
 		 326 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  63.16 
 
 		 339 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  65.03 
 
 		 340 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  63.16 
 
 		 317 aa  385  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  58.92 
 
 		 328 aa  355  3.9999999999999996e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  58.14 
 
 		 317 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  52.75 
 
 		 315 aa  312  5.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  52.88 
 
 		 293 aa  305  6e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  53.31 
 
 		 312 aa  303  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  51.62 
 
 		 322 aa  295  6e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  50.63 
 
 		 305 aa  295  8e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  48.51 
 
 		 305 aa  292  4e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  51.91 
 
 		 313 aa  291  7e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  52.43 
 
 		 311 aa  289  4e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  49.17 
 
 		 327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  48.01 
 
 		 303 aa  286  2.9999999999999996e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  48.33 
 
 		 310 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  46.75 
 
 		 323 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  49.84 
 
 		 314 aa  282  6.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  47.7 
 
 		 302 aa  273  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1144  ABC transporter related  48.52 
 
 		 312 aa  272  5.000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  50 
 
 		 309 aa  272  6e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  50 
 
 		 309 aa  272  6e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  47.88 
 
 		 309 aa  271  9e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  45.34 
 
 		 313 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  47.4 
 
 		 311 aa  267  2e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  45.95 
 
 		 307 aa  267  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3711  ABC transporter related  47.1 
 
 		 323 aa  266  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  45.72 
 
 		 303 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  47.68 
 
 		 345 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1092  ABC transporter related  50.16 
 
 		 310 aa  263  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.291374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  46.2 
 
 		 304 aa  262  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  45.21 
 
 		 304 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  45.21 
 
 		 304 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  45.54 
 
 		 320 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  45.83 
 
 		 320 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  46.73 
 
 		 307 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  45.54 
 
 		 373 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  46.33 
 
 		 320 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  45.21 
 
 		 304 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  46.96 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  46.96 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  46.96 
 
 		 304 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  46.96 
 
 		 304 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4259  ABC transporter-related protein  48.42 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  46.96 
 
 		 304 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  46.96 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  46.51 
 
 		 342 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  47.3 
 
 		 344 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  46.96 
 
 		 304 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0633  ABC transporter related  43.27 
 
 		 314 aa  259  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  45.9 
 
 		 304 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  45.9 
 
 		 301 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  45.9 
 
 		 326 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  44.69 
 
 		 321 aa  258  7e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  44.55 
 
 		 355 aa  252  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  44.3 
 
 		 304 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2295  nodulation ABC transporter NodI  44.41 
 
 		 325 aa  247  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  46.13 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2475  nodulation ABC transporter NodI  46.96 
 
 		 304 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  43.91 
 
 		 304 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  43.41 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.96 
 
 		 334 aa  239  2.9999999999999997e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0389  ABC transporter related  41.25 
 
 		 305 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0410  nodulation ATP-binding protein I  41.42 
 
 		 305 aa  226  4e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.51 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.88 
 
 		 323 aa  223  3e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_353  ABC-2 type transport system, ATP-binding protein  40.59 
 
 		 305 aa  223  4e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.761814  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  42.18 
 
 		 282 aa  221  8e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.76 
 
 		 324 aa  220  3e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3329  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.97 
 
 		 332 aa  218  7.999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259438  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.76 
 
 		 324 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  36.83 
 
 		 327 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.68 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.97 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43 
 
 		 279 aa  217  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0379  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.01 
 
 		 321 aa  217  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.91 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.19 
 
 		 328 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  41.53 
 
 		 319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.41 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.65 
 
 		 327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0260  ABC transporter related protein  41.88 
 
 		 329 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.723146  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.34 
 
 		 328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.82 
 
 		 324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.75 
 
 		 305 aa  212  5.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.1 
 
 		 319 aa  212  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.87 
 
 		 339 aa  212  7e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3254  hypothetical protein  42.11 
 
 		 331 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0305467  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.35 
 
 		 325 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.04 
 
 		 326 aa  211  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  37.82 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  41.31 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0461  ABC-type multidrug transport system ATPase component  39.68 
 
 		 320 aa  210  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>