More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2804 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 464 aa  917    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  43.11 
 
 		 457 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  45.43 
 
 		 462 aa  334  2e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  46.36 
 
 		 462 aa  333  4e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  44.81 
 
 		 456 aa  331  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  44.81 
 
 		 456 aa  331  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  45.15 
 
 		 472 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  44.49 
 
 		 462 aa  326  6e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  42.92 
 
 		 472 aa  326  7e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  44.47 
 
 		 456 aa  322  7e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  42.3 
 
 		 463 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  44.14 
 
 		 473 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  43.09 
 
 		 474 aa  312  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  44.37 
 
 		 466 aa  311  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  42.07 
 
 		 480 aa  310  4e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  44.2 
 
 		 466 aa  310  5e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  43.93 
 
 		 454 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  42.35 
 
 		 482 aa  299  5e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  42.56 
 
 		 465 aa  297  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  43.68 
 
 		 460 aa  294  3e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  38.6 
 
 		 460 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  42.76 
 
 		 460 aa  279  6e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  42.52 
 
 		 460 aa  279  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  42.17 
 
 		 460 aa  279  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  40.84 
 
 		 460 aa  276  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  38.39 
 
 		 466 aa  260  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  36.62 
 
 		 469 aa  256  5e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19770  hypothetical protein  40.67 
 
 		 468 aa  256  6e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1702  hypothetical protein  40.41 
 
 		 468 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  39.28 
 
 		 468 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  39.5 
 
 		 475 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  38.86 
 
 		 476 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  38.86 
 
 		 468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  40.68 
 
 		 475 aa  244  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2675  FAD dependent oxidoreductase  37.56 
 
 		 468 aa  242  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3143  FAD dependent oxidoreductase  35 
 
 		 491 aa  225  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0699  FAD dependent oxidoreductase  37.38 
 
 		 456 aa  220  5e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0879  FAD dependent oxidoreductase  34.03 
 
 		 491 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3244  FAD dependent oxidoreductase  34.03 
 
 		 491 aa  218  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3678  hypothetical protein  33.12 
 
 		 489 aa  193  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  33.55 
 
 		 463 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  36.19 
 
 		 464 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  34 
 
 		 463 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  33.64 
 
 		 463 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  33.77 
 
 		 463 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2910  hypothetical protein  36.57 
 
 		 493 aa  187  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  32.19 
 
 		 463 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  32.8 
 
 		 464 aa  184  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  31.91 
 
 		 473 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  30.22 
 
 		 464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  33.56 
 
 		 465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  33.56 
 
 		 465 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 472 aa  179  8e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 		 468 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  31.13 
 
 		 443 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 		 468 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 		 477 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  30.13 
 
 		 491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  31.98 
 
 		 480 aa  174  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  30.09 
 
 		 462 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 		 521 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  31.1 
 
 		 471 aa  172  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  29.86 
 
 		 462 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  30.32 
 
 		 462 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 		 462 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  30.84 
 
 		 459 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  30.14 
 
 		 462 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  29.19 
 
 		 465 aa  167  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0889  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 		 487 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 		 457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 		 496 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  30.55 
 
 		 486 aa  162  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 		 470 aa  162  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 483 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  33.63 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 		 473 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2277  FAD dependent oxidoreductase  29.8 
 
 		 486 aa  155  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  31.49 
 
 		 435 aa  154  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  28.71 
 
 		 470 aa  153  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 		 463 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5122  FAD dependent oxidoreductase  32.75 
 
 		 460 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 		 427 aa  151  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  32.52 
 
 		 432 aa  149  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 		 463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  30.72 
 
 		 477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 428 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  29.59 
 
 		 466 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 425 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  31.93 
 
 		 434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6151  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 		 445 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 432 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  28.08 
 
 		 466 aa  136  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2005  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 443 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.343798  normal  0.360324 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1509  putative FAD dependent oxidoreductase  30.64 
 
 		 445 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166671  normal  0.147012 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2389  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 446 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.986344 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04889  FAD dependent oxidoreductase  28.26 
 
 		 466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  27.27 
 
 		 482 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 		 442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2235  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 447 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.622258  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>