More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3310 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3542  aldo/keto reductase  92.77 
 
 
332 aa  640    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3310  aldo/keto reductase  100 
 
 
332 aa  682    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108449  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3154  aldo/keto reductase  77.11 
 
 
335 aa  528  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1857  aldo/keto reductase  75.08 
 
 
333 aa  520  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  71.47 
 
 
333 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3746  aldo/keto reductase  73.49 
 
 
334 aa  511  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  72.97 
 
 
332 aa  508  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4156  aldo/keto reductase  72.97 
 
 
335 aa  507  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0249282  normal  0.138418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2653  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  72.67 
 
 
332 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.481202  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1360  aldo/keto reductase  73.56 
 
 
328 aa  502  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3949  aldo/keto reductase  71.69 
 
 
334 aa  500  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10590  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  70.52 
 
 
331 aa  497  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.244513 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  70.06 
 
 
334 aa  490  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3265  aldo/keto reductase  70.15 
 
 
336 aa  490  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  69.07 
 
 
333 aa  488  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2949  aldo/keto reductase  71.56 
 
 
336 aa  482  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15540  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  69.88 
 
 
337 aa  483  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2987  aldo/keto reductase  69.16 
 
 
336 aa  479  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  70.3 
 
 
334 aa  475  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28620  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  71.39 
 
 
334 aa  476  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3351  aldo/keto reductase  70.46 
 
 
327 aa  471  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1879  aldo/keto reductase  69.67 
 
 
338 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2023  aldo/keto reductase  66.87 
 
 
337 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0725313  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2390  aldo/keto reductase  67.76 
 
 
336 aa  462  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000519885  hitchhiker  0.000458148 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1462  aldo/keto reductase  67.37 
 
 
333 aa  456  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3124  aldo/keto reductase  68.85 
 
 
321 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.188754  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1794  aldo/keto reductase  67.8 
 
 
324 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.81315 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2535  aldo/keto reductase  60.98 
 
 
329 aa  428  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00875609  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11890  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  63.2 
 
 
342 aa  427  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.018283  normal  0.630679 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2751  aldo/keto family dehydrogenase  59.45 
 
 
329 aa  422  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178849 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  55.95 
 
 
316 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  52.81 
 
 
322 aa  340  2e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  51.75 
 
 
315 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  49.68 
 
 
315 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  47.15 
 
 
317 aa  310  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1275  aldo/keto reductase  47.95 
 
 
315 aa  303  3.0000000000000004e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.13271 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2071  aldo/keto reductase  47.32 
 
 
316 aa  301  8.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0765419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1687  aldo/keto reductase  46.84 
 
 
310 aa  292  7e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0379  aldo/keto reductase  47.02 
 
 
314 aa  286  2e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0161187  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0869  putative oxidoreductase  44.16 
 
 
325 aa  281  1e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1811  aldo/keto reductase  43.22 
 
 
316 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0838  aldo/keto reductase  45.26 
 
 
322 aa  273  4.0000000000000004e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0086  voltage-dependent potassium channel, beta subunit  47.69 
 
 
332 aa  272  7e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0148  aldo/keto reductase  43.73 
 
 
319 aa  259  3e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00957933  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0782  aldo/keto reductase  43.61 
 
 
318 aa  259  6e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.16349  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0618  aldo/keto reductase  42.33 
 
 
319 aa  255  6e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000265496  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0604  aldo/keto reductase  42.33 
 
 
319 aa  255  8e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000106884  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2130  aldo/keto reductase  44.58 
 
 
323 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.940949  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5541  aldo/keto reductase  44.27 
 
 
323 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.675732 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2251  aldo/keto reductase  44.58 
 
 
323 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1064  aldo/keto reductase  44.27 
 
 
323 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680696  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5864  aldo/keto reductase  43.96 
 
 
323 aa  245  8e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2213  aldo/keto reductase  43.65 
 
 
323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2237  aldo/keto reductase  43.65 
 
 
323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2158  aldo/keto reductase  43.08 
 
 
321 aa  243  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0809  aldo/keto reductase  41.48 
 
 
317 aa  243  5e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1962  aldo/keto reductase  43.96 
 
 
323 aa  242  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.575618  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0875  aldo/keto reductase family oxidoreductase  43.34 
 
 
323 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.73472  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3157  putative voltage-gated potassium channel, beta subunit  42.94 
 
 
323 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.350031 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0019  aldo/keto reductase family oxidoreductase  43.34 
 
 
323 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322839  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0919  aldo/keto reductase family oxidoreductase  43.34 
 
 
323 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.146678  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1620  aldo/keto reductase  43.21 
 
 
329 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.884834  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  43.75 
 
 
332 aa  240  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1917  aldo/keto reductase family oxidoreductase  43.34 
 
 
323 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1813  aldo/keto reductase  42.59 
 
 
329 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0383943 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0600  aldo/keto reductase family oxidoreductase  43.34 
 
 
323 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0504  aldo/keto reductase family oxidoreductase  43.34 
 
 
323 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2039  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.41 
 
 
323 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1392  aldo/keto reductase  42.11 
 
 
323 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203744  hitchhiker  0.00446461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  41.72 
 
 
325 aa  236  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3006  aldo/keto reductase  39.33 
 
 
327 aa  233  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.378905 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  42.55 
 
 
339 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  42.55 
 
 
339 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  43.85 
 
 
326 aa  233  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  40.3 
 
 
336 aa  232  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4200  aldo/keto reductase  39.82 
 
 
327 aa  230  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122481  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00610  VIC potassium ion channel, beta subunit (Eurofung)  42.44 
 
 
344 aa  229  6e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930439  normal  0.576143 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  43.21 
 
 
325 aa  228  8e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  41.3 
 
 
331 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21730  Oxidoreductase aldo/keto reductase family  41.58 
 
 
347 aa  226  5.0000000000000005e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  41.3 
 
 
331 aa  226  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  41.3 
 
 
331 aa  226  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  42.46 
 
 
328 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5690  aldo/keto reductase  42.49 
 
 
326 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0442358  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0255  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.74 
 
 
330 aa  224  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  40.24 
 
 
353 aa  222  9e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0880  aldo/keto reductase  41.64 
 
 
347 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0426  aldo/keto reductase  39.21 
 
 
361 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  40.73 
 
 
334 aa  220  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2078  aldo/keto reductase  41.21 
 
 
330 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5157  hypothetical protein  41.07 
 
 
347 aa  219  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136679  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  40.56 
 
 
348 aa  219  6e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  40.85 
 
 
338 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03480  Voltage-gated potassium channel beta-2 subunit, putative  39.63 
 
 
355 aa  218  1e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  41.67 
 
 
326 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  40.12 
 
 
323 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  42.81 
 
 
326 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  40.5 
 
 
352 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0082  aldo/keto reductase  38.55 
 
 
347 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1282  aldo/keto reductase  41.44 
 
 
352 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0039468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>