More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2808 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  100 
 
 
275 aa  553  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  41.73 
 
 
282 aa  217  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  40.53 
 
 
278 aa  215  7e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  44.93 
 
 
261 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  35.99 
 
 
287 aa  158  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
279 aa  149  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  36.19 
 
 
274 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2147  methyltransferase type 11  29.81 
 
 
283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  39.52 
 
 
271 aa  145  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  38.94 
 
 
276 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  35.43 
 
 
382 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.86 
 
 
280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30710  predicted protein  31.84 
 
 
365 aa  118  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  36.9 
 
 
284 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  35 
 
 
283 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  29.18 
 
 
318 aa  112  7.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  35 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  35.27 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  38.85 
 
 
392 aa  110  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  33.5 
 
 
377 aa  110  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  33.92 
 
 
293 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  34.29 
 
 
304 aa  109  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  34.59 
 
 
280 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  35.75 
 
 
274 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 
286 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  36.57 
 
 
306 aa  102  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3261  SAM-dependent methyltransferase  31.67 
 
 
287 aa  102  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234445  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  35.95 
 
 
311 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.5 
 
 
305 aa  100  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  33.33 
 
 
342 aa  98.2  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4388  methyltransferase type 11  27.14 
 
 
267 aa  96.7  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0989044  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  36.18 
 
 
311 aa  97.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  31.67 
 
 
343 aa  95.1  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  27.93 
 
 
377 aa  95.1  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  23.64 
 
 
280 aa  94  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.9 
 
 
282 aa  93.6  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  36.18 
 
 
311 aa  93.6  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  30.81 
 
 
276 aa  92.8  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2958  hypothetical protein  32.72 
 
 
278 aa  92.8  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
328 aa  91.3  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  34.64 
 
 
309 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
286 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  34.87 
 
 
310 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  35.47 
 
 
304 aa  90.5  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.34 
 
 
330 aa  90.1  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3068  Methyltransferase type 12  33.86 
 
 
288 aa  89.4  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42420  predicted protein  28.3 
 
 
317 aa  87.4  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.679564 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  32.89 
 
 
310 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 
328 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  33.17 
 
 
310 aa  86.7  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  27.56 
 
 
274 aa  86.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  32.24 
 
 
310 aa  86.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  34.62 
 
 
295 aa  85.5  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.27 
 
 
273 aa  85.5  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  35.67 
 
 
310 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10269  predicted protein  35.91 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  42.86 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 
1012 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  41.53 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  26.46 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  32.22 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0668  Methyltransferase type 11  42.24 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0464  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.77 
 
 
421 aa  80.1  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  26.56 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4594  Methyltransferase type 11  33.71 
 
 
271 aa  79.3  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.94 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  33.33 
 
 
387 aa  78.2  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  33.53 
 
 
304 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1353  Methyltransferase type 11  35.98 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0337053  hitchhiker  0.000000492717 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1559  hypothetical protein  41.35 
 
 
208 aa  78.2  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00538046  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  30.46 
 
 
301 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.28 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0746  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.91 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  33.54 
 
 
295 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  28.93 
 
 
559 aa  77  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.5 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4209  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  32.35 
 
 
266 aa  77  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 
284 aa  77  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  29.29 
 
 
776 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0597  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  32.17 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.369183  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  27.1 
 
 
277 aa  75.9  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1677  methyltransferase type 11  24.7 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5273  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.12 
 
 
418 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5365  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.12 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.552994  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00562  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.04 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.6 
 
 
230 aa  75.1  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0981  methyltransferase type 11  51.82 
 
 
229 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.37 
 
 
251 aa  75.5  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.205211 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5415  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.57 
 
 
394 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.424397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 
572 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  39.66 
 
 
225 aa  75.1  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  30.42 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2136  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.13 
 
 
457 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000408941 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
234 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001927  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE/COQ5  30.37 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5006  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.65 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.20351 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  35.37 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  30.47 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2160  putative cyclopropane fatty acid synthase  32.75 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2700  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  30.07 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>