296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3094 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3094  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 
256 aa  495  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257113  normal  0.068745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3321  6-phosphogluconolactonase  92.19 
 
 
256 aa  417  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2417  6-phosphogluconolactonase  69.8 
 
 
257 aa  321  9.000000000000001e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.245714 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2007  6-phosphogluconolactonase  63.86 
 
 
261 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.750142  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6018  6-phosphogluconolactonase  56.92 
 
 
257 aa  276  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  0.688301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5191  6-phosphogluconolactonase  62.2 
 
 
259 aa  267  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.646883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2242  6-phosphogluconolactonase  59.13 
 
 
262 aa  263  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000337212 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1985  6-phosphogluconolactonase  62.55 
 
 
258 aa  255  5e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.446767  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1833  6-phosphogluconolactonase  51.54 
 
 
272 aa  246  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135882 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1645  6-phosphogluconolactonase  52.49 
 
 
265 aa  237  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0205292  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15930  6-phosphogluconolactonase  53.2 
 
 
260 aa  237  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2208  6-phosphogluconolactonase  63.64 
 
 
447 aa  228  8e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000925433  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2092  6-phosphogluconolactonase  50.76 
 
 
272 aa  227  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1122  6-phosphogluconolactonase  57.09 
 
 
254 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00568285 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1938  6-phosphogluconolactonase  56.63 
 
 
494 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340922  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2978  6-phosphogluconolactonase  51.41 
 
 
248 aa  215  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2536  6-phosphogluconolactonase  51.64 
 
 
241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2071  6-phosphogluconolactonase  53.47 
 
 
257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2926  6-phosphogluconolactonase  56.43 
 
 
249 aa  210  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11473  6-phosphogluconolactonase  49.6 
 
 
247 aa  205  6e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.821995 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19980  6-phosphogluconolactonase  49.8 
 
 
248 aa  203  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1260  6-phosphogluconolactonase  46.89 
 
 
249 aa  201  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0812543  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2257  6-phosphogluconolactonase  51.02 
 
 
251 aa  190  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000113878  normal  0.165396 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2053  6-phosphogluconolactonase  57.27 
 
 
271 aa  188  8e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2165  6-phosphogluconolactonase  49.59 
 
 
250 aa  184  8e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.238785  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1553  6-phosphogluconolactonase  52.57 
 
 
249 aa  180  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2526  6-phosphogluconolactonase  46.75 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2370  6-phosphogluconolactonase  48.61 
 
 
246 aa  171  9e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.610167  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2450  6-phosphogluconolactonase  45.31 
 
 
245 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2410  6-phosphogluconolactonase  45.31 
 
 
245 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2456  6-phosphogluconolactonase  45.31 
 
 
245 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213397  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3696  6-phosphogluconolactonase  49.74 
 
 
243 aa  155  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683981  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2716  6-phosphogluconolactonase  45.9 
 
 
244 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2618  6-phosphogluconolactonase  40.66 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3477  6-phosphogluconolactonase  39.52 
 
 
246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15240  6-phosphogluconolactonase  43.56 
 
 
571 aa  129  7.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.031101  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5038  6-phosphogluconolactonase  31.45 
 
 
239 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.25902 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0183  6-phosphogluconolactonase  33.85 
 
 
274 aa  128  8.000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2354  6-phosphogluconolactonase  38.21 
 
 
245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2720  6-phosphogluconolactonase  38.1 
 
 
252 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2251  6-phosphogluconolactonase  36.99 
 
 
248 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000880456  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1243  glucosamine-6-phosphate isomerase  30.88 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2814  6-phosphogluconolactonase  34.57 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4801  6-phosphogluconolactonase  34.84 
 
 
238 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.035982  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1481  6-phosphogluconolactonase  32.1 
 
 
236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.448023  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1455  6-phosphogluconolactonase  32.23 
 
 
236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0535  6-phosphogluconolactonase  31.25 
 
 
235 aa  119  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797573  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2709  6-phosphogluconolactonase  33.88 
 
 
238 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143593  hitchhiker  0.00000000228855 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0529  6-phosphogluconolactonase  37.38 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.77766  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  38.08 
 
 
429 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0053  6-phosphogluconolactonase  43.26 
 
 
242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1794  6-phosphogluconolactonase  37.5 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1348  6-phosphogluconolactonase  34.12 
 
 
242 aa  113  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0412  6-phosphogluconolactonase  33.74 
 
 
245 aa  113  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1131  6-phosphogluconolactonase  31.69 
 
 
248 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3673  6-phosphogluconolactonase  38.52 
 
 
242 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1522  6-phosphogluconolactonase  33.19 
 
 
240 aa  112  8.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0189067  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1273  6-phosphogluconolactonase  36.57 
 
 
245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169583  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4215  6-phosphogluconolactonase  31.14 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0227099  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5183  6-phosphogluconolactonase  30.61 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.908662  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3023  6-phosphogluconolactonase  32.63 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04030  6-phosphogluconolactonase, putative  31.03 
 
 
373 aa  109  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3477  6-phosphogluconolactonase  37.11 
 
 
248 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4158  6-phosphogluconolactonase  36.73 
 
 
246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105451  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1213  6-phosphogluconolactonase  35.86 
 
 
225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0456  6-phosphogluconolactonase  33.47 
 
 
241 aa  108  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.52308  normal  0.121254 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0923  6-phosphogluconolactonase, glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase  38.17 
 
 
232 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4692  6-phosphogluconolactonase  38.17 
 
 
233 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13160  6-phosphogluconolactonase  38.72 
 
 
257 aa  106  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2075  6-phosphogluconolactonase  32.68 
 
 
279 aa  105  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0919  6-phosphogluconolactonase  36.22 
 
 
235 aa  105  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1063  6-phosphogluconolactonase  36.22 
 
 
235 aa  105  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.301741  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2103  6-phosphogluconolactonase  33.73 
 
 
264 aa  105  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.22743  normal  0.146892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2698  6-phosphogluconolactonase  31.51 
 
 
241 aa  105  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1889  6-phosphogluconolactonase  36.18 
 
 
248 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2121  6-phosphogluconolactonase  35.22 
 
 
228 aa  103  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3272  6-phosphogluconolactonase  35.98 
 
 
235 aa  102  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2488  6-phosphogluconolactonase  34.35 
 
 
265 aa  102  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2753  6-phosphogluconolactonase  27.96 
 
 
244 aa  102  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1628  6-phosphogluconolactonase  32.89 
 
 
237 aa  102  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179566  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1324  6-phosphogluconolactonase  32.27 
 
 
271 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.307725  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2644  6-phosphogluconolactonase  35.22 
 
 
251 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00285  6-phosphogluconolactonase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02980)  31.56 
 
 
265 aa  99  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.757461 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1278  6-phosphogluconolactonase  34.27 
 
 
246 aa  99  7e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1482  6-phosphogluconolactonase  28.46 
 
 
241 aa  99  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000109648  normal  0.405401 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60598  Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  30.32 
 
 
317 aa  98.2  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.362445  normal  0.013578 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2420  6-phosphogluconolactonase  41.12 
 
 
243 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245998  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3178  6-phosphogluconolactonase  31.82 
 
 
245 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1905  6-phosphogluconolactonase  29.32 
 
 
277 aa  97.4  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0945  6-phosphogluconolactonase  30.99 
 
 
249 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36519  normal  0.244402 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2507  6-phosphogluconolactonase  40.65 
 
 
243 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2071  6-phosphogluconolactonase  35.43 
 
 
232 aa  96.3  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.834551  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1976  6-phosphogluconolactonase  38.1 
 
 
225 aa  95.9  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.731811 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0686  6-phosphogluconolactonase  28.84 
 
 
240 aa  95.9  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13316  predicted protein  34.52 
 
 
248 aa  95.9  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0957724 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003324  6-phosphogluconolactonase eukaryotic type  30.66 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0340  6-phosphogluconolactonase  30.08 
 
 
238 aa  94.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000175267  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1134  6-phosphogluconolactonase  25 
 
 
232 aa  93.2  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.488707  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6709  6-phosphogluconolactonase  37.04 
 
 
239 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.171628  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16881  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  34.42 
 
 
236 aa  92.4  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>