126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3085 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3085  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 326 aa  625  1e-178  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734948  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3312  cytochrome oxidase assembly  87.42 
 
 		 325 aa  485  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000656603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  53.29 
 
 		 325 aa  278  7e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2061  cytochrome oxidase assembly  55.29 
 
 		 309 aa  245  6.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.603923  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  51.86 
 
 		 337 aa  242  6e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2249  cytochrome oxidase assembly  50 
 
 		 386 aa  239  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165994 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2543  cytochrome oxidase assembly  54.64 
 
 		 305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0684946  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2099  cytochrome oxidase assembly  50.69 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1841  cytochrome oxidase assembly  52.26 
 
 		 314 aa  225  9e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355712 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1977  cytochrome oxidase assembly  48.33 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.628163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6009  hypothetical protein  46.47 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00257584  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  45.48 
 
 		 351 aa  206  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1133  cytochrome oxidase assembly  48.58 
 
 		 370 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2217  cytochrome oxidase assembly  49.64 
 
 		 351 aa  193  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000899528  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11450  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  44.44 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.314019  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1653  cytochrome oxidase assembly  46.46 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5168  cytochrome oxidase assembly  43.77 
 
 		 322 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251951  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  45.64 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2971  cytochrome oxidase assembly  43.91 
 
 		 370 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0193  cytochrome oxidase assembly  37.99 
 
 		 321 aa  177  3e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2347  cytochrome oxidase assembly  43.51 
 
 		 328 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0173507  normal  0.0130822 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16080  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  40.32 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  46.1 
 
 		 337 aa  172  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1995  putative integral membrane transport protein  41.06 
 
 		 351 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  45.98 
 
 		 313 aa  169  6e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2467  cytochrome oxidase assembly  46.72 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2474  cytochrome oxidase assembly  46.33 
 
 		 342 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1666  cytochrome oxidase assembly  39.82 
 
 		 348 aa  163  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00799414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3684  cytochrome oxidase assembly  45.12 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2429  cytochrome oxidase assembly  45.95 
 
 		 342 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2514  cytochrome oxidase assembly  41.97 
 
 		 326 aa  159  7e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787939  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1353  cytochrome oxidase assembly  42.76 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1135  cytochrome oxidase assembly  38.62 
 
 		 318 aa  156  4e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2553  cytochrome oxidase assembly  41.48 
 
 		 304 aa  152  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2726  cytochrome oxidase assembly  43.4 
 
 		 318 aa  145  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0568935  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14570  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  40.31 
 
 		 307 aa  139  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852831  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11484  antibiotic ABC transporter membrane protein  42.49 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.802636 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  32.83 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3264  cytochrome oxidase assembly  44.49 
 
 		 298 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  29.08 
 
 		 622 aa  67  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  30.94 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0296  cytochrome oxidase assembly  27.83 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300662  normal  0.0109948 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  28.95 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  29.02 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  29.02 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  25 
 
 		 341 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  27.88 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0069  cytochrome oxidase assembly  26.14 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  33.04 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  28.99 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  26.97 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  26.97 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  26.82 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  31.33 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  31.33 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  25.5 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  30.43 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  28.68 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  31.72 
 
 		 370 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  32.37 
 
 		 370 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  31.16 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  31.03 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  32.37 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  31.03 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  31.03 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  26.95 
 
 		 339 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  24.5 
 
 		 335 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  32.12 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05011  hypothetical protein  27.72 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.550155  normal  0.119353 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  30.94 
 
 		 370 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  31.16 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  30.34 
 
 		 369 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1778  hypothetical protein  27.17 
 
 		 308 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  30.34 
 
 		 369 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  30.34 
 
 		 369 aa  54.3  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  30.34 
 
 		 369 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  30.34 
 
 		 369 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  30.34 
 
 		 369 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  30.34 
 
 		 369 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  30.34 
 
 		 369 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  23.86 
 
 		 326 aa  53.9  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  29.33 
 
 		 396 aa  53.5  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  29.5 
 
 		 369 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  27.18 
 
 		 376 aa  52.8  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  28.36 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  29.22 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  28.99 
 
 		 399 aa  52  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0609  putative cytochrome c oxidase assembly protein  36.59 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.868245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  29.5 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  29.5 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0230  cytochrome oxidase assembly protein  30.34 
 
 		 353 aa  50.8  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  21.48 
 
 		 343 aa  51.2  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  26 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  29.63 
 
 		 383 aa  50.4  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  23.57 
 
 		 327 aa  50.1  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04451  hypothetical protein  28.35 
 
 		 288 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.898486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  28.67 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06441  hypothetical protein  31.11 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0836643 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  29.76 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  23.96 
 
 		 339 aa  49.3  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>