93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3408 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  100 
 
 		 461 aa  907    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  61.99 
 
 		 466 aa  499  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  55.91 
 
 		 468 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  55.63 
 
 		 461 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  54.56 
 
 		 454 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  52 
 
 		 465 aa  388  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  51.72 
 
 		 464 aa  384  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  53.44 
 
 		 467 aa  376  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  53.72 
 
 		 479 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  51.24 
 
 		 465 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  52.48 
 
 		 455 aa  368  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  49.36 
 
 		 454 aa  363  2e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  53.48 
 
 		 450 aa  363  3e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  51.71 
 
 		 464 aa  354  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  52.33 
 
 		 459 aa  353  4e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  49.68 
 
 		 459 aa  352  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  51.4 
 
 		 464 aa  350  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  51.5 
 
 		 454 aa  349  5e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  52.43 
 
 		 457 aa  349  6e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  47.66 
 
 		 464 aa  346  4e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  52.45 
 
 		 457 aa  346  6e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  50.75 
 
 		 462 aa  345  8.999999999999999e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  52.68 
 
 		 432 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  51.46 
 
 		 435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  51.24 
 
 		 477 aa  343  4e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  50.1 
 
 		 462 aa  341  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  50.83 
 
 		 557 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  51.12 
 
 		 496 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  50.33 
 
 		 478 aa  323  3e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  49.36 
 
 		 460 aa  322  8e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  52.12 
 
 		 361 aa  316  6e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  47.77 
 
 		 466 aa  315  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  48.12 
 
 		 473 aa  312  7.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  43.84 
 
 		 505 aa  311  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  50.11 
 
 		 462 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  49.45 
 
 		 441 aa  306  7e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  51.01 
 
 		 415 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  48.35 
 
 		 476 aa  303  5.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  48.51 
 
 		 452 aa  300  5e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  43.48 
 
 		 493 aa  294  3e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  47.35 
 
 		 439 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  47.78 
 
 		 435 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  49.25 
 
 		 446 aa  278  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  46.61 
 
 		 489 aa  276  5e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  48.52 
 
 		 433 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  48.61 
 
 		 448 aa  267  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  39.6 
 
 		 509 aa  213  7e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  39.95 
 
 		 483 aa  199  7e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  38.75 
 
 		 476 aa  197  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  37.6 
 
 		 481 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  35.08 
 
 		 477 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  37.83 
 
 		 501 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  35.5 
 
 		 523 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  34.99 
 
 		 532 aa  162  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  32.72 
 
 		 477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  31.38 
 
 		 483 aa  147  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  42.13 
 
 		 840 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  39.49 
 
 		 673 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  30.66 
 
 		 759 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  27.02 
 
 		 541 aa  67.4  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  29.04 
 
 		 767 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  37.82 
 
 		 168 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  29.61 
 
 		 852 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  25.53 
 
 		 575 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  28.62 
 
 		 591 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28.33 
 
 		 884 aa  57  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  27.3 
 
 		 527 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  26.43 
 
 		 530 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  28.57 
 
 		 558 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  30.5 
 
 		 863 aa  54.3  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  25.06 
 
 		 591 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  29.79 
 
 		 523 aa  53.5  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1318 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  28.3 
 
 		 1755 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1106 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  27.85 
 
 		 601 aa  50.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  44.33 
 
 		 362 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1362  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1023 aa  49.7  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  29.18 
 
 		 1061 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  29.75 
 
 		 717 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2156  polymorphic outer membrane protein  28.97 
 
 		 526 aa  47.4  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  24.5 
 
 		 575 aa  47  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  27.61 
 
 		 665 aa  46.6  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  25.59 
 
 		 659 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  27.01 
 
 		 593 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2874  polymorphic outer membrane protein  29.87 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1010 aa  44.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  26.03 
 
 		 1296 aa  43.9  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2313  hypothetical protein  28.41 
 
 		 834 aa  43.9  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000127543  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15312  predicted protein  26.83 
 
 		 1359 aa  43.5  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  33.06 
 
 		 350 aa  43.9  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  27.86 
 
 		 2192 aa  43.9  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  26.7 
 
 		 743 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>