31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3297 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3297  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  259  6e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257585  normal  0.158078 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3529  response regulator receiver protein  92.37 
 
 		 131 aa  245  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000118426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4121  response regulator receiver protein  57.72 
 
 		 131 aa  155  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1371  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 136 aa  123  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10660  hypothetical protein  47.29 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1581  response regulator receiver protein  45.67 
 
 		 134 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.996802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1605  response regulator receiver protein  45.67 
 
 		 134 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1551  response regulator receiver protein  45.67 
 
 		 134 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0910049  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2678  response regulator receiver protein  42.75 
 
 		 138 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.858838 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3113  response regulator receiver protein  45.16 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.630286  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3132  hypothetical protein  45.97 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1886  response regulator receiver protein  45.53 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734849 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3247  response regulator receiver protein  45 
 
 		 163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00187591  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1805  response regulator receiver protein  46.09 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1023  putative response regulator  41.67 
 
 		 143 aa  106  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.130012  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0965  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.206702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3064  response regulator receiver protein  43.9 
 
 		 132 aa  104  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0048778  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13164  response regulator  44.72 
 
 		 133 aa  103  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4480  response regulator receiver protein  44.72 
 
 		 136 aa  103  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00179886 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1297  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 131 aa  101  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3339  putative two-component system response regulator  47.58 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3136  response regulator receiver protein  40.31 
 
 		 146 aa  98.6  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15720  hypothetical protein  44.17 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1674  response regulator receiver protein  40.48 
 
 		 140 aa  96.7  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1893  response regulator receiver protein  45.08 
 
 		 151 aa  96.7  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127088  hitchhiker  0.00000556231 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0402  hypothetical protein  38.89 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1445  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0798092  normal  0.329727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3167  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2007  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.270937  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2074  response regulator receiver protein  42.28 
 
 		 138 aa  84  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3669  response regulator receiver protein  33.01 
 
 		 373 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>