More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3306 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3306  quinolinate synthetase  100 
 
 		 400 aa  823    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.448369 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3538  quinolinate synthetase  92.98 
 
 		 399 aa  754    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4148  quinolinate synthetase complex, A subunit  77.78 
 
 		 388 aa  636    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0298748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3083  quinolinate synthetase complex, A subunit  79.73 
 
 		 388 aa  628  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0542584  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2664  quinolinate synthetase complex, A subunit  77.69 
 
 		 384 aa  621  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.240142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1661  quinolinate synthetase  75.46 
 
 		 397 aa  600  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.495114  normal  0.0794019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1284  quinolinate synthetase complex subunit A  75.59 
 
 		 386 aa  592  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.778177  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1458  quinolinate synthetase  72.06 
 
 		 383 aa  581  1e-164  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.570432  normal  0.648645 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3149  quinolinate synthetase  71.76 
 
 		 394 aa  579  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.322606  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15580  quinolinate synthetase A  71.72 
 
 		 400 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2086  quinolinate synthetase complex, A subunit  70.89 
 
 		 412 aa  567  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1796  quinolinate synthetase  72.06 
 
 		 395 aa  546  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574289 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3122  quinolinate synthetase  73.54 
 
 		 407 aa  521  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174663  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0919  quinolinate synthetase  55.87 
 
 		 367 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15680  quinolinate synthetase  59.27 
 
 		 442 aa  410  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.373722  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2529  quinolinate synthetase  55.03 
 
 		 367 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0241  quinolinate synthetase  57.3 
 
 		 426 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0291672  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3557  quinolinate synthetase  57.22 
 
 		 430 aa  403  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00755021  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2297  quinolinate synthetase  55.95 
 
 		 433 aa  402  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000588657 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1626  quinolinate synthetase  56 
 
 		 365 aa  400  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2776  quinolinate synthetase  55.53 
 
 		 425 aa  396  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.12125 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0350  quinolinate synthetase complex, A subunit  55.26 
 
 		 421 aa  397  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.54036  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4325  quinolinate synthetase  51.87 
 
 		 368 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4162  quinolinate synthetase  51.59 
 
 		 368 aa  392  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4660  quinolinate synthetase  51.87 
 
 		 368 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00639812  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4561  quinolinate synthetase  51.59 
 
 		 368 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4508  quinolinate synthetase  51.59 
 
 		 368 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0362709 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4317  quinolinate synthetase  54.55 
 
 		 370 aa  393  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.381105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2560  quinolinate synthetase  54.32 
 
 		 441 aa  392  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267986  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4513  quinolinate synthetase  51.3 
 
 		 368 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4173  quinolinate synthetase  51.59 
 
 		 368 aa  391  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4546  quinolinate synthetase  51.3 
 
 		 368 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0260713  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0689  quinolinate synthetase  51.59 
 
 		 368 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03750  quinolinate synthetase  54.47 
 
 		 435 aa  385  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.01  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4274  quinolinate synthetase  52.03 
 
 		 368 aa  386  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0106233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3766  quinolinate synthetase  53.41 
 
 		 365 aa  381  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1289  quinolinate synthetase  53.2 
 
 		 375 aa  381  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0340709  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0303  quinolinate synthetase  54.15 
 
 		 365 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.527359  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3143  quinolinate synthetase  50 
 
 		 368 aa  378  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0917  quinolinate synthetase  53.78 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000424051  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0057  quinolinate synthetase  55.87 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0058  quinolinate synthetase  55.87 
 
 		 365 aa  375  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000714365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3645  quinolinate synthetase  54.96 
 
 		 366 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0376  quinolinate synthetase  55.3 
 
 		 389 aa  363  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0605  quinolinate synthetase  51.43 
 
 		 366 aa  358  8e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2381  quinolinate synthetase  51.42 
 
 		 379 aa  358  9e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2253  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.98 
 
 		 356 aa  329  6e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564626 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1579  quinolinate synthetase  49.27 
 
 		 372 aa  318  1e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2922  quinolinate synthetase complex, A subunit  48.41 
 
 		 377 aa  311  1e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1497  quinolinate synthetase  46.69 
 
 		 373 aa  301  1e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.611574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0530  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.98 
 
 		 377 aa  301  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1372  quinolinate synthetase  45.27 
 
 		 346 aa  260  3e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.32551  normal  0.474505 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0525  quinolinate synthetase  43.91 
 
 		 349 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.472845 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1352  quinolinate synthetase  41.04 
 
 		 358 aa  249  4e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.186437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0687  quinolinate synthetase  43.66 
 
 		 337 aa  249  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1830  quinolinate synthetase  39.64 
 
 		 346 aa  240  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0667  quinolinate synthetase  40.18 
 
 		 332 aa  235  9e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0807  quinolinate synthetase  39.28 
 
 		 348 aa  233  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0757  quinolinate synthetase  35.94 
 
 		 337 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012496  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0238  quinolinate synthetase complex, A subunit  37.13 
 
 		 330 aa  210  3e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0832  quinolinate synthetase  32.99 
 
 		 447 aa  197  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0861  quinolinate synthetase  33.5 
 
 		 447 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  35.37 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2767  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.21 
 
 		 357 aa  176  6e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2870  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.21 
 
 		 357 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  33.91 
 
 		 303 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2644  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.21 
 
 		 347 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.614387  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  32.52 
 
 		 298 aa  172  7.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  35.78 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.36 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  34.24 
 
 		 304 aa  170  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  34.51 
 
 		 304 aa  169  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000125089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4591  quinolinate synthetase complex, A subunit  35.57 
 
 		 333 aa  169  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  34.34 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000308382  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3573  quinolinate synthetase  34.35 
 
 		 304 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  34.58 
 
 		 324 aa  166  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  34.12 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0168  quinolinate synthetase complex, A subunit  35.29 
 
 		 333 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.243178  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0943  quinolinate synthetase  30.31 
 
 		 308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00785381  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  32.95 
 
 		 301 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0429  quinolinate synthetase  36.56 
 
 		 323 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2819  quinolinate synthetase  36.04 
 
 		 327 aa  164  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433128  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  35.15 
 
 		 307 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  32.32 
 
 		 304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1865  quinolinate synthetase  32.66 
 
 		 304 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  34.14 
 
 		 303 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  34.35 
 
 		 306 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2413  quinolinate synthetase complex, A subunit  32.72 
 
 		 308 aa  163  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292138  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  35.35 
 
 		 304 aa  162  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  35.15 
 
 		 305 aa  162  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  33.63 
 
 		 322 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  35.35 
 
 		 307 aa  161  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4757  quinolinate synthetase  35.44 
 
 		 307 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  0.37432 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  35.15 
 
 		 304 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3346  quinolinate synthetase  33.33 
 
 		 334 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2557  quinolinate synthetase  35.35 
 
 		 324 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  33.94 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4055  quinolinate synthetase complex, A subunit  33.87 
 
 		 310 aa  160  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3491  quinolinate synthetase  33.43 
 
 		 334 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1004  quinolinate synthetase  36.73 
 
 		 343 aa  159  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529282  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>