68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2943 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2943  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  614  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000846327  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3164  hypothetical protein  87.7 
 
 
309 aa  552  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3288  hypothetical protein  62.3 
 
 
308 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350396  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4670  hypothetical protein  63.82 
 
 
297 aa  374  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610067  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3190  hypothetical protein  59.74 
 
 
324 aa  348  6e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525581 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2969  hypothetical protein  60.07 
 
 
324 aa  344  1e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4327  hypothetical protein  57.38 
 
 
319 aa  320  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2206  hypothetical protein  57.46 
 
 
336 aa  293  3e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3287  hypothetical protein  53.76 
 
 
322 aa  262  6.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0390  hypothetical protein  46.02 
 
 
318 aa  256  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.752733 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2084  hypothetical protein  44.44 
 
 
322 aa  242  5e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  35.34 
 
 
607 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  25 
 
 
543 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5886  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  33.57 
 
 
361 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.695825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1117  dienelactone hydrolase-like protein  25.7 
 
 
313 aa  62.8  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.218404  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  36.21 
 
 
568 aa  62.8  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  34.78 
 
 
342 aa  59.7  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1126  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.86 
 
 
350 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  34.19 
 
 
347 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1237  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.17 
 
 
350 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2163  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.08 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0271635  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  32.08 
 
 
526 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.64 
 
 
382 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  37.29 
 
 
345 aa  57.4  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  31.78 
 
 
546 aa  56.6  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  31.9 
 
 
551 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  31.3 
 
 
547 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  28.85 
 
 
338 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  33.04 
 
 
347 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  23.85 
 
 
565 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2227  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.25 
 
 
488 aa  53.5  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1079  hypothetical protein  24.45 
 
 
369 aa  53.1  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000122089  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  30.67 
 
 
298 aa  52.8  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  28.57 
 
 
567 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  33.05 
 
 
328 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  26.21 
 
 
567 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3459  carboxylic ester hydrolase  24.75 
 
 
456 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.675018  hitchhiker  1.26241e-19 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  27.59 
 
 
568 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1888  carboxylic ester hydrolase  29.12 
 
 
456 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  33.61 
 
 
365 aa  50.4  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  30.36 
 
 
572 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18539  predicted protein  29.87 
 
 
713 aa  50.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0118293  decreased coverage  0.000205789 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  28.47 
 
 
572 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  27.78 
 
 
569 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  32.43 
 
 
352 aa  49.7  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  23.36 
 
 
369 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1195  hypothetical protein  29.41 
 
 
289 aa  48.9  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0219721  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  24.19 
 
 
369 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30181  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.43 
 
 
505 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.157772 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  34.78 
 
 
300 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  24.47 
 
 
545 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2228  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.15 
 
 
406 aa  47.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  24.19 
 
 
605 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4221  hypothetical protein  30.22 
 
 
407 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  hitchhiker  0.00109479 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  27.07 
 
 
601 aa  46.6  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  24.62 
 
 
542 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  33.04 
 
 
337 aa  46.2  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  38.32 
 
 
372 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1192  hypothetical protein  32.19 
 
 
316 aa  45.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  34.78 
 
 
410 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  34.91 
 
 
374 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  30.33 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  30.33 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2690  hypothetical protein  31.94 
 
 
498 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165896  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  24.24 
 
 
600 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  24.24 
 
 
600 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  29.51 
 
 
318 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  26.92 
 
 
382 aa  42.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>