34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3331 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3331  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 131 aa  254  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00294231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3567  RDD domain-containing protein  75.57 
 
 		 131 aa  181  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2630  hypothetical protein  42.74 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4895  RDD domain-containing protein  43.55 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3372  RDD domain containing protein  38.46 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1511  RDD domain containing protein  39.02 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0924  RDD domain-containing protein  42.48 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1263  RDD domain-containing protein  36.36 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0359346  normal  0.130188 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1856  RDD domain containing protein  39.39 
 
 		 131 aa  62  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1601  RDD domain-containing protein  35.82 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.134056  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1595  RDD domain containing protein  34.59 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000125506 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16490  hypothetical protein  35.29 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3330  RDD domain-containing protein  34.45 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.177645 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3381  RDD domain-containing protein  34.45 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.0851083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3319  RDD domain-containing protein  34.45 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.436382  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3141  RDD  37.19 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2296  RDD domain-containing protein  35.65 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7409  RDD domain containing protein  36.44 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2929  RDD domain-containing protein  32.46 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3290  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0926  RDD domain containing protein  34.78 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13390  hypothetical protein  38.83 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.408767  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2111  RDD domain containing protein  33.87 
 
 		 174 aa  52.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.158954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3584  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0783215  normal  0.0483583 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15380  hypothetical protein  40 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07510  hypothetical protein  40.51 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.38358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1771  RDD domain-containing protein  38.26 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1916  RDD domain containing protein  31.58 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0253441  hitchhiker  0.000670686 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1483  RDD domain containing protein  34.68 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12248  hypothetical protein  31.97 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300466  normal  0.915257 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2037  RDD domain containing protein  37.21 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.905521  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3101  RDD domain containing protein  34.92 
 
 		 160 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0763481  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0933  RDD domain containing protein  31.78 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3079  RDD domain containing protein  27.2 
 
 		 167 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0151194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>