More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3120 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3350  FAD linked oxidase domain-containing protein  91.01 
 
 		 536 aa  908    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0117199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  65.41 
 
 		 527 aa  665    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3120  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 535 aa  1066    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0913078  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1270  FAD linked oxidase-like  53.92 
 
 		 532 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  52.61 
 
 		 532 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1454  FAD linked oxidase domain protein  52.82 
 
 		 531 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  49.16 
 
 		 534 aa  501  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  50 
 
 		 534 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  53.9 
 
 		 546 aa  497  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  50.51 
 
 		 502 aa  478  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  39.29 
 
 		 529 aa  318  1e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  38.1 
 
 		 527 aa  310  4e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  39.31 
 
 		 525 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  39.31 
 
 		 525 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  39.31 
 
 		 525 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  38.77 
 
 		 532 aa  296  4e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  41.94 
 
 		 550 aa  285  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.21 
 
 		 572 aa  284  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  38.35 
 
 		 528 aa  282  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  36.1 
 
 		 527 aa  280  6e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  38.6 
 
 		 545 aa  280  7e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  35.12 
 
 		 552 aa  273  8.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  36.7 
 
 		 521 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  40.46 
 
 		 521 aa  268  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  31.89 
 
 		 554 aa  264  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  40.26 
 
 		 524 aa  264  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.17 
 
 		 518 aa  261  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.46 
 
 		 533 aa  260  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  29.48 
 
 		 563 aa  257  3e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  38.32 
 
 		 531 aa  257  4e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  33.51 
 
 		 584 aa  256  9e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.4 
 
 		 534 aa  250  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  32.3 
 
 		 556 aa  248  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.89 
 
 		 568 aa  240  5e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  37.27 
 
 		 540 aa  239  8e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.95 
 
 		 557 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  36.69 
 
 		 520 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  29.29 
 
 		 583 aa  227  5.0000000000000005e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  30.16 
 
 		 559 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  31.78 
 
 		 531 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  35.51 
 
 		 534 aa  218  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  30.94 
 
 		 531 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  30.76 
 
 		 538 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.86 
 
 		 531 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.88 
 
 		 565 aa  212  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  28.63 
 
 		 586 aa  204  3e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.07 
 
 		 579 aa  189  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  31.01 
 
 		 470 aa  177  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.87 
 
 		 564 aa  172  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  33.48 
 
 		 467 aa  170  7e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  27.29 
 
 		 554 aa  164  5.0000000000000005e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.22 
 
 		 520 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.8 
 
 		 510 aa  159  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  30.58 
 
 		 520 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.86 
 
 		 523 aa  156  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.22 
 
 		 516 aa  154  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.71 
 
 		 516 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  29.02 
 
 		 465 aa  153  8e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  31.6 
 
 		 572 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  28.41 
 
 		 513 aa  144  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  28.6 
 
 		 517 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  25.44 
 
 		 484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.48 
 
 		 457 aa  131  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2367  FAD linked oxidase domain protein  28.22 
 
 		 451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.5 
 
 		 470 aa  128  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5949  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.41 
 
 		 472 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00822967 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.83 
 
 		 470 aa  123  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.83 
 
 		 470 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  31.03 
 
 		 499 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  24.61 
 
 		 470 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  24.61 
 
 		 470 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1422  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.05 
 
 		 470 aa  121  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0816  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.72 
 
 		 477 aa  120  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.61 
 
 		 470 aa  120  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  31.51 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  24.38 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  24.61 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.38 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.61 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.61 
 
 		 470 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  29.2 
 
 		 473 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  28.26 
 
 		 461 aa  119  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.72 
 
 		 458 aa  118  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  26.8 
 
 		 459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  27.31 
 
 		 459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  26.71 
 
 		 459 aa  117  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0337  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  29.1 
 
 		 497 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  29.24 
 
 		 479 aa  116  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0419  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  29.1 
 
 		 497 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1377  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  29.1 
 
 		 497 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281382  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.39 
 
 		 460 aa  116  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0224  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  29.1 
 
 		 497 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00834249  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  27.07 
 
 		 459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.43 
 
 		 474 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0959  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  29.1 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.99 
 
 		 474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2526  FAD linked oxidase domain protein  28.06 
 
 		 457 aa  114  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  27.11 
 
 		 474 aa  114  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1787  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  28.88 
 
 		 497 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  26.54 
 
 		 472 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>