More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3056 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  49.45 
 
 		 3408 aa  802    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  40.2 
 
 		 1349 aa  677    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  51.01 
 
 		 3033 aa  868    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  100 
 
 		 2376 aa  4738    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11682  polyketide synthase pks9  40.27 
 
 		 1017 aa  650    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.910189  normal  0.256718 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  50.93 
 
 		 3463 aa  870    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  49.94 
 
 		 1584 aa  741    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  48.22 
 
 		 1593 aa  676    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  44.01 
 
 		 3400 aa  670    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  48.25 
 
 		 2108 aa  742    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  51.05 
 
 		 4575 aa  785    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  45.3 
 
 		 2719 aa  734    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  50.06 
 
 		 2066 aa  791    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  46.95 
 
 		 1924 aa  652    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  85.09 
 
 		 2374 aa  3961    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  50.9 
 
 		 3711 aa  859    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  53.17 
 
 		 4080 aa  924    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  52.19 
 
 		 7210 aa  937    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  47.29 
 
 		 2078 aa  702    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.31 
 
 		 7110 aa  915    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.12 
 
 		 2551 aa  691    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 		 1874 aa  690    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  34.7 
 
 		 1656 aa  763    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  44.61 
 
 		 1305 aa  745    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  39.94 
 
 		 1587 aa  699    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.35 
 
 		 5400 aa  943    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  44.17 
 
 		 1143 aa  719    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  51.18 
 
 		 2966 aa  749    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  40 
 
 		 1559 aa  669    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  46.36 
 
 		 4930 aa  744    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  51.14 
 
 		 1071 aa  858    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  36.95 
 
 		 3252 aa  645    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  42.21 
 
 		 1337 aa  661    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  45.98 
 
 		 1114 aa  719    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  50.39 
 
 		 5154 aa  1333    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  44.6 
 
 		 4607 aa  650    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  40.67 
 
 		 1402 aa  756    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  48.45 
 
 		 2081 aa  842    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  47.52 
 
 		 2090 aa  683    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  34.72 
 
 		 4165 aa  664    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  47.74 
 
 		 1601 aa  707    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.78 
 
 		 1559 aa  667    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  54.96 
 
 		 3494 aa  825    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  50.68 
 
 		 4882 aa  893    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  43.92 
 
 		 3693 aa  713    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  54.21 
 
 		 2060 aa  782    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.95 
 
 		 1837 aa  763    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.98 
 
 		 1349 aa  674    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.03 
 
 		 3092 aa  934    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  37.91 
 
 		 1087 aa  737    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  47.1 
 
 		 2024 aa  785    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  53.17 
 
 		 2367 aa  817    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  44.88 
 
 		 2020 aa  650    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  45.09 
 
 		 2277 aa  772    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  39.44 
 
 		 1354 aa  757    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  51.61 
 
 		 3670 aa  853    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  43.22 
 
 		 4264 aa  670    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  41.6 
 
 		 3130 aa  638    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  48.1 
 
 		 3449 aa  758    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  40.44 
 
 		 4478 aa  709    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  45.26 
 
 		 3508 aa  768    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  52.5 
 
 		 1548 aa  822    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  51.42 
 
 		 2126 aa  808    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  43.92 
 
 		 3693 aa  713    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  52.13 
 
 		 4151 aa  894    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  56.58 
 
 		 2113 aa  861    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  45.97 
 
 		 2846 aa  701    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  47.13 
 
 		 1126 aa  815    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  40.53 
 
 		 3176 aa  734    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  51.56 
 
 		 4840 aa  894    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  42.46 
 
 		 3676 aa  713    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  41.57 
 
 		 2477 aa  674    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  40.4 
 
 		 3696 aa  687    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.28 
 
 		 1816 aa  857    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  49.17 
 
 		 6768 aa  791    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  48.43 
 
 		 2847 aa  760    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  52.12 
 
 		 2107 aa  740    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  41.5 
 
 		 3645 aa  638    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  54.32 
 
 		 1602 aa  853    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  51.48 
 
 		 3158 aa  899    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  51.01 
 
 		 1101 aa  959    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  54.87 
 
 		 7279 aa  935    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  55.53 
 
 		 3254 aa  964    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  49.19 
 
 		 5255 aa  780    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  33.29 
 
 		 2762 aa  749    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  47.44 
 
 		 3493 aa  790    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  43.92 
 
 		 3702 aa  711    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  47.87 
 
 		 4111 aa  773    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  47.07 
 
 		 1820 aa  680    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  51.7 
 
 		 3148 aa  812    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  42.76 
 
 		 2880 aa  681    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  48.81 
 
 		 1831 aa  719    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  49.44 
 
 		 1789 aa  733    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  43.43 
 
 		 3281 aa  669    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  47.13 
 
 		 3930 aa  807    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  41.71 
 
 		 3679 aa  692    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.24 
 
 		 3874 aa  805    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  50 
 
 		 1955 aa  823    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  47.71 
 
 		 1867 aa  744    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  50.23 
 
 		 3355 aa  679    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>