More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3282 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
377 aa  737    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  89.36 
 
 
376 aa  615  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  64.1 
 
 
376 aa  442  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  62.43 
 
 
376 aa  438  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  63.51 
 
 
373 aa  437  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  66.76 
 
 
374 aa  434  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  64.05 
 
 
370 aa  426  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  62.23 
 
 
399 aa  421  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  58.09 
 
 
390 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  62.03 
 
 
388 aa  410  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  61.93 
 
 
374 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  59.47 
 
 
375 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  59.2 
 
 
375 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  59.2 
 
 
375 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  56.95 
 
 
376 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  56.99 
 
 
374 aa  375  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  59.15 
 
 
379 aa  375  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  60.05 
 
 
384 aa  366  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2961  glycosyl transferase, group 1  56.88 
 
 
382 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197137  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  54.28 
 
 
374 aa  356  3.9999999999999996e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  55.38 
 
 
385 aa  348  8e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3550  glycosyl transferase, group 1  57.67 
 
 
378 aa  348  8e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.750733 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3243  glycosyl transferase group 1  57.22 
 
 
396 aa  332  5e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0322741  normal  0.0997913 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1764  putative glycosyl transferase  58.99 
 
 
398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0831707  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  49.06 
 
 
374 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  48.12 
 
 
423 aa  296  4e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0171  glycosyl transferase, group 1  48.78 
 
 
422 aa  273  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0383  glycosyl transferase, group 1  43.73 
 
 
377 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.580829  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  28.75 
 
 
384 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  27.2 
 
 
383 aa  152  8.999999999999999e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  35.48 
 
 
409 aa  149  5e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  40.87 
 
 
770 aa  135  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3263  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
381 aa  129  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 
373 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  33.82 
 
 
419 aa  127  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  38.05 
 
 
378 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  27.16 
 
 
382 aa  123  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
359 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 
386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 
414 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  44.25 
 
 
395 aa  119  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  36.06 
 
 
904 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 
399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  39.56 
 
 
377 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  32.45 
 
 
383 aa  113  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4017  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 
384 aa  113  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174092  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 
394 aa  112  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0937  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 
369 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  31.4 
 
 
426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  35.92 
 
 
378 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  37.25 
 
 
410 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 
378 aa  110  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  32.24 
 
 
389 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 
424 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 
373 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  33.19 
 
 
378 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  33.25 
 
 
402 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  33.19 
 
 
378 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  33.19 
 
 
392 aa  106  8e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.07 
 
 
365 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  36.31 
 
 
426 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1540  group 1 glycosyl transferase  30.61 
 
 
378 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.213513  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  30.37 
 
 
404 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1135  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 
380 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.683403  hitchhiker  0.00885425 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  40.61 
 
 
385 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 
360 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 
378 aa  103  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  34.52 
 
 
810 aa  102  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  40.38 
 
 
403 aa  102  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  33.82 
 
 
507 aa  102  9e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  39.55 
 
 
376 aa  102  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1638  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 
519 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  28.94 
 
 
376 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  32.68 
 
 
419 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  39.88 
 
 
382 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  29.23 
 
 
389 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 
364 aa  100  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  32.84 
 
 
360 aa  101  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
398 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
395 aa  99.8  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  32.85 
 
 
370 aa  99.8  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 
377 aa  99.4  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  34.76 
 
 
392 aa  99  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  39.04 
 
 
426 aa  99  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
387 aa  99  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  35.38 
 
 
408 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  33.49 
 
 
414 aa  99  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  38.54 
 
 
394 aa  99.4  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  33.49 
 
 
414 aa  99  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 
371 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0545  glycosyl transferase group 1  43.12 
 
 
413 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 
395 aa  97.8  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0737  glycosyl transferase-like  34.5 
 
 
382 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 
396 aa  97.8  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  39.89 
 
 
414 aa  97.4  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  26.72 
 
 
388 aa  97.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  38.82 
 
 
414 aa  97.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 
396 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  33.18 
 
 
423 aa  97.4  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>