More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3197 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  100 
 
 
232 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  90.13 
 
 
233 aa  403  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  49.55 
 
 
221 aa  181  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  48.13 
 
 
226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  48.04 
 
 
224 aa  161  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  43.1 
 
 
226 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  49.33 
 
 
220 aa  151  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1432  peptidase S16, lon-like  47.3 
 
 
224 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103336  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  40 
 
 
265 aa  134  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  42.2 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.93 
 
 
221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3194  peptidase S16 lon domain protein  41.13 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  37.84 
 
 
241 aa  118  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  38.16 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  36.15 
 
 
213 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.59 
 
 
233 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.56 
 
 
213 aa  101  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  37.2 
 
 
216 aa  94.4  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  36.71 
 
 
212 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  36.71 
 
 
212 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  31.25 
 
 
218 aa  92  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.48 
 
 
232 aa  91.7  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.98 
 
 
216 aa  91.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  35 
 
 
222 aa  91.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  34.13 
 
 
220 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  33.33 
 
 
211 aa  90.9  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2324  peptidase S16 lon domain protein  36.73 
 
 
203 aa  90.9  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.61107 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  34.13 
 
 
220 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  35.1 
 
 
220 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  34.95 
 
 
213 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  33.66 
 
 
218 aa  89.4  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  31.25 
 
 
218 aa  88.2  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  31.73 
 
 
218 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  32.69 
 
 
218 aa  85.9  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  34.62 
 
 
220 aa  85.9  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  32.52 
 
 
212 aa  85.1  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  29.05 
 
 
816 aa  84.3  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  34.78 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  32.21 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  41.94 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1319  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.34 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.276995 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  34.31 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  32.11 
 
 
213 aa  77  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4129  ATP-dependent protease La  26.82 
 
 
825 aa  76.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.170203 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1294  endopeptidase La  32.39 
 
 
805 aa  76.6  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0346664 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2754  ATP-dependent protease La  27.1 
 
 
817 aa  75.9  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0601  ATP-dependent protease La  30.84 
 
 
820 aa  75.5  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273158  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  30.7 
 
 
840 aa  74.7  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2513  ATP-dependent protease La  29.77 
 
 
813 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  30.05 
 
 
804 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  30.05 
 
 
804 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2992  ATP-dependent protease La  25.91 
 
 
813 aa  73.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.77 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5918  ATP-dependent protease La  27.23 
 
 
829 aa  72.8  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.71 
 
 
194 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  29.58 
 
 
806 aa  71.6  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  35.24 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0959  peptidase S16 lon domain protein  41.6 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.61655  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1883  Lon-A peptidase  29.63 
 
 
803 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2647  ATP-dependent protease La  29.91 
 
 
804 aa  69.7  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.272722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  37.76 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  31.02 
 
 
815 aa  70.1  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  31.88 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  25.35 
 
 
812 aa  70.1  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  26.98 
 
 
833 aa  69.3  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.96 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  31.34 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0821  ATP-dependent protease LA  30.05 
 
 
787 aa  68.9  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0118017  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  34.96 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  31.4 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  32.24 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  30 
 
 
805 aa  68.6  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4987  ATP-dependent protease La  27.07 
 
 
824 aa  68.6  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00166311  normal  0.674678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2036  ATP-dependent protease La  29.15 
 
 
800 aa  67.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326048  normal  0.210205 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2044  Lon-A peptidase  28.7 
 
 
802 aa  68.2  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  28.04 
 
 
784 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.04 
 
 
784 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.04 
 
 
784 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.04 
 
 
784 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  30.81 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1382  Lon-A peptidase  29.17 
 
 
803 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.154392  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  37.6 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  29.86 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.04 
 
 
784 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  31.13 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.87 
 
 
786 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0906  ATP-dependent protease La  30.09 
 
 
810 aa  67  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  40.32 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.04 
 
 
784 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.67 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0936  ATP-dependent protease La  30.09 
 
 
810 aa  67.4  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.04 
 
 
784 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  29.67 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.04 
 
 
784 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  37.3 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.04 
 
 
784 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000003188  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.67 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3640  Lon-A peptidase  29.03 
 
 
812 aa  67.8  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0005782  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1457  Lon-A peptidase  29.77 
 
 
808 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181081  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.58 
 
 
196 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>