More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3154 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3154  AsnC/Lrp family regulatory protein  100 
 
 
159 aa  311  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140742  normal  0.198737 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3379  AsnC family transcriptional regulator  91.19 
 
 
159 aa  286  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  61.15 
 
 
203 aa  180  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4086  putative transcriptional regulator, AsnC family  58.9 
 
 
169 aa  160  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.934568 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  53.59 
 
 
168 aa  159  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2850  AsnC family transcriptional regulator  51.39 
 
 
167 aa  147  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353617  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2562  transcriptional regulator, AsnC family  47.44 
 
 
167 aa  147  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  51.3 
 
 
171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12792  Lrp/Asn family transcriptional regulator  50.32 
 
 
179 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580591 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3944  AsnC family transcriptional regulator  50.69 
 
 
168 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134648  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  51.37 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  49.33 
 
 
180 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  49.33 
 
 
180 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 
180 aa  137  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  51.03 
 
 
171 aa  133  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8185  putative transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 
165 aa  128  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4274  transcriptional regulator, AsnC family  48.28 
 
 
153 aa  128  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365421  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  48.08 
 
 
169 aa  127  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3951  transcriptional regulator, AsnC family  42.47 
 
 
174 aa  125  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  47.22 
 
 
157 aa  124  7e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2171  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  45.75 
 
 
157 aa  120  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2159  transcriptional regulator, AsnC family  42.36 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.106753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6556  transcriptional regulator, AsnC family  46.85 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.604564  normal  0.177628 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0512  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 
165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4349  transcriptional regulator, AsnC family  44.37 
 
 
152 aa  110  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0499883  normal  0.877565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4327  transcriptional regulator, AsnC family  41.55 
 
 
154 aa  110  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4335  transcriptional regulator, AsnC family  40.14 
 
 
173 aa  110  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3254  transcriptional regulator, AsnC family  43.28 
 
 
134 aa  107  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2542  transcriptional regulator, AsnC family  40.28 
 
 
155 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.44011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.25 
 
 
150 aa  100  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 
160 aa  99.4  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7861  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 
150 aa  98.6  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0789573  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 
153 aa  97.4  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 
156 aa  97.1  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
150 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  38.93 
 
 
162 aa  96.3  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
164 aa  97.1  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  38.19 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 
157 aa  96.3  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  38.97 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 
150 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  36.71 
 
 
168 aa  95.9  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  37.06 
 
 
158 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0682  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 
169 aa  95.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2774  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 
150 aa  95.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.315931  normal  0.712036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2383  transcriptional regulator, AsnC family  39.1 
 
 
152 aa  95.5  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000319505  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3819  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 
155 aa  94.7  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3737  transcriptional regulator, AsnC family  40.85 
 
 
150 aa  94.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
158 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 
166 aa  95.1  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  37.58 
 
 
162 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  35.81 
 
 
161 aa  94.7  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 
166 aa  94.4  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 
155 aa  94.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  37.58 
 
 
162 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 
155 aa  94.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 
176 aa  94.4  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 
150 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 
155 aa  94.4  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
150 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 
154 aa  94  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3355  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 
150 aa  94  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417846  normal  0.0189646 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 
156 aa  94  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  35.81 
 
 
167 aa  94  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 
166 aa  93.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1897  AsnC family transcriptional regulator  34.76 
 
 
163 aa  92.8  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.129627 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  39.58 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  36.81 
 
 
157 aa  93.2  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 
166 aa  93.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  34.03 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  36.81 
 
 
155 aa  92.8  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  36.3 
 
 
155 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 
166 aa  92.8  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 
155 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  35.81 
 
 
175 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  34.03 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  35.14 
 
 
167 aa  92  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  35.81 
 
 
167 aa  92  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 
181 aa  91.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3138  transcriptional regulator AsnC family  35.14 
 
 
155 aa  92  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  35.81 
 
 
168 aa  91.7  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  35.81 
 
 
168 aa  91.7  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2190  leucine-responsive transcriptional regulator  35.81 
 
 
168 aa  91.7  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000625254  normal  0.0646213 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  35.81 
 
 
168 aa  91.7  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  35.81 
 
 
168 aa  91.3  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  40.31 
 
 
147 aa  91.3  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  36.81 
 
 
166 aa  91.3  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 
167 aa  91.3  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  38.36 
 
 
166 aa  91.3  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  35.81 
 
 
168 aa  91.3  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  35.81 
 
 
168 aa  91.3  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  35.81 
 
 
168 aa  91.3  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  35.14 
 
 
167 aa  91.3  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  35.81 
 
 
168 aa  91.3  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  36.81 
 
 
156 aa  90.9  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 
154 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2835  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 
172 aa  90.5  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242458  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 
152 aa  90.9  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  35.14 
 
 
167 aa  90.5  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  31.61 
 
 
158 aa  90.5  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>