More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3295 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 		 199 aa  408  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  96.98 
 
 		 199 aa  401  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  82.5 
 
 		 200 aa  343  8.999999999999999e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  70.2 
 
 		 208 aa  287  9e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  66.84 
 
 		 203 aa  265  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  66.84 
 
 		 203 aa  265  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  65.33 
 
 		 197 aa  265  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  65.33 
 
 		 197 aa  264  7e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  65.33 
 
 		 197 aa  264  7e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  65.33 
 
 		 197 aa  264  7e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  65.33 
 
 		 197 aa  262  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  66.15 
 
 		 204 aa  261  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  63.13 
 
 		 203 aa  259  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  65.26 
 
 		 220 aa  259  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  64.21 
 
 		 220 aa  257  6e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  63 
 
 		 205 aa  257  7e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  62.68 
 
 		 215 aa  253  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  61.39 
 
 		 209 aa  249  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  63.08 
 
 		 206 aa  248  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  66.11 
 
 		 180 aa  245  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  61.14 
 
 		 239 aa  244  6.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  60.66 
 
 		 212 aa  239  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  64.36 
 
 		 205 aa  234  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  62.62 
 
 		 208 aa  234  8e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  63.48 
 
 		 181 aa  230  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  60.4 
 
 		 205 aa  229  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  57.75 
 
 		 213 aa  228  5e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  64.48 
 
 		 206 aa  228  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  54.03 
 
 		 217 aa  224  9e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  57.62 
 
 		 211 aa  223  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  61.17 
 
 		 194 aa  221  7e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  56.57 
 
 		 224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  55.5 
 
 		 215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  54.25 
 
 		 212 aa  217  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  54.46 
 
 		 213 aa  215  2.9999999999999998e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  54.76 
 
 		 212 aa  215  2.9999999999999998e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  56.57 
 
 		 219 aa  213  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  51.12 
 
 		 223 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  56.28 
 
 		 218 aa  209  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  47.25 
 
 		 244 aa  186  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  56.07 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  41.33 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  40.91 
 
 		 298 aa  112  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  37.04 
 
 		 283 aa  111  6e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  36.41 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  37.36 
 
 		 205 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  37.36 
 
 		 205 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  34.78 
 
 		 203 aa  107  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  35.29 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  34.72 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  34.22 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.33 
 
 		 204 aa  104  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.33 
 
 		 204 aa  104  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  30.9 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  32.26 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  31.58 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  33.69 
 
 		 206 aa  104  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  34.97 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3161  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.72 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000281204 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2812  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.72 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3793  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.78 
 
 		 211 aa  101  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1293  cytochrome c oxidase, subunit III  31.18 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000775501  hitchhiker  0.00406626 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5106  cytochrome c oxidase, subunit III  33.89 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0670031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0654  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.46 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4852  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.77 
 
 		 215 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0958681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  32 
 
 		 197 aa  99.4  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2915  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  33.14 
 
 		 211 aa  98.2  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164077  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  32.34 
 
 		 204 aa  98.2  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4335  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 215 aa  97.8  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3521  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  30.81 
 
 		 204 aa  97.8  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0985  cytochrome c oxidase subunit III  32.77 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4059  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31 
 
 		 210 aa  97.1  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0979627  normal  0.293144 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3243  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.53 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3100  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.53 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.485225  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4704  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  33.16 
 
 		 291 aa  97.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3062  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.53 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0119037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  32.5 
 
 		 198 aa  96.7  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3785  cytochrome c oxidase, subunit III  39.44 
 
 		 291 aa  96.7  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05493  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.81 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0739  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.94 
 
 		 202 aa  95.9  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346867  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  39.84 
 
 		 291 aa  96.3  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4776  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.84 
 
 		 222 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485675  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  33.67 
 
 		 295 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  38.76 
 
 		 294 aa  95.1  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2221  cytochrome c oxidase, subunit III  31.5 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109522  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0606  cytochrome c oxidase subunit III  32.02 
 
 		 201 aa  95.5  5e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1088  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.98 
 
 		 205 aa  95.5  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000882712  hitchhiker  0.00000399844 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1142  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.9 
 
 		 212 aa  95.1  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0473851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  41.41 
 
 		 293 aa  95.1  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3647  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.99 
 
 		 204 aa  94.7  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.435887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  30.69 
 
 		 743 aa  94.4  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4646  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.9 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0847054  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1875  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.49 
 
 		 221 aa  94  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0147055  normal  0.117743 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  32.16 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1546  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.94 
 
 		 221 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523038  normal  0.149516 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3520  cytochrome c oxidase, subunit III  36.72 
 
 		 291 aa  93.6  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0161  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.44 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  37.5 
 
 		 296 aa  93.6  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1857  Cytochrome-c oxidase  32.2 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>