More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2886 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2886  response regulator receiver  100 
 
 
233 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2914  two component transcriptional regulator  95.71 
 
 
238 aa  417  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  63.36 
 
 
232 aa  279  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  53.98 
 
 
227 aa  241  6e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  52.1 
 
 
246 aa  238  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5196  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.2 
 
 
232 aa  238  5.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  55.95 
 
 
230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  55.95 
 
 
230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  55.95 
 
 
230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  55.02 
 
 
231 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  54.19 
 
 
230 aa  223  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.77 
 
 
229 aa  222  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  53.74 
 
 
231 aa  222  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.74 
 
 
228 aa  220  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.54 
 
 
238 aa  217  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  50.85 
 
 
237 aa  214  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1155  two component transcriptional regulator  51.07 
 
 
235 aa  211  9e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503115  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 
230 aa  206  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  48.93 
 
 
225 aa  202  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.29 
 
 
224 aa  201  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 
236 aa  201  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  47.35 
 
 
230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.19 
 
 
229 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  55.51 
 
 
228 aa  199  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  49.33 
 
 
257 aa  198  5e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 
243 aa  198  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 
243 aa  198  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 
243 aa  198  7e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 
248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  45.49 
 
 
225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.98 
 
 
227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 
236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0468  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.42 
 
 
223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 
244 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  50.66 
 
 
234 aa  195  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.69 
 
 
227 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 
228 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  47.81 
 
 
224 aa  193  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 
224 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  44.98 
 
 
236 aa  191  9e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.29 
 
 
225 aa  190  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5089  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 
242 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 
226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 
224 aa  189  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1564  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.77 
 
 
223 aa  189  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194978  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1247  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 
235 aa  189  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464606  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  47.75 
 
 
227 aa  188  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.9 
 
 
225 aa  188  7e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.26 
 
 
240 aa  188  8e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.3 
 
 
254 aa  187  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1744  two component transcriptional regulator  45.58 
 
 
231 aa  187  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.74 
 
 
228 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 
255 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  54.19 
 
 
229 aa  186  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5009  two component transcriptional regulator  45.58 
 
 
233 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284196  normal  0.882339 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4830  two component transcriptional regulator  46.48 
 
 
233 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.209649 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 
224 aa  186  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  46.46 
 
 
224 aa  186  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  47.19 
 
 
253 aa  185  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10921  two component system response transcriptional regulatory protein prrA  45.07 
 
 
236 aa  185  6e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4448  two component transcriptional regulator  46.01 
 
 
233 aa  184  9e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0130258  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4535  two component transcriptional regulator  46.01 
 
 
233 aa  184  9e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.636187 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 
223 aa  184  9e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.17 
 
 
224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.69 
 
 
244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 
224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  43.78 
 
 
235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.89 
 
 
227 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  45.53 
 
 
233 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  43.56 
 
 
224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 
228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.16 
 
 
223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.67 
 
 
273 aa  181  6e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 
224 aa  181  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0737  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 
224 aa  181  7e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  43.11 
 
 
236 aa  181  7e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 
235 aa  181  7e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  44 
 
 
239 aa  181  8.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 
239 aa  181  8.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  43.11 
 
 
224 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 
248 aa  181  9.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.42 
 
 
243 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 
223 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.86 
 
 
225 aa  180  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3904  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.85 
 
 
230 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144495  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.96 
 
 
241 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 
224 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  43.17 
 
 
241 aa  180  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 
223 aa  180  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  45.96 
 
 
248 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  44 
 
 
252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 
242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  41.85 
 
 
230 aa  179  4e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  45.11 
 
 
248 aa  179  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0188  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 
245 aa  179  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00347389  normal  0.0545477 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  43.42 
 
 
242 aa  179  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 
224 aa  179  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0717  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 
242 aa  178  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44 
 
 
271 aa  178  5.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>