More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3350 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3350  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 102 aa  208  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1933  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 102 aa  208  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00315482  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3194  transposase IS3/IS911 family protein  80.39 
 
 		 102 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0960855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3241  transposase IS3/IS911 family protein  79.41 
 
 		 102 aa  152  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.680092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1095  transposase IS3/IS911 family protein  82.35 
 
 		 102 aa  152  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5960  transposase IS3/IS911 family protein  82.35 
 
 		 102 aa  152  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3191  transposase IS3/IS911 family protein  79.41 
 
 		 102 aa  152  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0616  transposase IS3/IS911 family protein  80.39 
 
 		 102 aa  152  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3179  transposase IS3/IS911  78.43 
 
 		 115 aa  150  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10240  Transposase  72.16 
 
 		 97 aa  149  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5590  transposase IS3/IS911  78.43 
 
 		 102 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5991  transposase IS3/IS911 family protein  78.43 
 
 		 102 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160623 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0231  transposase IS3/IS911 family protein  68.04 
 
 		 97 aa  144  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1430  transposase IS3/IS911 family protein  68.04 
 
 		 97 aa  144  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1486  transposase IS3/IS911 family protein  68.04 
 
 		 97 aa  144  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.089931  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0255  transposase IS3/IS911 family protein  68.04 
 
 		 97 aa  144  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495162  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2705  transposase IS3/IS911 family protein  68.04 
 
 		 97 aa  144  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.217344  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1003  transposase IS3/IS911 family protein  68.04 
 
 		 97 aa  144  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0276  transposase IS3/IS911 family protein  68.04 
 
 		 97 aa  144  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3957  transposase IS3/IS911 family protein  68.04 
 
 		 97 aa  144  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0301  transposase IS3/IS911 family protein  68.04 
 
 		 97 aa  144  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3954  transposase IS3/IS911 family protein  68.04 
 
 		 97 aa  144  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1439  transposase IS3/IS911 family protein  68.04 
 
 		 97 aa  144  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0436436  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0377  transposase IS3/IS911 family protein  68.04 
 
 		 97 aa  144  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0385  transposase IS3/IS911 family protein  68.04 
 
 		 97 aa  144  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3486  transposase IS3/IS911 family protein  67.01 
 
 		 100 aa  142  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2596  transposase IS3/IS911 family protein  67.01 
 
 		 97 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3646  transposase IS3/IS911 family protein  67.65 
 
 		 100 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05320  Transposase  71.57 
 
 		 102 aa  130  9e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0629  transposase IS3/IS911 family protein  64.95 
 
 		 95 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2065  transposase IS3/IS911 family protein  64.95 
 
 		 95 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000072844  hitchhiker  0.00973796 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2874  transposase IS3/IS911 family protein  64.95 
 
 		 95 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000119781  normal  0.0116758 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06580  Transposase  66.33 
 
 		 95 aa  124  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0602807  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3498  transposase IS3/IS911 family protein  64.95 
 
 		 95 aa  123  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000201546  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4463  transposase IS3/IS911 family protein  64.95 
 
 		 95 aa  123  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0130  transposase IS3/IS911 family protein  64.95 
 
 		 95 aa  123  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1241  transposase IS3/IS911 family protein  63.92 
 
 		 95 aa  121  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0276209  normal  0.427861 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17910  Transposase  56.44 
 
 		 101 aa  117  7e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.252162 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23530  Transposase  61.7 
 
 		 99 aa  115  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20150  Transposase  61.7 
 
 		 99 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.101753  normal  0.0248852 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21100  Transposase  61.7 
 
 		 99 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23460  Transposase  60.64 
 
 		 99 aa  113  7.999999999999999e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.519967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18710  Transposase  60.64 
 
 		 99 aa  113  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17770  Transposase  59.57 
 
 		 99 aa  110  8.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.894128  normal  0.461539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5969  transposase IS3/IS911 family protein  78.33 
 
 		 115 aa  100  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2438  transposase IS3/IS911 family protein  50.53 
 
 		 94 aa  97.4  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416756 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3210  transposase IS3/IS911 family protein  52.53 
 
 		 98 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4507  transposase IS3/IS911 family protein  54.35 
 
 		 93 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122845 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1509  transposase IS3/IS911  43.62 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1532  transposase IS3/IS911 family protein  43.62 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2848  transposase IS3/IS911 family protein  48.98 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.389181 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2271  transposase IS3/IS911 family protein  48.98 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2395  transposase IS3/IS911 family protein  48.98 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0800  transposase IS3/IS911 family protein  43.16 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2154  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432378 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1285  transposase IS3/IS911 family protein  48.48 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9415  transposase IS3/IS911 family protein  39.18 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4704  transposase IS3/IS911 family protein  39.18 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4688  transposase IS3/IS911 family protein  39.18 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  0.571862 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0063  transposase IS3/IS911 family protein  37.11 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2846  transposase IS3/IS911 family protein  36.17 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2458  transposase IS3/IS911 family protein  36.17 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7354  transposase IS3/IS911 family protein  37.25 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.124441 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2226  transposase IS3/IS911  35.24 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2586  transposase IS3/IS911 family protein  38.54 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25110  Transposase  34 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3708  transposase IS3/IS911 family protein  38.95 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0112916  normal  0.204081 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2936  transposase IS3/IS911 family protein  43.48 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.312037  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2520  transposase IS3/IS911 family protein  38.95 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000790886  hitchhiker  0.00717197 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2447  transposase IS3/IS911 family protein  36 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000211632  hitchhiker  0.00944163 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2593  transposase IS3/IS911  43.08 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214558  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1221  transposase IS3/IS911 family protein  35 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.774632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1483  Fis family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2637  Fis family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1223  transposase IS3/IS911 family protein  35 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.16285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3905  transposase IS3/IS911 family protein  31.51 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86052  normal  0.925618 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0600  Fis family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0929  transposase IS3/IS911  43.08 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0946  Fis family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0906  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0302  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3254  transposase IS3/IS911 family protein  31.18 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1774  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.985835  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1315  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0494436  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0520  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455953  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0153  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0980  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.571542  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0981  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.267655  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3165  transposase IS3/IS911 family protein  36.27 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.897924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  35.79 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9899  hypothetical protein  37.68 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9837  transposase protein  37.68 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2819  transposase IS3/IS911 family protein  32.26 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2965  transposase IS3/IS911 family protein  34.07 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173924  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1148  transposase IS3/IS911 family protein  34.07 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1140  transposase IS3/IS911 family protein  34.41 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.816485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1726  transposase IS3/IS911  36.84 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.110151 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1740  transposase IS3/IS911 family protein  36.46 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.698666  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2800  transposase IS3/IS911 family protein  36.46 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0137371  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2668  transposase IS3/IS911 family protein  36.46 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>