192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3159 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3159  palmitoyl-CoA hydrolase  100 
 
 		 294 aa  592  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3384  palmitoyl-CoA hydrolase  97.95 
 
 		 294 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3803  Choloyl-CoA hydrolase  68.64 
 
 		 291 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  hitchhiker  0.0012585 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  59.93 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  59.31 
 
 		 301 aa  343  2.9999999999999997e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  57.14 
 
 		 314 aa  323  3e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000238384  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1834  acyl-CoA thioesterase II  54.45 
 
 		 283 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0531  acyl-CoA thioesterase  53.1 
 
 		 299 aa  276  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1862  acyl-CoA thioesterase II  51.03 
 
 		 303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.93699 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  49.83 
 
 		 296 aa  270  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  50.88 
 
 		 294 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  50.52 
 
 		 294 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  51.93 
 
 		 311 aa  263  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2417  palmitoyl-CoA hydrolase  48.78 
 
 		 326 aa  264  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00372623  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3742  acyl-CoA thioesterase II  57.03 
 
 		 294 aa  263  4e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102004  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  51.93 
 
 		 300 aa  261  8e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  51.24 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8358  acyl-CoA thioesterase II  55.39 
 
 		 288 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  51.57 
 
 		 293 aa  259  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  50 
 
 		 294 aa  259  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2170  Palmitoyl-CoA hydrolase  46.9 
 
 		 326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12870  acyl-CoA thioesterase II  49.65 
 
 		 289 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18518  normal  0.438746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1166  acyl-CoA thioesterase II  49.3 
 
 		 289 aa  252  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07750  acyl-CoA thioesterase II  48.41 
 
 		 290 aa  251  9.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4768  Palmitoyl-CoA hydrolase  50.88 
 
 		 277 aa  250  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  48.08 
 
 		 300 aa  248  8e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3590  palmitoyl-CoA hydrolase  49.29 
 
 		 286 aa  247  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4240  acyl-CoA thioesterase II  47.54 
 
 		 294 aa  247  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0997  palmitoyl-CoA hydrolase  49.82 
 
 		 295 aa  246  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  46.98 
 
 		 286 aa  246  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5500  acyl-CoA thioesterase II  51.61 
 
 		 289 aa  246  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215107  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  48.41 
 
 		 289 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3238  acyl-CoA thioesterase II  47.18 
 
 		 288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  44.37 
 
 		 285 aa  243  3.9999999999999997e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  46.94 
 
 		 286 aa  241  7e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  46.26 
 
 		 291 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  47.39 
 
 		 286 aa  239  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  47.39 
 
 		 286 aa  239  5e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  47.39 
 
 		 286 aa  239  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2939  acyl-CoA thioesterase  41.07 
 
 		 292 aa  238  9e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.72893  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  45.49 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  45.58 
 
 		 291 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2210  acyl-CoA thioesterase II  50.35 
 
 		 314 aa  235  7e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2097  acyl-CoA thioesterase II  49.65 
 
 		 287 aa  235  8e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  hitchhiker  0.00217835 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0272  acyl-CoA thioesterase II  45.24 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4293  Acyl-CoA thioesterase  46.29 
 
 		 289 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4916  palmitoyl-CoA hydrolase  47 
 
 		 289 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0370  acyl-CoA thioesterase II  44.75 
 
 		 291 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2851  palmitoyl-CoA hydrolase  47.87 
 
 		 288 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2373  Palmitoyl-CoA hydrolase  49.65 
 
 		 287 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.394315 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  45.42 
 
 		 287 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1064  palmitoyl-CoA hydrolase  47.02 
 
 		 300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08940  acyl-CoA thioesterase  47.16 
 
 		 323 aa  233  4.0000000000000004e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.271356  normal  0.0733048 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05531  acyl-CoA thioesterase II  45.02 
 
 		 301 aa  232  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00816799  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2049  acyl-CoA thioesterase II  49.12 
 
 		 292 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280365  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2964  acyl-CoA thioesterase  55.47 
 
 		 293 aa  232  6e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2137  acyl-CoA thioesterase II  48.23 
 
 		 288 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174647  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  47.02 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  46.84 
 
 		 286 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  46.84 
 
 		 286 aa  229  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  46.84 
 
 		 286 aa  229  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  46.84 
 
 		 286 aa  229  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  46.84 
 
 		 286 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  46.84 
 
 		 286 aa  229  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  46.84 
 
 		 286 aa  229  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  46.84 
 
 		 286 aa  229  4e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0920  acyl-CoA thioesterase II  45.99 
 
 		 286 aa  229  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  45.23 
 
 		 285 aa  229  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  46.99 
 
 		 286 aa  229  6e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0359  Choloyl-CoA hydrolase  47.87 
 
 		 292 aa  228  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3210  Choloyl-CoA hydrolase  44.83 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01450  acyl-CoA thioesterase II  44.53 
 
 		 286 aa  227  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4774  acyl-CoA thioesterase II  48.53 
 
 		 289 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4636  acyl-CoA thioesterase II  48.53 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147271  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09760  acyl-CoA thioesterase II  47.02 
 
 		 339 aa  226  3e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0658  acyl-CoA thioesterase II  48.33 
 
 		 289 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4762  acyl-CoA thioesterase II  48.16 
 
 		 289 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000102019  decreased coverage  0.000737933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12624  acyl-CoA thioesterase II tesB2  48.04 
 
 		 281 aa  226  4e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4660  acyl-CoA thioesterase II  45.23 
 
 		 289 aa  225  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3055  acyl-CoA thioesterase II  45.93 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3540  Palmitoyl-CoA hydrolase  49.12 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0567  acyl-CoA thioesterase II  46.1 
 
 		 286 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0514  acyl-CoA thioesterase II  46.1 
 
 		 286 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2850  palmitoyl-CoA hydrolase  49.16 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0524  acyl-CoA thioesterase II  46.1 
 
 		 286 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.602046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0505  acyl-CoA thioesterase II  46.1 
 
 		 286 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0264623  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2791  acyl-CoA thioesterase II  45.72 
 
 		 288 aa  223  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000176702  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0508  acyl-CoA thioesterase II  46.1 
 
 		 286 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004014  acyl-CoA thioesterase II  43.4 
 
 		 286 aa  222  4.9999999999999996e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0581  acyl-CoA thioesterase II  43.4 
 
 		 286 aa  219  5e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000605498  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1368  palmitoyl-CoA hydrolase  45.52 
 
 		 289 aa  218  6e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1670  acyl-CoA thioesterase II  44.03 
 
 		 287 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000026944  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1113  acyl-CoA thioesterase II  45.27 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.247123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3831  acyl-CoA thioesterase II  47.33 
 
 		 282 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146281 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2041  palmitoyl-CoA hydrolase  40.07 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2638  Palmitoyl-CoA hydrolase  44.37 
 
 		 288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  0.433426 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1005  acyl-CoA thioesterase II  45.72 
 
 		 287 aa  216  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.129501  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  42.64 
 
 		 287 aa  216  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1968  acyl-CoA thioesterase II  43.98 
 
 		 287 aa  215  7e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517331  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3210  acyl-CoA thioesterase II  43.98 
 
 		 288 aa  215  8e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00091585  unclonable  0.0000000140962 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>