More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2859 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2859  ferric-uptake regulator  100 
 
 		 140 aa  285  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.141734 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0734  ferric uptake regulator, Fur family  38.52 
 
 		 123 aa  87  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  36.15 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  38.84 
 
 		 135 aa  84  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  39.52 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3230  ferric uptake regulator, Fur family  36.8 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0854036  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  28.46 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2340  ferric uptake regulator family protein  38.02 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2717  ferric uptake regulator family protein  37.4 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  37.5 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  34.15 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  38.71 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  34.15 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1261  ferric uptake regulator, Fur family  38.41 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  34.15 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  37.19 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0856  zinc uptake regulator  38.21 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.763265  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  35.2 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  35.2 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3150  ferric-uptake regulator  35.43 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13670  zinc uptake regulator, Fur family  37.6 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1179  Fur family ferric uptake regulator  37.4 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.462177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  31.54 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1194  ferric-uptake regulator  35.86 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  36.29 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3007  ferric uptake regulator, Fur family  31.82 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  37.59 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  28.15 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  35.34 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0524  ferric uptake regulator family protein  38.81 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  35.34 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1315  transcriptional regulator, TrmB  33.59 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0518  ferric uptake regulator, Fur family  39.55 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  33.85 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0618  ferric uptake regulator family protein  38.06 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  34.09 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  33.07 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1120  FUR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.224553  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0066  ferric uptake regulator, Fur family  35.77 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0637  ferric uptake regulator family protein  33.1 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.835222  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  27.21 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  31.2 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1040  transcriptional regulator, Fur family  32.5 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  30.15 
 
 		 152 aa  70.1  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  32.03 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  32.09 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17451  ferric uptake regulator family protein  33.07 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.949789 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1481  ferric uptake regulator family protein  35.11 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.268678  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0918  ferric uptake regulator  34.88 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2085  zinc uptake regulator  36.8 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0493  ferric-uptake regulator  37.9 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06931  ferric uptake regulator family protein  33.1 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.247961  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11800  zinc uptake regulator, Fur family  32.79 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00894406  normal  0.765019 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0184  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.567959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06641  ferric uptake regulator family protein  33.1 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  33.59 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  33.59 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0077  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  32.39 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2730  ferric uptake regulator family protein  35.77 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  29.85 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07800  zinc uptake regulator, Fur family  33.81 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0489  ferric uptake regulator family protein  37.96 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.574052  normal  0.122535 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7263  ferric uptake regulator family protein  32.82 
 
 		 175 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7037  ferric uptake regulator, Fur family  36.07 
 
 		 150 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2612  ferric uptake regulator, Fur family  30.88 
 
 		 146 aa  66.6  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1373  ferric uptake regulator, Fur family  28.68 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000536701  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1772  ferric uptake regulator, Fur family  35.54 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2373  ferric uptake regulator, Fur family  33.88 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000416204 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07031  ferric uptake regulator family protein  32.39 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0821588  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  35.43 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2661  ferric uptake regulator family protein  34.56 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.946961  normal  0.0414019 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2152  ferric uptake regulator  30.83 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5708  ferric uptake regulator, Fur family  35.94 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0515  ferric uptake regulator, Fur family  29.63 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  31.2 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  32.56 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  31.2 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3240  ferric uptake regulator family protein  31.01 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000230922  hitchhiker  0.00191408 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  27.61 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0319  zinc uptake regulator ZUR  36.09 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  34.68 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1775  ferric uptake regulator family protein  34.65 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.103697  normal  0.0302993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2638  zinc uptake regulator  33.06 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3651  ferric uptake regulator, Fur family  37.62 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  27.82 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1593  ferric uptake regulator  30.23 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000083166  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1646  ferric-uptake regulator  25.93 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0347  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1612  ferric uptake regulator family protein  25.93 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.339502  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  31.01 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  31.25 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0473  Fur family ferric uptake regulator  34.88 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1211  ferric uptake regulation protein  29.32 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0179394  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3018  ferric uptake regulator, Fur family  33.58 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0481144  normal  0.294593 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  31.01 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  31.01 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  27.82 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07451  ferric uptake regulator family protein  29.63 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0979772 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  34.74 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  31.01 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>