35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3032 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3032  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 
359 aa  706    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.66002 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3258  phosphoesterase PA-phosphatase related  95.13 
 
 
340 aa  548  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4417  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.07 
 
 
388 aa  166  9e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.969405  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5537  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  41.2 
 
 
348 aa  163  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1262  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.82 
 
 
355 aa  155  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.832301  normal  0.653629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1001  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.17 
 
 
389 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.492463 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0991  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.17 
 
 
394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.393155 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1678  hypothetical protein  37.07 
 
 
319 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2273  phosphoesterase PA-phosphatase related  46.11 
 
 
300 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0064952  normal  0.143874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2406  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.45 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.111286  normal  0.403341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2245  hypothetical protein  29.55 
 
 
399 aa  66.2  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal  0.0195881 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1912  hypothetical protein  32.24 
 
 
276 aa  63.5  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0922  hypothetical protein  29.68 
 
 
329 aa  60.1  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1527  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  25.43 
 
 
311 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.266998 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3818  integral membrane protein  30.9 
 
 
315 aa  56.2  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.75139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1712  hypothetical protein  25.3 
 
 
324 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.514921  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0792  hypothetical protein  29.91 
 
 
260 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3731  hypothetical protein  32.74 
 
 
364 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0115  hypothetical protein  26.46 
 
 
394 aa  53.1  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1912  hypothetical protein  28.76 
 
 
334 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.225812  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2547  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.18 
 
 
251 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1738  hypothetical protein  35 
 
 
344 aa  48.9  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6439  putative RNA-binding protein  28.62 
 
 
419 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.351487  normal  0.0469485 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0185  hypothetical protein  33.6 
 
 
350 aa  48.1  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.918642  normal  0.0977063 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04991  Aureobasidin-resistance protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y744]  27.74 
 
 
439 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.229292 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08786  conserved hypothetical protein  27.71 
 
 
322 aa  47  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.616918 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3204  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.08 
 
 
350 aa  47  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.139548  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3339  hypothetical protein  23.37 
 
 
288 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.63236 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3724  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  28.96 
 
 
285 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16050  hypothetical protein  30.11 
 
 
379 aa  43.5  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5336  hypothetical protein  26.49 
 
 
216 aa  43.5  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78790  predicted protein  30.28 
 
 
405 aa  43.5  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.372401  normal  0.242751 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2536  hypothetical protein  34.85 
 
 
316 aa  43.5  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000813757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4087  hypothetical protein  33.33 
 
 
326 aa  42.7  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.354046 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0708  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.26 
 
 
208 aa  42.7  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>